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Lista de obras de David Holcman

A mechanism for the polarity formation of chemoreceptors at the growth cone membrane for gradient amplification during directional sensing

artículo científico publicado en 2010

Advances Using Single-Particle Trajectories to Reconstruct Chromatin Organization and Dynamics

artículo científico publicado en 2019

Alpha rhythm collapse predicts iso-electric suppressions during anesthesia

artículo científico publicado en 2019

Analysis and Interpretation of Superresolution Single-Particle Trajectories

artículo científico publicado en 2015

Analysis of Single Locus Trajectories for Extracting In Vivo Chromatin Tethering Interactions

artículo científico publicado en 2015

Astroglial networks scale synaptic activity and plasticity.

artículo científico publicado en 2011

Astroglial networks: a step further in neuroglial and gliovascular interactions.

artículo científico publicado en 2010

Barriers to diffusion in dendrites and estimation of calcium spread following synaptic inputs

artículo científico publicado en 2011

Brownian needle in dire straits: stochastic motion of a rod in very confined narrow domains.

artículo científico publicado en 2012

Bursting reverberation as a multiscale neuronal network process driven by synaptic depression-facilitation

artículo científico publicado en 2015

Calcium dynamics in dendritic spines and spine motility.

artículo científico publicado en 2004

Calcium dynamics in dendritic spines, modeling and experiments.

artículo científico publicado en 2005

Computational and mathematical methods for morphogenetic gradient analysis, boundary formation and axonal targeting

artículo científico

Computing the length of the shortest telomere in the nucleus.

artículo científico publicado en 2013

Connexin 30 sets synaptic strength by controlling astroglial synapse invasion

artículo científico publicado en 2014

Control of flux by narrow passages and hidden targets in cellular biology.

artículo científico

Deconvolution of Voltage Sensor Time Series and Electro-diffusion Modeling Reveal the Role of Spine Geometry in Controlling Synaptic Strength

artículo científico publicado en 2018

Detection of single photons by toad and mouse rods.

artículo científico publicado en 2013

Diffusing polymers in confined microdomains and estimation of chromosomal territory sizes from chromosome capture data.

artículo científico publicado en 2013

Diffusion in a dendritic spine: the role of geometry.

artículo científico publicado en 2007

Diffusion in narrow domains and application to phototransduction

artículo científico publicado en 2009

Dissection of a Krox20 positive feedback loop driving cell fate choices in hindbrain patterning

artículo científico publicado en 2013

Do cells sense time by number of divisions?

artículo científico publicado en 2018

Dwell time of a Brownian molecule in a microdomain with traps and a small hole on the boundary.

artículo científico publicado en 2007

Dynamic regulation of spine-dendrite coupling in cultured hippocampal neurons.

artículo científico publicado en 2004

Electrical transient laws in neuronal microdomains based on electro-diffusion

artículo científico publicado en 2018

Electrostatics of non-neutral biological microdomains.

artículo científico publicado en 2017

Emergence and fragmentation of the alpha-band driven by neuronal network dynamics

artículo científico publicado en 2021

Encounter dynamics of a small target by a polymer diffusing in a confined domain.

artículo científico publicado en 2012

Engrailed homeoprotein recruits the adenosine A1 receptor to potentiate ephrin A5 function in retinal growth cones.

artículo científico publicado en 2012

Estimating the Synaptic Current in a Multiconductance AMPA Receptor Model ⬇️

artículo científico publicado el 17 de agosto de 2011

Estimating the rate constant of cyclic GMP hydrolysis by activated phosphodiesterase in photoreceptors.

artículo científico publicado en 2008

Extreme escape from a cusp: When does geometry matter for the fastest Brownian particles moving in crowded cellular environments?

artículo científico publicado en 2020

Fast calcium transients in dendritic spines driven by extreme statistics

scientific article published on 04 June 2019

Fast calcium transients in neuronal spines driven by extreme statistics

Fastest among equals: a novel paradigm in biology: Reply to comments: Redundancy principle and the role of extreme statistics in molecular and cellular biology

scientific article published on 01 March 2019

Gated narrow escape time for molecular signaling.

artículo científico publicado en 2009

Histone degradation in response to DNA damage enhances chromatin dynamics and recombination rates.

artículo científico publicado en 2017

How rods respond to single photons: Key adaptations of a G-protein cascade that enable vision at the physical limit of perception

artículo científico publicado en 2015

Hybrid Markov-mass action law model for cell activation by rare binding events: Application to calcium induced vesicular release at neuronal synapses

artículo científico publicado en 2016

Kinetics of aggregation with a finite number of particles and application to viral capsid assembly.

artículo científico publicado en 2014

Longitudinal diffusion in retinal rod and cone outer segment cytoplasm: the consequence of cell structure.

artículo científico publicado en 2004

Mixed analytical-stochastic simulation method for the recovery of a Brownian gradient source from probability fluxes to small windows

artículo científico publicado en 2018

Modeling the spontaneous activity of the auditory cortex.

artículo científico publicado en 2005

Modeling the step of endosomal escape during cell infection by a nonenveloped virus

artículo científico publicado en 2012

Modeling the voltage distribution in a non-locally but globally electroneutral confined electrolyte medium: applications for nanophysiology

artículo científico publicado en 2021

Monitoring and predicting SARS-CoV-2 epidemic in France after deconfinement using a multiscale age-stratified rate model

artículo científico publicado en 2020

Narrow escape for a stochastically gated Brownian ligand ⬇️

artículo científico publicado el 22 de enero de 2010

Narrow escape through a funnel and effective diffusion on a crowded membrane.

artículo científico publicado en 2011

Narrow escape time to a structured target located on the boundary of a microdomain

artículo científico publicado en 2009

Oscillatory decay of the survival probability of activated diffusion across a limit cycle.

artículo científico publicado en 2014

Physical principles and models describing intracellular virus particle dynamics.

scientific article published on 14 July 2009

Polymer model with long-range interactions: analysis and applications to the chromatin structure.

artículo científico publicado en 2013

Post-transcriptional regulation in the nucleus and cytoplasm: study of mean time to threshold (MTT) and narrow escape problem.

artículo científico publicado en 2014

Quantifying intermittent transport in cell cytoplasm.

artículo científico publicado en 2008

Quantifying neurite growth mediated by interactions among secretory vesicles, microtubules, and actin networks.

artículo científico publicado en 2009

Quantitative analysis of virus and plasmid trafficking in cells.

artículo científico publicado en 2009

Reconstructing the gradient source position from steady-state fluxes to small receptors.

artículo científico publicado en 2018

Recovering a stochastic process from super-resolution noisy ensembles of single-particle trajectories ⬇️

artículo científico publicado en 2015

Redundancy principle and the role of extreme statistics in molecular and cellular biology

artículo científico publicado en 2019

Reply to 'Only negligible deviations from electroneutrality are expected in dendritic spines'

artículo científico publicado en 2019

Residence times of receptors in dendritic spines analyzed by stochastic simulations in empirical domains. ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Robust network oscillations during mammalian respiratory rhythm generation driven by synaptic dynamics

artículo científico publicado en 2015

Search for a small egg by spermatozoa in restricted geometries

scientific article published on 26 December 2015

Single particle trajectories reveal active endoplasmic reticulum luminal flow

artículo científico publicado en 2018

Spatial telomere organization and clustering in yeast Saccharomyces cerevisiae nucleus is generated by a random dynamics of aggregation-dissociation

artículo científico publicado en 2013

Statistics of chromatin organization during cell differentiation revealed by heterogeneous cross-linked polymers

artículo científico publicado en 2019

Statistics of randomly cross-linked polymer models to interpret chromatin conformation capture data

artículo científico publicado en 2017

Steady-state voltage distribution in three-dimensional cusp-shaped funnels modeled by PNP

scientific article published on 09 April 2019

Stochastic chemical reactions in microdomains.

artículo científico publicado en 2005

Stochastic modeling of gene activation and applications to cell regulation.

artículo científico publicado en 2010

Structural Fluctuations of the Chromatin Fiber within Topologically Associating Domains

artículo científico publicado en 2016

Synapse geometry and receptor dynamics modulate synaptic strength

artículo científico publicado en 2011

Synaptic dynamics and neuronal network connectivity are reflected in the distribution of times in Up states

artículo científico publicado en 2015

Syntaxin1A Lateral Diffusion Reveals Transient and Local SNARE Interactions

scientific article published on 01 November 2011

The WQN algorithm to adaptively correct artifacts in the EEG signal

artículo científico publicado en 2022

The dynamics of phosphodiesterase activation in rods and cones

artículo científico publicado en 2007

The emergence of Up and Down states in cortical networks

artículo científico publicado en 2006

The narrow escape problem for diffusion in cellular microdomains

artículo científico publicado en 2007

The neuroglial potassium cycle during neurotransmission: role of Kir4.1 channels

artículo científico publicado en 2015

The new nanophysiology: regulation of ionic flow in neuronal subcompartments.

artículo científico

Threshold activation for stochastic chemical reactions in microdomains.

artículo científico publicado en 2010

Transcription factor search for a DNA promoter in a three-state model ⬇️

artículo científico publicado el 8 de agosto de 2011

Transient chromatin properties revealed by polymer models and stochastic simulations constructed from Chromosomal Capture data

artículo científico publicado en 2017

Two loci single particle trajectories analysis: constructing a first passage time statistics of local chromatin exploration.

artículo científico publicado en 2017

Unraveling novel features hidden in superresolution microscopy data.

artículo científico publicado en 2013

Using default constraints of the spindle assembly checkpoint to estimate the associated chemical rates ⬇️

artículo científico publicado el 19 de enero de 2012

Visualization of Chromatin Decompaction and Break Site Extrusion as Predicted by Statistical Polymer Modeling of Single-Locus Trajectories.

artículo científico publicado en 2017

Why so many sperm cells?

artículo científico publicado en 2015

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