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Lista de obras de Tyson A Clark

A biphasic epigenetic switch controls immunoevasion, virulence and niche adaptation in non-typeable Haemophilus influenzae

artículo científico publicado en 2015

A comparative analysis of methylome profiles of Campylobacter jejuni sheep abortion isolate and gastroenteric strains using PacBio data.

artículo científico publicado en 2014

A genome-wide approach to identify genetic variants that contribute to etoposide-induced cytotoxicity.

artículo científico publicado en 2007

A random six-phase switch regulates pneumococcal virulence via global epigenetic changes

artículo científico publicado en 2014

ANOSVA: a statistical method for detecting splice variation from expression data

artículo científico publicado en 2005

Aberrant alternative splicing and extracellular matrix gene expression in mouse models of myotonic dystrophy.

artículo científico publicado en 2010

Affy exon tissues: exon levels in normal tissues in human, mouse and rat.

scientific article published on July 2009

Alternative pre-mRNA splicing switches modulate gene expression in late erythropoiesis.

artículo científico publicado en 2009

Alternative splicing and differential gene expression in colon cancer detected by a whole genome exon array.

artículo científico publicado en 2006

Alternative splicing regulates mouse embryonic stem cell pluripotency and differentiation

artículo científico publicado en 2010

Analysis of alternative splicing associated with aging and neurodegeneration in the human brain.

artículo científico publicado en 2011

Androgen Receptor Variant AR-V9 Is Coexpressed with AR-V7 in Prostate Cancer Metastases and Predicts Abiraterone Resistance.

artículo científico publicado en 2017

Characterization of DNA methyltransferase specificities using single-molecule, real-time DNA sequencing

artículo científico publicado en 2011

Characterization of fusion genes and the significantly expressed fusion isoforms in breast cancer by hybrid sequencing.

artículo científico publicado en 2015

Comparative Genomics Reveals the Diversity of Restriction-Modification Systems and DNA Methylation Sites in Listeria monocytogenes

artículo científico publicado en 2016

Comparative genomics of enterohemorrhagic Escherichia coli O145:H28 demonstrates a common evolutionary lineage with Escherichia coli O157:H7

scientific article published on 10 January 2014

Complete Genome Sequence Analysis of Bacillus subtilis T30.

artículo científico publicado en 2015

Complete Genome Sequence of Moraxella catarrhalis Strain CCRI-195ME, Isolated from the Middle Ear.

artículo científico publicado en 2017

Complete Genome Sequences of Two Escherichia coli O145:H28 Outbreak Strains of Food Origin.

artículo científico publicado en 2014

Covalent Modification of Bacteriophage T4 DNA Inhibits CRISPR-Cas9.

artículo científico publicado en 2015

DNA Methylation Assessed by SMRT Sequencing Is Linked to Mutations in Neisseria meningitidis Isolates.

artículo científico publicado en 2015

Defining the sequence requirements for the positioning of base J in DNA using SMRT sequencing.

artículo científico publicado en 2015

Detecting DNA modifications from SMRT sequencing data by modeling sequence context dependence of polymerase kinetic

artículo científico publicado en 2013

Detection and measurement of alternative splicing using splicing-sensitive microarrays.

artículo científico publicado en 2005

Direct detection and sequencing of damaged DNA bases

artículo científico publicado en 2011

Discovery of tissue-specific exons using comprehensive human exon microarrays

artículo científico publicado en 2007

Enhanced 5-methylcytosine detection in single-molecule, real-time sequencing via Tet1 oxidation

artículo científico publicado en 2013

Evaluation of genetic variation contributing to differences in gene expression between populations

artículo científico publicado en 2008

Exploring functional relationships between components of the gene expression machinery.

artículo científico publicado en 2005

Genetic Stabilization of the Drug-Resistant PMEN1 Pneumococcus Lineage by Its Distinctive DpnIII Restriction-Modification System

artículo científico publicado en 2015

Genome-wide mapping of methylated adenine residues in pathogenic Escherichia coli using single-molecule real-time sequencing

artículo científico publicado en 2012

Genome-wide methylation patterns in Salmonella enterica Subsp. enterica Serovars

artículo científico publicado en 2015

Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences

artículo científico publicado en 2014

Global methylation state at base-pair resolution of the Caulobacter genome throughout the cell cycle

artículo científico publicado en 2013

HITS-CLIP yields genome-wide insights into brain alternative RNA processing

artículo científico publicado en 2008

Heritability of alternative splicing in the human genome

artículo científico publicado en 2007

Human transcriptome array for high-throughput clinical studies.

artículo científico publicado en 2011

Identification of common genetic variants that account for transcript isoform variation between human populations.

artículo científico publicado en 2008

Identification of genetic variants contributing to cisplatin-induced cytotoxicity by use of a genomewide approach

artículo científico publicado en 2007

Identification of restriction-modification systems of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 by SMRT sequencing and associated methylome analysis

artículo científico publicado en 2014

Methods for Genome-Wide Methylome Profiling of Campylobacter jejuni.

artículo científico publicado en 2017

Methylomic and phenotypic analysis of the ModH5 phasevarion of Helicobacter pylori

artículo científico publicado en 2017

ModM DNA methyltransferase methylome analysis reveals a potential role for Moraxella catarrhalis phasevarions in otitis media.

artículo científico publicado en 2014

Modeling kinetic rate variation in third generation DNA sequencing data to detect putative modifications to DNA bases

artículo científico publicado en 2012

Nova regulates brain-specific splicing to shape the synapse

artículo científico publicado en 2005

Novel m4C modification in type I restriction-modification systems

artículo científico publicado en 2016

Position-dependent alternative splicing activity revealed by global profiling of alternative splicing events regulated by PTB.

artículo científico publicado en 2010

RNAmotifs: prediction of multivalent RNA motifs that control alternative splicing

artículo científico publicado en 2014

Removal of a single alpha-tubulin gene intron suppresses cell cycle arrest phenotypes of splicing factor mutations in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2002

SMRT-Cappable-seq reveals complex operon variants in bacteria

scientific article published in Nature Communications

Sensitive and specific single-molecule sequencing of 5-hydroxymethylcytosine.

artículo científico publicado en 2011

Simultaneous sequencing of oxidized methylcytosines produced by TET/JBP dioxygenases in Coprinopsis cinerea

artículo científico publicado en 2014

Specificity of the ModA11, ModA12 and ModD1 epigenetic regulator N(6)-adenine DNA methyltransferases of Neisseria meningitidis.

artículo científico publicado en 2015

The Epigenomic Landscape of Prokaryotes

artículo científico publicado en 2016

The methylomes of six bacteria

artículo científico publicado en 2012

The methylomes of six bacteria

Ultraconserved elements are associated with homeostatic control of splicing regulators by alternative splicing and nonsense-mediated decay

artículo científico publicado en 2007

Unusual intron conservation near tissue-regulated exons found by splicing microarrays

artículo científico publicado en 2006

Unveiling the complexity of the maize transcriptome by single-molecule long-read sequencing

artículo científico publicado en 2016

Whole-genome assembly of Klebsiella pneumoniae coproducing NDM-1 and OXA-232 carbapenemases using single-molecule, real-time sequencing.

artículo científico publicado en 2014

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