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Lista de obras de Paul Czodrowski

2,8-Disubstituted-1,6-Naphthyridines and 4,6-Disubstituted-Isoquinolines with Potent, Selective Affinity for CDK8/19.

artículo científico publicado en 2016

A selective chemical probe for exploring the role of CDK8 and CDK19 in human disease.

artículo científico publicado en 2015

Applications of machine learning in drug discovery and development

artículo científico publicado en 2019

Atypical protonation states in the active site of HIV-1 protease: a computational study

scientific article published on 16 May 2007

Binding Pose Flip Explained via Enthalpic and Entropic Contributions.

artículo científico publicado en 2017

Blind, one‐eyed, or eagle‐eyed? pKa calculations during blind predictions with staphylococcal nuclease ⬇️

artículo científico publicado el 23 de agosto de 2011

Chasing protons: how isothermal titration calorimetry, mutagenesis, and pKa calculations trace the locus of charge in ligand binding to a tRNA-binding enzyme

artículo científico publicado en 2014

Computational approaches to predict drug metabolism

artículo científico publicado en 2009

Count on kappa

artículo científico publicado en 2014

Development, validation, and application of adapted PEOE charges to estimate pKa values of functional groups in protein-ligand complexes

artículo científico publicado en 2006

Discovery of Potent, Selective, and Orally Bioavailable Small-Molecule Modulators of the Mediator Complex-Associated Kinases CDK8 and CDK19

artículo científico publicado en 2016

Discovery of potent and selective CDK8 inhibitors from an HSP90 pharmacophore

artículo científico publicado en 2016

Large-Scale Assessment of Binding Free Energy Calculations in Active Drug Discovery Projects

artículo científico publicado en 2020

Light-Activatable TET-Dioxygenases Reveal Dynamics of 5-Methylcytosine Oxidation and Transcriptome Reorganization

scientific article published on 14 April 2020

LigpKa – a database of pKa values for small molecule ligands designed for the use in structure-based pKa calculations.

artículo científico publicado en 2011

Machine learning meets pK a

scientific article published on 13 February 2020

OCEAN: Optimized Cross rEActivity estimatioN.

artículo científico publicado en 2016

Perturbation Approaches for Exploring Protein Binding Site Flexibility to Predict Transient Binding Pockets

artículo científico publicado en 2016

Protonation changes upon ligand binding to trypsin and thrombin: structural interpretation based on pK(a) calculations and ITC experiments

artículo científico publicado en 2007

Resistance to avapritinib in PDGFRA-driven GIST is caused by secondary mutations in the PDGFRA kinase domain

scientific article published on 24 September 2020

Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key

artículo científico publicado en 2015

Structural and chemical insights into the covalent-allosteric inhibition of the protein kinase Akt

artículo científico publicado en 2019

Structure of the epimerization domain of tyrocidine synthetase A

artículo científico publicado en 2014

Structure-Based Optimization of Potent, Selective, and Orally Bioavailable CDK8 Inhibitors Discovered by High-Throughput Screening.

artículo científico publicado en 2016

Structure-based optimization of non-peptidic Cathepsin D inhibitors

artículo científico publicado en 2014

TRAPP: a tool for analysis of transient binding pockets in proteins

artículo científico publicado en 2013

The mid-region of parathyroid hormone (1-34) serves as a functional docking domain in receptor activation.

artículo científico publicado en 2006

Tracing changes in protonation: a prerequisite to factorize thermodynamic data of inhibitor binding to aldose reductase

artículo científico publicado en 2007

Who cares for the protons? ⬇️

artículo científico publicado el 10 de marzo de 2012

hERG Me Out ⬇️

artículo científico publicado el 21 de agosto de 2013

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