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Lista de obras de Miguel Vazquez

3DEM Loupe: Analysis of macromolecular dynamics using structures from electron microscopy.

artículo científico publicado en 2013

A user guide for the online exploration and visualization of PCAWG data

artículo científico publicado en 2020

CHEMDNER: The drugs and chemical names extraction challenge

artículo científico publicado en 2015

CImbinator: a web-based tool for drug synergy analysis in small- and large-scale datasets

artículo científico publicado en 2017

Chapter 14: Cancer genome analysis

artículo científico publicado en 2012

CheNER: chemical named entity recognizer.

artículo científico publicado en 2013

ChiPPI: a novel method for mapping chimeric protein-protein interactions uncovers selection principles of protein fusion events in cancer

artículo científico publicado en 2017

Computational approaches to identify functional genetic variants in cancer genomes

artículo científico publicado en 2013

Exome sequencing identifies recurrent mutations of the splicing factor SF3B1 gene in chronic lymphocytic leukemia

artículo científico publicado en 2011

GeneCodis: interpreting gene lists through enrichment analysis and integration of diverse biological information

artículo científico publicado en 2009

How to link ontologies and protein-protein interactions to literature: text-mining approaches and the BioCreative experience

artículo científico publicado en 2012

KinMutRF: a random forest classifier of sequence variants in the human protein kinase superfamily

artículo científico publicado en 2016

MARQ: an online tool to mine GEO for experiments with similar or opposite gene expression signatures

artículo científico publicado en 2010

Named Entity Recognition and Normalization: A Domain-Specific Language Approach

Pathway and network analysis of cancer genomes

artículo científico publicado en 2015

Pathway and network analysis of more than 2,500 whole cancer genomes

Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomes

artículo científico publicado en 2020

Patient Dossier: Healthcare queries over distributed resources

scientific article published on 17 October 2019

Prioritization of pathogenic mutations in the protein kinase superfamily

artículo científico publicado en 2012

Recurrent inactivation of STAG2 in bladder cancer is not associated with aneuploidy.

artículo científico publicado en 2013

SENT: semantic features in text

artículo científico publicado en 2009

Somatic Embryonic FGFR2 Mutations in Keratinocytic Epidermal Nevi

artículo científico publicado en 2016

Structure-PPi: a module for the annotation of cancer-related single-nucleotide variants at protein-protein interfaces

artículo científico publicado en 2015

Text Mining

Text Mining for Drugs and Chemical Compounds: Methods, Tools and Applications

artículo científico publicado en 2011

The CHEMDNER corpus of chemicals and drugs and its annotation principles

artículo científico publicado en 2015

The Markyt visualisation, prediction and benchmark platform for chemical and gene entity recognition at BioCreative/CHEMDNER challenge

artículo científico publicado en 2016

The Protein-Protein Interaction tasks of BioCreative III: classification/ranking of articles and linking bio-ontology concepts to full text

artículo científico publicado en 2011

bioNMF: a web-based tool for nonnegative matrix factorization in biology.

artículo científico publicado en 2008

wKinMut-2: Identification and Interpretation of Pathogenic Variants in Human Protein Kinases.

artículo científico publicado en 2015

wKinMut: an integrated tool for the analysis and interpretation of mutations in human protein kinases

artículo científico publicado en 2013