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Lista de obras de Thomas Girke

A maximum common substructure-based algorithm for searching and predicting drug-like compounds

scientific article published on July 2008

Accelerated similarity searching and clustering of large compound sets by geometric embedding and locality sensitive hashing

artículo científico publicado en 2010

Alcohol Consumption Modulates Host Defense in Rhesus Macaques by Altering Gene Expression in Circulating Leukocytes

artículo científico publicado en 2015

AlignGraph: algorithm for secondary de novo genome assembly guided by closely related references

artículo científico publicado en 2014

Annotating genes of known and unknown function by large-scale coexpression analysis

artículo científico

BRANCH: boosting RNA-Seq assemblies with partial or related genomic sequences

artículo científico publicado en 2013

ChemMine tools: an online service for analyzing and clustering small molecules

artículo científico publicado en 2011

ChemMine. A compound mining database for chemical genomics.

artículo científico publicado en 2005

Cheminformatic analysis of high-throughput compound screens.

artículo científico publicado en 2014

ChemmineR: a compound mining framework for R.

artículo científico publicado en 2008

Cloning and characterization of microRNAs from rice

artículo científico publicado en 2005

Differential gene expression analysis using coexpression and RNA-Seq data ⬇️

artículo científico publicado el 21 de junio de 2013

Differential mRNA translation contributes to gene regulation under non-stress and dehydration stress conditions in Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 2004

Erratum: Large meta-analysis of genome-wide association studies identifies five loci for lean body mass

artículo científico publicado en 2017

Expression analysis of Arabidopsis vacuolar sorting receptor 3 reveals a putative function in guard cells

artículo científico publicado en 2008

Gene Expression Analysis of Shoot Apical Meristem Cell Types ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2013

Genome cluster database. A sequence family analysis platform for Arabidopsis and rice

artículo científico

Hairy and Groucho mediate the action of juvenile hormone receptor Methoprene-tolerant in gene repression

artículo científico publicado en 2016

High-throughput small molecule screening reveals Nrf2-dependent and -independent pathways of cellular stress resistance

artículo científico publicado en 2020

Identification and characterization of endogenous small interfering RNAs from rice

artículo científico publicado en 2005

Identification of a novel D6‐acyl‐group desaturase by targeted gene disruption in Physcomitrella patens ⬇️

artículo científico publicado el 1 de julio de 1998

In Planta Expression or Delivery of Potato Aphid Macrosiphum euphorbiae Effectors Me10 and Me23 Enhances Aphid Fecundity ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2013

Isolation and analysis of mRNAs from specific cell types of plants by ribosome immunopurification

artículo científico publicado en 2013

Juvenile hormone and its receptor, methoprene-tolerant, control the dynamics of mosquito gene expression

artículo científico publicado en 2013

Large meta-analysis of genome-wide association studies identifies five loci for lean body mass

artículo científico publicado en 2017

Large-scale bioactivity analysis of the small-molecule assayed proteome

artículo científico publicado en 2017

Linking genes of unknown function with abiotic stress responses by high-throughput phenotype screening

article

MODIFIED VACUOLE PHENOTYPE1 is an Arabidopsis myrosinase-associated protein involved in endomembrane protein trafficking

artículo científico publicado en 2009

Orchestrating high-throughput genomic analysis with Bioconductor

artículo científico publicado en 2015

Predicting conserved protein motifs with Sub-HMMs.

artículo científico publicado en 2010

Profiling translatomes of discrete cell populations resolves altered cellular priorities during hypoxia in Arabidopsis.

artículo científico publicado en 2009

Regulation of Gene Expression Patterns in Mosquito Reproduction.

artículo científico publicado en 2015

SEED: efficient clustering of next-generation sequences

artículo científico publicado en 2011

Sequence analysis of the potato aphid Macrosiphum euphorbiae transcriptome identified two new viruses.

artículo científico publicado en 2018

Small RNA Profiling Reveals Phosphorus Deficiency as a Contributing Factor in Symptom Expression for Citrus Huanglongbing Disease ⬇️

artículo científico publicado el 5 de enero de 2013

Small RNAs and the regulation of cis-natural antisense transcripts in Arabidopsis. ⬇️

artículo científico publicado en 2008

The Cell Wall Navigator database. A systems-based approach to organism-unrestricted mining of protein families involved in cell wall metabolism

artículo científico publicado en 2004

The floral homeotic protein APETALA2 recognizes and acts through an AT-rich sequence element ⬇️

artículo científico publicado el 18 de abril de 2012

The vegetative vacuole proteome of Arabidopsis thaliana reveals predicted and unexpected proteins

artículo científico publicado en 2004

Towards a modeling infrastructure for studying plant cells

artículo científico publicado en 2003

Transcriptome-wide microRNA and target dynamics in the fat body during the gonadotrophic cycle of Aedes aegypti

artículo científico publicado en 2017

Transcriptomes of Eight Arabidopsis thaliana Accessions Reveal Core Conserved, Genotype- and Organ-Specific Responses to Flooding Stress.

artículo científico publicado en 2016

Translational dynamics revealed by genome-wide profiling of ribosome footprints in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2013

What makes species unique? The contribution of proteins with obscure features

artículo científico publicado en 2006

bioassayR: Cross-Target Analysis of Small Molecule Bioactivity.

artículo científico publicado en 2016

fmcsR: mismatch tolerant maximum common substructure searching in R.

artículo científico publicado en 2013

systemPipeR: NGS workflow and report generation environment

artículo científico publicado en 2016

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