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Lista de obras de Michael Hackenberg

A comprehensive expression profile of microRNAs and other classes of non-coding small RNAs in barley under phosphorous-deficient and -sufficient conditions

artículo científico publicado en 2012

A systems level analysis reveals transcriptomic and proteomic complexity in Ixodes ricinus midgut and salivary glands during early attachment and feeding.

artículo científico publicado en 2014

Algorithms and methods for correlating experimental results with annotation databases.

artículo científico

Bioinformatic Analysis of Ixodes ricinus Long Non-Coding RNAs Predicts Their Binding Ability of Host miRNAs

artículo científico publicado en 2022

Characterization of phosphorus-regulated miR399 and miR827 and their isomirs in barley under phosphorus-sufficient and phosphorus-deficient conditions

artículo científico publicado en 2013

Clustering of DNA words and biological function: a proof of principle.

artículo científico publicado en 2011

ContDist: a tool for the analysis of quantitative gene and promoter properties

artículo científico publicado en 2009

CpGcluster: a distance-based algorithm for CpG-island detection

artículo científico publicado en 2006

CpGislandEVO: a database and genome browser for comparative evolutionary genomics of CpG islands.

artículo científico publicado en 2013

DNA clustering and genome complexity

artículo científico publicado en 2014

Differential expression of microRNAs and other small RNAs in barley between water and drought conditions.

artículo científico publicado en 2014

Exosome-Mediated Pathogen Transmission by Arthropod Vectors

scholarly article published by Michael Hackenberg in 2018

Expression of herpes simplex virus 1 microRNAs in cell culture models of quiescent and latent infection

artículo científico publicado en 2013

Functional Enrichment Analysis of Regulatory Elements

artículo científico publicado en 2022

Generation of different sizes and classes of small RNAs in barley is locus, chromosome and/or cultivar-dependent.

artículo científico publicado en 2016

Herpes simplex virus 1 miRNA sequence variations in latently infected human trigeminal ganglia

scholarly article by Maja Cokarić Brdovčak published in September 2018

High-level organization of isochores into gigantic superstructures in the human genome ⬇️

artículo científico publicado el 15 de marzo de 2011

Identification and characterisation of a previously unknown drought tolerance-associated microRNA in barley.

artículo científico publicado en 2018

Identification of tomato miRNAs responsive to root colonization by endophytic Pochonia chlamydosporia.

artículo científico publicado en 2017

Identifying characteristic scales in the human genome

artículo científico publicado en 2007

In silico target network analysis of de novo-discovered, tick saliva-specific microRNAs reveals important combinatorial effects in their interference with vertebrate host physiology

artículo científico publicado en 2017

Integrated microRNA, mRNA, and protein expression profiling reveals microRNA regulatory networks in rat kidney treated with a carcinogenic dose of aristolochic acid.

artículo científico publicado en 2015

Isochore chromosome maps of the human genome.

artículo científico publicado en 2002

Level statistics of words: Finding keywords in literary texts and symbolic sequences

artículo científico publicado en 2009

Mesenchymal stem cell's secretome promotes selective enrichment of cancer stem-like cells with specific cytogenetic profile

scientific article published on 05 May 2018

MethylExtract: High-Quality methylation maps and SNV calling from whole genome bisulfite sequencing data.

artículo científico publicado en 2013

NGSmethDB 2017: enhanced methylomes and differential methylation

artículo científico publicado en 2016

NGSmethDB: a database for next-generation sequencing single-cytosine-resolution DNA methylation data ⬇️

artículo científico publicado el 21 de octubre de 2010

NGSmethDB: an updated genome resource for high quality, single-cytosine resolution methylomes

artículo científico publicado en 2013

Noncoding RNAs in Parasite-Vector-Host Interactions

scientific article published on 15 July 2019

Nontemplated nucleotide additions distinguish the small RNA composition in cells from exosomes

artículo científico publicado en 2014

Non‑invasive prostate cancer detection by measuring miRNA variants (isomiRs) in urine extracellular vesicles.

artículo científico publicado en 2016

On the presence and immunoregulatory functions of extracellular microRNAs in the trematode Fasciola hepatica

artículo científico publicado en 2016

Phylogenetic distribution of large-scale genome patchiness

artículo científico publicado en 2008

Prediction of CpG Islands as an Intrinsic Clustering Property Found in Many Eukaryotic DNA Sequences and Its Relation to DNA Methylation

artículo científico publicado en 2018

Prediction of CpG-island function: CpG clustering vs. sliding-window methods

artículo científico publicado en 2010

Segmentation of time series with long-range fractal correlations.

artículo científico publicado en 2012

Sensing of latent EBV infection through exosomal transfer of 5'pppRNA

artículo científico publicado en 2016

Sources of individual variability: miRNAs that predispose to neuropathic pain identified using genome-wide sequencing

artículo científico publicado en 2014

Surface analysis of Dicrocoelium dendriticum. The molecular characterization of exosomes reveals the presence of miRNAs.

artículo científico publicado en 2014

TargetSpy: a supervised machine learning approach for microRNA target prediction

artículo científico publicado en 2010

The biased distribution of Alus in human isochores might be driven by recombination.

artículo científico publicado en 2005

The revised microRNA complement of Fasciola hepatica reveals a plethora of overlooked microRNAs and evidence for enrichment of immuno-regulatory microRNAs in extracellular vesicles

article

Thiourea priming enhances salt tolerance through co-ordinated regulation of microRNAs and hormones in Brassica juncea

artículo científico publicado en 2017

Transcriptional Dynamics and Candidate Genes Involved in Pod Maturation of Common Bean (Phaseolus vulgaris L.).

scientific article published on 22 April 2020

Viral Ubiquitin Ligase Stimulates Selective Host MicroRNA Expression by Targeting ZEB Transcriptional Repressors.

artículo científico

Whole transcriptome analysis of a reversible neurodegenerative process in Drosophila reveals potential neuroprotective genes.

artículo científico publicado en 2012

WordCluster: detecting clusters of DNA words and genomic elements.

artículo científico publicado en 2011

liqDB: a small-RNAseq knowledge discovery database for liquid biopsy studies

artículo científico publicado en 2019

miRanalyzer: a microRNA detection and analysis tool for next-generation sequencing experiments

artículo científico publicado en 2009

miRanalyzer: an update on the detection and analysis of microRNAs in high-throughput sequencing experiments

artículo científico publicado en 2011

sRNAbench and sRNAtoolbox 2019: intuitive fast small RNA profiling and differential expression

artículo científico publicado en 2019

sRNAtoolbox: an integrated collection of small RNA research tools

artículo científico publicado en 2015

sRNAtoolboxVM: Small RNA Analysis in a Virtual Machine.

artículo científico publicado en 2017

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