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Lista de obras de Georgios A. Pavlopoulos

1,003 reference genomes of bacterial and archaeal isolates expand coverage of the tree of life

artículo científico

A Guide to Conquer the Biological Network Era Using Graph Theory

artículo científico publicado en 2020

A Simple Genetic Algorithm for Biomarker Mining

A bioinformatics e-dating story: computational prediction and prioritization of receptor-ligand pairs

A reference guide for tree analysis and visualization

artículo científico publicado en 2010

A survey of visualization tools for biological network analysis

artículo científico publicado en 2008

An enhanced Markov clustering method for detecting protein complexes

Analyzing Protein-Protein Interaction Networks with Web Tools

Annotate-it: a Swiss-knife approach to annotation, analysis and interpretation of single nucleotide variation in human disease

artículo científico publicado en 2012

Apolipoprotein A-I inhibits experimental colitis and colitis-propelled carcinogenesis.

artículo científico publicado en 2015

Arena3D: visualization of biological networks in 3D.

artículo científico publicado en 2008

Arena3D: visualizing time-driven phenotypic differences in biological systems

artículo científico publicado en 2012

Bee foraging preferences, microbiota and pathogens revealed by direct shotgun metagenomics of honey

artículo científico publicado en 2022

BioTextQuest(+): a knowledge integration platform for literature mining and concept discovery

artículo científico publicado en 2014

BioTextQuest+: a knowledge integration platform for literature mining and concept discovery

artículo científico publicado en 2015

Biological information extraction and co-occurrence analysis

artículo científico publicado en 2014

Biomolecule and Bioentity Interaction Databases in Systems Biology: A Comprehensive Review

publication published on 20 August 2021

Blood Transcriptomes of Anti-SARS-CoV-2 Antibody-Positive Healthy Individuals Who Experienced Asymptomatic <i>Versus</i> Clinical Infection

artículo científico publicado en 2021

Caipirini: using gene sets to rank literature.

artículo científico publicado en 2012

Cultivation and sequencing of rumen microbiome members from the Hungate1000 Collection.

artículo científico publicado en 2018

Darling: A Web Application for Detecting Disease-Related Biomedical Entity Associations with Literature Mining

artículo científico publicado en 2022

Diversity, evolution, and classification of virophages uncovered through global metagenomics

scientific article published on 10 December 2019

DrugQuest - a text mining workflow for drug association discovery

artículo científico publicado en 2016

Erratum: 1,003 reference genomes of bacterial and archaeal isolates expand coverage of the tree of life

scholarly article published in Nature Biotechnology

GIBA: a clustering tool for detecting protein complexes

artículo científico publicado en 2009

How to Cluster Protein Sequences: Tools, Tips and Commands

Human gene correlation analysis (HGCA): a tool for the identification of transcriptionally co-expressed genes

artículo científico publicado en 2012

IMG/VR: a database of cultured and uncultured DNA Viruses and retroviruses

artículo científico publicado en 2016

Interpreting the Omics ‘era’ Data

LAITOR--Literature Assistant for Identification of Terms co-Occurrences and Relationships ⬇️

artículo científico publicado en 2010

Large-Scale Analyses of Human Microbiomes Reveal Thousands of Small, Novel Genes

artículo científico publicado en 2019

Meander: visually exploring the structural variome using space-filling curves

artículo científico publicado en 2013

Medusa: A tool for exploring and clustering biological networks

artículo científico publicado en 2011

Metagenomics: tools and insights for analyzing next-generation sequencing data derived from biodiversity studies

artículo científico publicado en 2015

Mining Cell Cycle Literature Using Support Vector Machines

Molecular Epidemiology of SARS-CoV-2 in Greece Reveals Low Rates of Onward Virus Transmission after Lifting of Travel Restrictions Based on Risk Assessment during Summer 2020

artículo científico publicado en 2021

NAP: The Network Analysis Profiler, a web tool for easier topological analysis and comparison of medium-scale biological networks

artículo científico publicado en 2017

Network analysis of genes and their association with diseases

artículo científico publicado en 2016

Nontargeted virus sequence discovery pipeline and virus clustering for metagenomic data

artículo científico publicado en 2017

OnTheFly 2.0: A tool for automatic annotation of files and biological information extraction

artículo científico publicado en 2013

OnTheFly2.0: a text-mining web application for automated biomedical entity recognition, document annotation, network and functional enrichment analysis

artículo científico publicado en 2021

OnTheFly: a tool for automated document-based text annotation, data linking and network generation

artículo científico publicado en 2009

Prediction of miRNA targets

artículo científico

Protein-protein interaction predictions using text mining methods

artículo científico publicado en 2014

ProteoSign: an end-user online differential proteomics statistical analysis platform

artículo científico publicado en 2017

ReLiance: a machine learning and literature-based prioritization of receptor--ligand pairings

artículo científico publicado en 2012

Structure determination of the HgcAB complex using metagenome sequence data: insights into microbial mercury methylation

scientific article published on 19 June 2020

Towards Better Prioritization of Epigenetically Modified DNA Regions

Uncovering Earth’s virome

artículo científico publicado en 2016

Unraveling genomic variation from next generation sequencing data

artículo científico publicado en 2013

Using graph theory to analyze biological networks

artículo científico publicado en 2011

Visualizing genome and systems biology: technologies, tools, implementation techniques and trends, past, present and future

artículo científico publicado en 2015

Visualizing high dimensional datasets using parallel coordinates: Application to gene prioritization

article

Which clustering algorithm is better for predicting protein complexes?

artículo científico publicado en 2011

jClust: a clustering and visualization toolbox

artículo científico publicado en 2009

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