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Lista de obras de Alexey A. Gurevich

A Multi-Omics Characterization of the Natural Product Potential of Tropical Filamentous Marine Cyanobacteria

artículo científico publicado en 2021

Assembling Genomes and Mini-metagenomes from Highly Chimeric Reads

Assembling short reads from jumping libraries with large insert sizes

artículo científico publicado en 2015

Assembling single-cell genomes and mini-metagenomes from chimeric MDA products

artículo científico publicado en 2013

Critical Assessment of Metagenome Interpretation − a benchmark of computational metagenomics software

article

Critical Assessment of Metagenome Interpretation-a benchmark of metagenomics software.

artículo científico publicado en 2017

Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges

artículo científico publicado en 2022

De Novo Peptide Sequencing Reveals Many Cyclopeptides in the Human Gut and Other Environments

artículo científico publicado en 2019

Dereplication of microbial metabolites through database search of mass spectra

artículo científico publicado en 2018

Dereplication of peptidic natural products through database search of mass spectra

artículo científico publicado en 2016

ExSPAnder: a universal repeat resolver for DNA fragment assembly

artículo científico publicado en 2014

Feature-based molecular networking in the GNPS analysis environment

artículo científico publicado en 2020

HypoRiPPAtlas as an Atlas of hypothetical natural products for mass spectrometry database search

artículo científico publicado en 2023

Icarus: visualizer for de novo assembly evaluation

artículo científico publicado en 2016

Increased diversity of peptidic natural products revealed by modification-tolerant database search of mass spectra.

artículo científico publicado en 2018

Integrating genomics and metabolomics for scalable non-ribosomal peptide discovery

scientific article published on 28 May 2021

MIBiG 4.0: advancing biosynthetic gene cluster curation through global collaboration

artículo científico publicado en 2024

MetaMiner: A Scalable Peptidogenomics Approach for Discovery of Ribosomal Peptide Natural Products with Blind Modifications from Microbial Communities

scientific article published on 16 October 2019

MetaQUAST: evaluation of metagenome assemblies

artículo científico publicado en 2015

MetaRiPPquest: A Peptidogenomics Approach for the Discovery of Ribosomally Synthesized and Post-translationally Modified Peptides

artículo científico publicado en 2017

Metabolic Fingerprints from the Human Oral Microbiome Reveal a Vast Knowledge Gap of Secreted Small Peptidic Molecules

artículo científico publicado en 2017

MolDiscovery: learning mass spectrometry fragmentation of small molecules

artículo científico publicado en 2021

NPOmix: A machine learning classifier to connect mass spectrometry fragmentation data to biosynthetic gene clusters

NPOmix: a machine learning classifier to connect mass spectrometry fragmentation data to biosynthetic gene clusters

artículo científico publicado en 2021

NPS: scoring and evaluating the statistical significance of peptidic natural product-spectrum matches

scientific article published on 01 July 2019

Nerpa: A Tool for Discovering Biosynthetic Gene Clusters of Bacterial Nonribosomal Peptides

artículo científico publicado en 2021

QUAST: quality assessment tool for genome assemblies

artículo científico publicado en 2013

SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing

artículo científico publicado en 2012

Spatial Molecular Architecture of the Microbial Community of a Peltigera Lichen

artículo científico publicado en 2016

TandemTools: mapping long reads and assessing/improving assembly quality in extra-long tandem repeats

scientific article published on 01 July 2020

Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG.

artículo científico publicado en 2018

metaFlye: scalable long-read metagenome assembly using repeat graphs

artículo científico publicado en 2020

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