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Lista de obras de Paul J. McMurdie

Advancing our understanding of the human microbiome using QIIME

artículo científico publicado en 2013

Bioconductor Workflow for Microbiome Data Analysis: from raw reads to community analyses.

artículo científico publicado en 2016

Bioconductor workflow for microbiome data analysis: from raw reads to community analyses

scientific article published on 24 June 2016

Colonic microbiota is associated with inflammation and host epigenomic alterations in inflammatory bowel disease

artículo científico publicado en 2020

Comparisons of distance methods for combining covariates and abundances in microbiome studies.

artículo científico publicado en 2012

DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data

artículo científico publicado en 2016

Exact sequence variants should replace operational taxonomic units in marker-gene data analysis

artículo científico

Hydrogen production in photosynthetic microbial mats in the Elkhorn Slough estuary, Monterey Bay.

artículo científico publicado en 2011

Improvements to postprandial glucose control in subjects with type 2 diabetes: a multicenter, double blind, randomized placebo-controlled trial of a novel probiotic formulation

artículo científico publicado en 2020

Increased circulating butyrate and ursodeoxycholate during probiotic intervention in humans with type 2 diabetes

artículo científico publicado en 2022

Leveraging sequence-based faecal microbial community survey data to identify a composite biomarker for colorectal cancer

artículo científico publicado en 2017

Localized plasticity in the streamlined genomes of vinyl chloride respiring Dehalococcoides

artículo científico publicado en 2009

Monitoring abundance and expression of "Dehalococcoides" species chloroethene-reductive dehalogenases in a tetrachloroethene-dechlorinating flow column

artículo científico publicado en 2008

Normalization of Microbiome Profiling Data

artículo científico publicado en 2018

Phyloseq: a bioconductor package for handling and analysis of high-throughput phylogenetic sequence data

artículo científico publicado el 1 de enero de 2012

Shiny-phyloseq: Web application for interactive microbiome analysis with provenance tracking.

artículo científico publicado en 2014

Site-specific mobilization of vinyl chloride respiration islands by a mechanism common in Dehalococcoides

artículo científico publicado en 2011

Temporal and spatial variation of the human microbiota during pregnancy

artículo científico publicado en 2015

Unusual codon bias in vinyl chloride reductase genes of Dehalococcoides species.

artículo científico publicado en 2007

Waste not, want not: why rarefying microbiome data is inadmissible

artículo científico publicado en 2014

phyloseq: An R Package for Reproducible Interactive Analysis and Graphics of Microbiome Census Data

artículo científico publicado el 22 de abril de 2013