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Lista de obras de Pratik D. Jagtap

A Predator Unmasked: Life Cycle of Bdellovibrio bacteriovorus from a Genomic Perspective

artículo científico publicado en 2004

A two-step database search method improves sensitivity in peptide sequence matches for metaproteomics and proteogenomics studies.

artículo científico publicado en 2013

BAL Fluid Metaproteome in Acute Respiratory Failure

artículo científico publicado en 2018

Bronchoalveolar Lavage Fluid Protein Expression in Acute Respiratory Distress Syndrome Provides Insights into Pathways Activated in Subjects with Different Outcomes.

artículo científico publicado en 2017

Challenges in Peptide-Spectrum Matching: A Robust and Reproducible Statistical Framework for Removing Low-Accuracy, High-Scoring Hits

scientific article published on 20 December 2019

Characterizing Cardiac Molecular Mechanisms of Mammalian Hibernation via Quantitative Proteogenomics.

artículo científico publicado en 2015

Complete genome sequence and analysis of Wolinella succinogenes

artículo científico publicado en 2003

Critical Assessment of MetaProteome Investigation (CAMPI): a multi-laboratory comparison of established workflows

artículo científico publicado en 2021

Deep metaproteomic analysis of human salivary supernatant.

artículo científico publicado en 2012

Disseminating Metaproteomic Informatics Capabilities and Knowledge Using the Galaxy-P Framework

artículo científico publicado en 2018

Early events of Bacillus anthracis germination identified by time-course quantitative proteomics

artículo científico publicado en 2006

Flexible and accessible workflows for improved proteogenomic analysis using the Galaxy framework

artículo científico publicado en 2014

Improve your Galaxy text life: The Query Tabular Tool

artículo científico publicado en 2018

Iron-sparing response of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis is strain dependent

artículo científico publicado en 2010

Metaproteomic analysis using the Galaxy framework.

artículo científico publicado en 2015

Metaproteomics Analysis of SARS-CoV-2-Infected Patient Samples Reveals Presence of Potential Coinfecting Microorganisms

artículo científico publicado en 2021

Microbiomes - embracing complexity

artículo científico publicado en 2015

Multi-omic data analysis using Galaxy.

artículo científico publicado en 2015

Novel In Situ Collection of Tumor Interstitial Fluid from a Head and Neck Squamous Carcinoma Reveals a Unique Proteome with Diagnostic Potential ⬇️

artículo científico publicado el 25 de julio de 2010

Perspectives on automated composition of workflows in the life sciences

artículo científico publicado en 2021

Precursor Intensity-Based Label-Free Quantification Software Tools for Proteomic and Multi-Omic Analysis within the Galaxy Platform

artículo científico publicado en 2020

Progress and Challenges in Ocean Metaproteomics and Proposed Best Practices for Data Sharing

article

Protein relative abundance patterns associated with sucrose-induced dysbiosis are conserved across taxonomically diverse oral microcosm biofilm models of dental caries

artículo científico publicado en 2015

Proteogenomic Analysis of a Hibernating Mammal Indicates Contribution of Skeletal Muscle Physiology to the Hibernation Phenotype

artículo científico publicado en 2016

Proteome Profiling in Lung Injury after Hematopoietic Stem Cell Transplantation

artículo científico

Proteomic profiles in acute respiratory distress syndrome differentiates survivors from non-survivors

artículo científico publicado en 2014

QuanTP: A Software Resource for Quantitative Proteo-Transcriptomic Comparative Data Analysis and Informatics

artículo científico publicado en 2019

Relative quantification: characterization of bias, variability and fold changes in mass spectrometry data from iTRAQ-labeled peptides

artículo científico publicado en 2011

Studies on the cytoplasmic protein tyrosine kinase activity of the Antarctic psychrotrophic bacterium Pseudomonas syringae

artículo científico publicado en 1999

Survey of metaproteomics software tools for functional microbiome analysis

scientific article published on 10 November 2020

Temporal quantitative proteomics by iTRAQ 2D-LC-MS/MS and corresponding mRNA expression analysis identify post-transcriptional modulation of actin-cytoskeleton regulators during TGF-beta-Induced epithelial-mesenchymal transition

artículo científico publicado en 2009

The Bdellovibrio bacteriovorus twin-arginine transport system has roles in predatory and prey-independent growth.

artículo científico publicado en 2011

Update on the moFF Algorithm for Label-Free Quantitative Proteomics

scientific article published on 14 December 2018

Updates on metaQuantome Software for Quantitative Metaproteomics

artículo científico publicado en 2021

Using Galaxy-P to leverage RNA-Seq for the discovery of novel protein variations

artículo científico publicado en 2014

Workflow for analysis of high mass accuracy salivary data set using MaxQuant and ProteinPilot search algorithm.

artículo científico publicado en 2012

metaQuantome: An Integrated, Quantitative Metaproteomics Approach Reveals Connections Between Taxonomy and Protein Function in Complex Microbiomes

scientific article published on 24 June 2019

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