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Lista de obras de Forest Rohwer

2004 ASM Conference on the New Phage Biology: the 'Phage Summit'

artículo científico publicado en 2005

A Winogradsky-based culture system shows an association between microbial fermentation and cystic fibrosis exacerbation

artículo científico publicado en 2015

A Winogradsky-based culture system shows an association between microbial fermentation and cystic fibrosis exacerbation

artículo científico publicado en 2015

A bacterial metapopulation adapts locally to phage predation despite global dispersal

artículo científico publicado en 2007

A glimpse into the expanded genome content of Vibrio cholerae through identification of genes present in environmental strains

artículo científico publicado en 2005

An application of statistics to comparative metagenomics

artículo científico publicado en 2006

Assessing coral reefs on a Pacific-wide scale using the microbialization score

artículo científico publicado en 2012

Bacteriophage Transcytosis Provides a Mechanism To Cross Epithelial Cell Layers

artículo científico publicado en 2017

Bacteriophage adhering to mucus provide a non-host-derived immunity.

artículo científico publicado en 2013

Baselines and degradation of coral reefs in the Northern Line Islands.

artículo científico publicado en 2008

Before platelets: the production of platelet-activating factor during growth and stress in a basal marine organism

scientific article published in 2018

Biodiversity and Biogeography of Phages in Modern Stromatolites and Thrombolites

scholarly article published 10 November 2011

Biodiversity and biogeography of phages in modern stromatolites and thrombolites.

artículo científico publicado en 2008

Biogeochemical forces shape the composition and physiology of polymicrobial communities in the cystic fibrosis lung.

artículo científico publicado en 2014

Biophysical and physiological processes causing oxygen loss from coral reefs

article published in 2019

Black reefs: iron-induced phase shifts on coral reefs

artículo científico publicado en 2011

Black reefs: iron-induced phase shifts on coral reefs

artículo científico publicado en 2012

Breath gas metabolites and bacterial metagenomes from cystic fibrosis airways indicate active pH neutral 2,3-butanedione fermentation

artículo científico publicado en 2014

Broad surveys of DNA viral diversity obtained through viral metagenomics of mosquitoes

artículo científico publicado en 2011

Can we measure beauty? Computational evaluation of coral reef aesthetics

artículo científico publicado en 2015

Case Studies of the Spatial Heterogeneity of DNA Viruses in the Cystic Fibrosis Lung ⬇️

artículo científico publicado el 6 de octubre de 2011

Challenging the state of the art in protein structure prediction: Highlights of experimental target structures for the 10th Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction Experiment CASP10

artículo científico publicado en 2014

Clinical insights from metagenomic analysis of sputum samples from patients with cystic fibrosis.

artículo científico publicado en 2013

Closing the gaps on the viral photosystem-I psaDCAB gene organization

artículo científico publicado en 2015

Comparative metagenomics of microbial traits within oceanic viral communities

artículo científico publicado en 2011

Coral Microbiology

scientific article published in 2007

Coral and macroalgal exudates vary in neutral sugar composition and differentially enrich reef bacterioplankton lineages ⬇️

artículo científico publicado el 10 de enero de 2013

Cystic Fibrosis Rapid Response: Translating Multi-omics Data into Clinically Relevant Information

scholarly article by Ana Georgina Cobián Güemes et al published 16 April 2019 in mBio

Cystic Fibrosis Therapy: A Community Ecology Perspective ⬇️

artículo científico publicado el 25 de octubre de 2012

Development and use of personalized bacteriophage-based therapeutic cocktails to treat a patient with a disseminated resistant Acinetobacter baumannii infection

artículo científico publicado en 2017

Dissecting microbial employment

artículo científico publicado en 2008

Distribution and diversity of archaeal ammonia monooxygenase genes associated with corals

artículo científico publicado en 2007

Diversity and population structure of a near-shore marine-sediment viral community

artículo científico publicado en 2004

Diversity of viral photosystem-I psaA genes ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Ecological networking of cystic fibrosis lung infections

artículo científico publicado en 2016

Effects of Coral Reef Benthic Primary Producers on Dissolved Organic Carbon and Microbial Activity ⬇️

artículo científico publicado el 18 de noviembre de 2011

Energetic differences between bacterioplankton trophic groups and coral reef resistance

artículo científico publicado en 2016

Erratum for Schooley et al., "Development and Use of Personalized Bacteriophage-Based Therapeutic Cocktails To Treat a Patient with a Disseminated Resistant Acinetobacter baumannii Infection"

scholarly article by Robert T. Schooley et al published December 2018 in Antimicrobial Agents and Chemotherapy

Erratum: The Microbial Olympics

scholarly article published in Nature Reviews Microbiology

Evidence of a robust resident bacteriophage population revealed through analysis of the human salivary virome

artículo científico publicado en 2011

Evolution of TNF-induced apoptosis reveals 550 My of functional conservation.

artículo científico publicado en 2014

Explaining microbial population genomics through phage predation

artículo científico publicado en 2009

FastGroupII: a web-based bioinformatics platform for analyses of large 16S rDNA libraries

artículo científico publicado en 2006

Finding novel genes in bacterial communities isolated from the environment

article

Functional metagenomic profiling of nine biomes

artículo científico publicado en 2008

Functional metagenomic profiling of nine biomes

artículo científico publicado en 2008

Genome Sequences of Two Closely Related Vibrio parahaemolyticus Phages, VP16T and VP16C ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2003

Genomic analysis of multiple Roseophage SIO1 strains

artículo científico publicado en 2009

Genomic analysis of uncultured marine viral communities

artículo científico publicado en 2002

Global distribution of nearly identical phage-encoded DNA sequences

artículo científico publicado en 2004

Global microbialization of coral reefs.

artículo científico publicado en 2016

Global phage diversity

artículo científico publicado en 2003

Going viral: next-generation sequencing applied to phage populations in the human gut.

artículo científico publicado en 2012

Grinder: a versatile amplicon and shotgun sequence simulator

artículo científico publicado en 2012

Gut DNA viromes of Malawian twins discordant for severe acute malnutrition

artículo científico publicado en 2015

Here a virus, there a virus, everywhere the same virus?

artículo científico publicado en 2005

Hyperspectral and physiological analyses of coral-algal interactions

artículo científico publicado en 2009

IL-2 activation of a PI3K-dependent STAT3 serine phosphorylation pathway in primary human T cells

artículo científico publicado en 2003

Identification of a novel human papillomavirus by metagenomic analysis of samples from patients with febrile respiratory illness

artículo científico publicado en 2013

Impact of bacteria motility in the encounter rates with bacteriophage in mucus

scientific article published on 11 November 2019

In retrospect: A century of phage lessons

artículo científico publicado en 2015

Influence of coral and algal exudates on microbially mediated reef metabolism

artículo científico publicado en 2013

Innate and acquired bacteriophage-mediated immunity

artículo científico publicado en 2013

Knowles &Rohwer reply

artículo científico publicado en 2017

Laboratory procedures to generate viral metagenomes

artículo científico publicado en 2009

Local genomic adaptation of coral reef-associated microbiomes to gradients of natural variability and anthropogenic stressors.

artículo científico publicado en 2014

Marine Viruses: Community Dynamics, Diversity and Impact on Microbial Processes

article

Marine phage genomics

artículo científico publicado en 2002

Mass spectral similarity for untargeted metabolomics data analysis of complex mixtures.

artículo científico publicado en 2015

Mechanistic model of Rothia mucilaginosa adaptation toward persistence in the CF lung, based on a genome reconstructed from metagenomic data

artículo científico publicado en 2013

Metabolic cascades in marine microbial communities

artículo científico publicado en 2015

Metabolomics of pulmonary exacerbations reveals the personalized nature of cystic fibrosis disease

artículo científico publicado en 2016

Metagenomic analyses of an uncultured viral community from human feces

artículo científico publicado en 2003

Metagenomic analysis of lysogeny in Tampa Bay: implications for prophage gene expression

artículo científico publicado en 2008

Metagenomic analysis of respiratory tract DNA viral communities in cystic fibrosis and non-cystic fibrosis individuals

artículo científico publicado en 2009

Metagenomic analysis of stressed coral holobionts

artículo científico publicado en 2009

Metagenomic analysis of the microbial community associated with the coral Porites astreoides.

artículo científico publicado en 2007

Metagenomic and small-subunit rRNA analyses reveal the genetic diversity of bacteria, archaea, fungi, and viruses in soil

artículo científico publicado en 2007

Metagenomic and stable isotopic analyses of modern freshwater microbialites in Cuatro Ciénegas, Mexico

artículo científico publicado en 2008

Metagenomic detection of phage-encoded platelet-binding factors in the human oral cavity

artículo científico publicado en 2010

Metagenomic islands of hyperhalophiles: the case of Salinibacter ruber

artículo científico publicado en 2009

Metagenomic signatures of 86 microbial and viral metagenomes

artículo científico publicado en 2009

Metagenomics and future perspectives in virus discovery.

artículo científico publicado en 2012

Metagenomics and metatranscriptomics: Windows on CF-associated viral and microbial communities ⬇️

artículo científico publicado el 28 de agosto de 2012

Metatranscriptomic array analysis of 'Candidatus Accumulibacter phosphatis'-enriched enhanced biological phosphorus removal sludge

artículo científico publicado en 2010

Method for discovering novel DNA viruses in blood using viral particle selection and shotgun sequencing

artículo científico publicado en 2005

Microbial communities associated with skeletal tumors on Porites compressa

artículo científico publicado en 2005

Microbial ecology of four coral atolls in the Northern Line Islands.

artículo científico publicado en 2008

Movement of viruses between biomes

artículo científico publicado en 2004

Mucus Distribution Model in a Lung with Cystic Fibrosis ⬇️

artículo científico publicado el 17 de octubre de 2012

Multilevel Research Strategies and Biological Systems

article

Multispecies Microbial Mutualisms on Coral Reefs: The Host as a Habitat ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 2003

New abundant microbial groups in aquatic hypersaline environments

artículo científico publicado en 2011

Oxygen minimum zones harbour novel viral communities with low diversity

artículo científico publicado en 2012

PHACCS, an online tool for estimating the structure and diversity of uncultured viral communities using metagenomic information

artículo científico publicado en 2005

Phage Phenomics: Physiological Approaches to Characterize Novel Viral Proteins

artículo científico publicado en 2015

Phage community dynamics in hot springs

artículo científico publicado en 2004

Phage metagenomics

artículo científico publicado en 2007

Phage on tap-a quick and efficient protocol for the preparation of bacteriophage laboratory stocks

artículo científico publicado en 2016

Photosystem I gene cassettes are present in marine virus genomes

artículo científico publicado en 2009

Phylogenetic classification of short environmental DNA fragments

artículo científico publicado en 2008

Power law rankâ abundance models for marine phage communities

article

Purifying the impure: sequencing metagenomes and metatranscriptomes from complex animal-associated samples

artículo científico publicado en 2014

RNA viral community in human feces: prevalence of plant pathogenic viruses

artículo científico publicado en 2006

Rapid estimation of microbial numbers in water using bulk fluorescence

artículo científico publicado en 2006

Re-evaluating the health of coral reef communities: baselines and evidence for human impacts across the central Pacific

artículo científico publicado en 2016

Real-time microbial ecology

artículo científico publicado en 2007

Reconstructing a puzzle: existence of cyanophages containing both photosystem-I and photosystem-II gene suites inferred from oceanic metagenomic datasets

artículo científico publicado en 2011

Roles of viruses in the environment

artículo científico publicado en 2009

Some of the most interesting CASP11 targets through the eyes of their authors

artículo científico publicado en 2015

Spatial Molecular Architecture of the Microbial Community of a Peltigera Lichen

artículo científico publicado en 2016

Spatial distribution of microbial communities in the cystic fibrosis lung ⬇️

artículo científico publicado el 28 de julio de 2011

Stochastic tracking of infection in a CF lung

artículo científico publicado en 2014

Stratigraphy of Spring Coulee Well Supplementary Paper

article by William P. Mellen & Forest Rohwer published 1931 in AAPG Bulletin

Structure and function of a cyanophage-encoded peptide deformylase

artículo científico publicado en 2013

Subdiffusive motion of bacteriophage in mucosal surfaces increases the frequency of bacterial encounters

artículo científico publicado en 2015

Superorganisms and Holobionts

artículo científico publicado en 2013

TagCleaner: Identification and removal of tag sequences from genomic and metagenomic datasets

artículo científico publicado en 2010

The GAAS metagenomic tool and its estimations of viral and microbial average genome size in four major biomes

artículo científico publicado en 2009

The Microbial Olympics

artículo científico publicado en 2012

The Phage Proteomic Tree: a genome-based taxonomy for phage

artículo científico publicado en 2002

The airborne metagenome in an indoor urban environment

artículo científico publicado en 2008

The birth of viromics: an interview with Forest Rohwer

article

The marine viromes of four oceanic regions

artículo científico publicado en 2006

Three Prochlorococcus cyanophage genomes: signature features and ecological interpretations

artículo científico publicado en 2005

Three-Dimensional Microbiome and Metabolome Cartography of a Diseased Human Lung

artículo científico publicado en 2017

Transfer of photosynthesis genes to and from Prochlorococcus viruses

artículo científico publicado en 2004

Unraveling the unseen players in the ocean - a field guide to water chemistry and marine microbiology

artículo científico publicado en 2014

Use of 16S ribosomal DNA for delineation of marine bacterioplankton species

artículo científico publicado en 2002

Using pyrosequencing to shed light on deep mine microbial ecology

artículo científico publicado en 2006

Variability and host density independence in inductions-based estimates of environmental lysogeny

artículo científico publicado en 2017

Viral and microbial community dynamics in four aquatic environments.

artículo científico publicado en 2010

Viral communities associated with healthy and bleaching corals

artículo científico publicado en 2008

Viral diversity and dynamics in an infant gut.

artículo científico publicado en 2008

Viral information ⬇️

artículo científico publicado el 31 de octubre de 2012

Viral metagenomics

artículo científico publicado en 2005

Viruses and the origin of microbiome selection and immunity

artículo científico publicado en 2016

Viruses as Winners in the Game of Life

artículo científico publicado en 2016

Viruses in the faecal microbiota of monozygotic twins and their mothers

artículo científico publicado en 2010

Viruses manipulate the marine environment

artículo científico publicado en 2009

Visualization of oxygen distribution patterns caused by coral and algae ⬇️

artículo científico publicado el 16 de julio de 2013

Widespread association of a Rickettsiales-like bacterium with reef-building corals

artículo científico publicado en 2004

Widespread occurrence of phage-encoded exotoxin genes in terrestrial and aquatic environments in Southern California

artículo científico publicado en 2006

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