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Lista de obras de Haim Ashkenazy

A Simulation-Based Approach to Statistical Alignment

scientific article published on 01 March 2019

ASAP - A Webserver for Immunoglobulin-Sequencing Analysis Pipeline

Broad phylogenetic analysis of cation/proton antiporters reveals transport determinants

artículo científico publicado en 2018

CoPAP: Coevolution of presence-absence patterns

artículo científico publicado en 2013

Commensal Pseudomonas protect Arabidopsis thaliana from a coexisting pathogen via multiple lineage-dependent mechanisms

artículo científico publicado en 2021

Commensal Pseudomonas strains facilitate protective response against pathogens in the host plant

artículo científico publicado en 2022

ConSurf 2010: calculating evolutionary conservation in sequence and structure of proteins and nucleic acids

artículo científico publicado en 2010

ConSurf 2016: an improved methodology to estimate and visualize evolutionary conservation in macromolecules

artículo científico publicado en 2016

ConSurf-DB: An accessible repository for the evolutionary conservation patterns of the majority of PDB proteins

artículo científico publicado en 2019

ConTemplate Suggests Possible Alternative Conformations for a Query Protein of Known Structure

artículo científico publicado en 2015

Deep Panning: steps towards probing the IgOme

artículo científico publicado en 2012

FastML: a web server for probabilistic reconstruction of ancestral sequences

artículo científico publicado en 2012

GLOOME: gain loss mapping engine

artículo científico publicado en 2010

GUIDANCE2: accurate detection of unreliable alignment regions accounting for the uncertainty of multiple parameters

artículo científico publicado en 2015

GUIDANCE: a web server for assessing alignment confidence scores.

artículo científico publicado en 2010

Genetic variation, environment and demography intersect to shape Arabidopsis defense metabolite variation across Europe

artículo científico publicado en 2021

Hidden conformations in protein structures

artículo científico publicado en 2011

Indel reliability in indel-based phylogenetic inference

artículo científico publicado en 2014

Inferring Indel Parameters using a Simulation-based Approach

artículo científico publicado en 2015

Inferring Rates and Length-Distributions of Indels Using Approximate Bayesian Computation

artículo científico publicado en 2017

MuD: an interactive web server for the prediction of non-neutral substitutions using protein structural data

artículo científico publicado en 2010

MuD: an interactive web server for the prediction of non-neutral substitutions using protein structural data.

artículo científico publicado en 2010

Multiple Sequence Alignment Averaging Improves Phylogeny Reconstruction

artículo científico publicado en 2019

Optimal data collection for correlated mutation analysis

artículo científico publicado en 2009

Peptides modulating conformational changes in secreted chaperones: from in silico design to preclinical proof of concept

artículo científico publicado en 2009

Phage display peptide libraries: deviations from randomness and correctives

artículo científico publicado en 2018

PredictProtein--an open resource for online prediction of protein structural and functional features

artículo científico publicado en 2014

Protein stability: a single recorded mutation aids in predicting the effects of other mutations in the same amino acid site

artículo científico publicado en 2011

Reducing phylogenetic bias in correlated mutation analysis

artículo científico publicado en 2010

SpartaABC: a web server to simulate sequences with indel parameters inferred using an approximate Bayesian computation algorithm

artículo científico publicado en 2017

TraitRateProp: a web server for the detection of trait-dependent evolutionary rate shifts in sequence sites

artículo científico publicado en 2017

Uncovering the co-evolutionary network among prokaryotic genes

artículo científico publicado en 2012

Using ConTemplate and the PDB to explore conformational space: on the detection of rare protein conformations

artículo científico publicado en 2015

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