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Lista de obras de Simon Jupp

A Flexible API and Editor for SKOS

artículo científico publicado en 2009

A Simple Standard for Sharing Ontological Mappings (SSSOM)

artículo científico publicado en 2022

A compendium of uniformly processed human gene expression and splicing quantitative trait loci

artículo científico

A new Ontology Lookup Service at EMBL-EBI

A user-centred evaluation framework for the Sealife semantic web browsers

artículo científico publicado en 2009

BioHackathon series in 2013 and 2014: improvements of semantic interoperability in life science data and services

artículo científico publicado en 2019

Collaborative Ontology Development Using the Webulous Architecture and Google App

article

Comparison, alignment, and synchronization of cell line information between CLO and EFO.

artículo científico publicado en 2017

Developing a kidney and urinary pathway knowledge base

artículo científico publicado en 2011

Developing a web-based SKOS editor

artículo científico publicado en 2016

ELIXIR biovalidator for semantic validation of life science metadata

artículo científico publicado en 2022

Expression Atlas update--a database of gene and transcript expression from microarray- and sequencing-based functional genomics experiments

artículo científico publicado en 2014

Expression Atlas update--an integrated database of gene and protein expression in humans, animals and plants.

artículo científico publicado en 2015

Expression Atlas update: from tissues to single cells

artículo científico publicado en 2020

Features of a FAIR vocabulary

Harmonising phenomics information for a better interoperability in the rare disease field

artículo científico publicado en 2018

Human Cell Atlas Ontology

2018 article

Identifiers for the 21st century: How to design, provision, and reuse persistent identifiers to maximize utility and impact of life science data

artículo científico publicado en 2017

Identifiers for the 21st century: How to design, provision, and reuse persistent identifiers to maximize utility and impact of life science data

artículo científico publicado en 2017

Issues in learning an ontology from text

artículo científico publicado en 2009

Knowledge Representation for Web Navigation

Linking rare and common disease: mapping clinical disease-phenotypes to ontologies in therapeutic target validation

artículo científico publicado en 2016

Logical Gene Ontology Annotations (GOAL): exploring gene ontology annotations with OWL

artículo científico publicado en 2012

OLS Client and OLS Dialog: Open source tools to annotate public omics datasets.

artículo científico

Ontology mapping for semantically enabled applications

scientific article published on 31 May 2019

Open Targets Genetics: systematic identification of trait-associated genes using large-scale genetics and functional genomics

artículo científico publicado en 2020

Populous: A Tool For Populating OWL Ontologies From Templates

article

Populous: A Tool for Populating Templates for OWL Ontologies

Populous: a tool for building OWL ontologies from templates

artículo científico publicado en 2012

Proceedings of a Sickle Cell Disease Ontology workshop - Towards the first comprehensive ontology for Sickle Cell Disease

artículo científico publicado en 2016

SKOS with OWL: Don’t be Full-ish!

artículo científico publicado en 2009

Semantic Web Atlas: Putting Gene Expression Data into Biological Context

article

Stealthy annotation of experimental biology by spreadsheets

Ten Simple Rules for Selecting a Bio-ontology

artículo científico publicado en 2016

The EBI RDF platform: linked open data for the life sciences

artículo científico publicado en 2014

The Hearing Impairment Ontology: A Tool for Unifying Hearing Impairment Knowledge to Enhance Collaborative Research

scientific article published on 21 November 2019

The KUPKB: a novel Web application to access multiomics data on kidney disease

artículo científico publicado en 2012

The KUPNetViz: a biological network viewer for multiple -omics datasets in kidney diseases

artículo científico publicado en 2013

The Monarch Initiative in 2019: an integrative data and analytic platform connecting phenotypes to genotypes across species

artículo científico publicado en 2020

The cellular microscopy phenotype ontology

artículo científico publicado en 2016

The health care and life sciences community profile for dataset descriptions

artículo científico publicado en 2016

The health care and life sciences community profile for dataset descriptions

The health care and life sciences community profile for dataset descriptions

The health care and life sciences community profile for dataset descriptions

article published in 2016

Using Ontologies and Vocabularies for Dynamic Linking

article

Using semantic web technologies to manage complexity and change in biomedical data

artículo científico publicado en 2011

Webulous and the Webulous Google Add-On--a web service and application for ontology building from templates

artículo científico publicado en 2016

eQTL Catalogue: a compendium of uniformly processed human gene expression and splicing QTLs

artículo científico publicado en 2020