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Lista de obras de Ehud Shapiro

A generic, cost-effective, and scalable cell lineage analysis platform

scientific article published on 24 August 2016

A library of programmable DNAzymes that operate in a cellular environment

artículo científico publicado en 2013

A mechanical Turing machine: blueprint for a biomolecular computer ⬇️

artículo científico publicado el 21 de marzo de 2012

A programmable NOR-based device for transcription profile analysis ⬇️

artículo científico publicado el 7 de septiembre de 2012

A synthetic biology approach for evaluating the functional contribution of designer cellulosome components to deconstruction of cellulosic substrates

artículo científico publicado en 2013

A universal mechanism ties genotype to phenotype in trinucleotide diseases

artículo científico publicado en 2007

Accuracy of Answers to Cell Lineage Questions Depends on Single-Cell Genomics Data Quality and Quantity

artículo científico publicado en 2016

Accurate, model-based tuning of synthetic gene expression using introns in S. cerevisiae

artículo científico publicado en 2014

Amplification of multiple genomic loci from single cells isolated by laser micro-dissection of tissues

artículo científico publicado en 2008

An autonomous molecular computer for logical control of gene expression

artículo científico publicado en 2004

Application of a stochastic name-passing calculus to representation and simulation of molecular processes

article

BioAmbients: an abstraction for biological compartments

article

Biotechnology: logic goes in vitro

artículo científico publicado en 2007

Cell biology. RNA computing in a living cell

artículo científico publicado en 2008

Cell lineage analysis of a mouse tumor

artículo científico publicado en 2008

Cell lineage analysis of acute leukemia relapse uncovers the role of replication-rate heterogeneity and microsatellite instability ⬇️

artículo científico publicado el 29 de mayo de 2012

Cell lineage analysis of the mammalian female germline

artículo científico publicado en 2012

Cells as computation

artículo científico publicado en 2002

Colon stem cell and crypt dynamics exposed by cell lineage reconstruction

artículo científico publicado en 2011

Comparing algorithms that reconstruct cell lineage trees utilizing information on microsatellite mutations

artículo científico publicado en 2013

Computer-Aided High-Throughput Cloning of Bacteria in Liquid Medium ⬇️

artículo científico publicado el 1 de febrero de 2011

Correcting the bias against interdisciplinary research

scientific article published on April 2014

DNA computing: Molecules reach consensus

artículo científico publicado en 2013

DNA molecule provides a computing machine with both data and fuel

artículo científico publicado en 2003

De novo DNA synthesis using single molecule PCR.

artículo científico publicado en 2008

De novo DNA synthesis using single-molecule PCR.

artículo científico publicado en 2012

Detection of Multiple Disease Indicators by an Autonomous Biomolecular Computer ⬇️

artículo científico publicado el 23 de junio de 2011

Erratum to: eSTGt: a programming and simulation environment for population dynamics ⬇️

artículo científico publicado en 2016

Estimating cell depth from somatic mutations

artículo científico publicado en 2008

Genomic variability within an organism exposes its cell lineage tree

artículo científico publicado en 2005

Geometric constraints on neuronal connectivity facilitate a concise synaptic adhesive code

artículo científico publicado en 2008

Heuristic for maximizing DNA reuse in synthetic DNA library assembly

artículo científico publicado en 2014

Identification of CTCF as a master regulator of the clustered protocadherin genes ⬇️

artículo científico publicado el 30 de diciembre de 2011

Lineage grammars: describing, simulating and analyzing population dynamics

artículo científico publicado en 2014

Mapping the translation initiation landscape of an S. cerevisiae gene using fluorescent proteins

artículo científico publicado en 2013

Molecular implementation of simple logic programs

artículo científico publicado en 2009

Muscle-bound primordial stem cells give rise to myofiber-associated myogenic and non-myogenic progenitors

artículo científico publicado en 2011

On the journey from nematode to human, scientists dive by the zebrafish cell lineage tree.

artículo científico publicado en 2018

Processing DNA molecules as text ⬇️

artículo científico publicado el 15 de junio de 2010

Programmable In Vivo Selection of Arbitrary DNA Sequences ⬇️

artículo científico publicado el 14 de noviembre de 2012

Rationally designed, heterologous S. cerevisiae transcripts expose novel expression determinants

artículo científico publicado en 2015

Reconstruction of cell lineage trees in mice

artículo científico publicado en 2008

Recursive Construction and Error Correction of DNA Molecules and Libraries from Synthetic and Natural DNA

artículo científico publicado el 1 de enero de 2011

Recursive construction of perfect DNA molecules and libraries from imperfect oligonucleotides

artículo científico publicado en 2012

Recursive construction of perfect DNA molecules from imperfect oligonucleotides

artículo científico publicado en 2008

Single cell analysis exposes intratumor heterogeneity and suggests that FLT3-ITD is a late event in leukemogenesis.

artículo científico publicado en 2014

Single-cell sequencing-based technologies will revolutionize whole-organism science ⬇️

artículo científico publicado el 30 de julio de 2013

Stochastic computing with biomolecular automata

artículo científico publicado en 2004

Synthesis and cell-free cloning of DNA libraries using programmable microfluidics

artículo científico publicado en 2015

Tapping the computing power of biological molecules gives rise to tiny machines that can speak directly to living cells.

artículo científico publicado en 2006

The Human Cell Atlas

The Human Cell Atlas White Paper ⬇️

artículo científico publicado en 2018

The family of concurrent logic programming languages

scholarly article by Ehud Shapiro published 1 September 1989 in ACM Computing Surveys

Towards molecular computers that operate in a biological environment

Using expression profiles of Caenorhabditis elegans neurons to identify genes that mediate synaptic connectivity

artículo científico publicado en 2008

eSTGt: a programming and simulation environment for population dynamics

artículo científico publicado en 2016

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