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Lista de obras de Edward M. Rubin

A high-resolution enhancer atlas of the developing telencephalon

artículo científico publicado en 2013

A phylogeny-driven genomic encyclopaedia of Bacteria and Archaea

artículo científico publicado en 2009

A regulatory SNP causes a human genetic disease by creating a new transcriptional promoter

artículo científico publicado en 2006

A vast collection of microbial genes that are toxic to bacteria

artículo científico publicado en 2012

Accelerated evolution of conserved noncoding sequences in humans

artículo científico publicado en 2006

Amplification of TruSeq ancient DNA libraries with AccuPrime Pfx: consequences on nucleotide misincorporation and methylation patterns

Analysis of apolipoprotein A5, c3, and plasma triglyceride concentrations in genetically engineered mice

artículo científico publicado en 2004

Apolipoprotein A-I and the molecular variant apoA-I(Milano): evaluation of the antiatherogenic effects in knock-in mouse model.

artículo científico publicado en 2005

Apolipoprotein A-V deficiency results in marked hypertriglyceridemia attributable to decreased lipolysis of triglyceride-rich lipoproteins and removal of their remnants

scientific journal article

Apolipoprotein A5, a crucial determinant of plasma triglyceride levels, is highly responsive to peroxisome proliferator-activated receptor alpha activators

artículo científico publicado en 2003

Apolipoprotein A5, a newly identified gene that affects plasma triglyceride levels in humans and mice

artículo científico publicado en 2003

Application of sequence-based methods in human microbial ecology

artículo científico publicado en 2006

Automated whole-genome multiple alignment of rat, mouse, and human

artículo científico publicado en 2004

ChIP-Seq identification of weakly conserved heart enhancers

artículo científico publicado en 2010

ChIP-seq accurately predicts tissue-specific activity of enhancers

artículo científico publicado en 2009

Characterization of the dog Agouti gene and a nonagoutimutation in German Shepherd Dogs

artículo científico publicado en 2004

Close sequence comparisons are sufficient to identify human cis-regulatory elements.

artículo científico publicado en 2006

Comparative genomic analysis reveals a distant liver enhancer upstream of the COUP-TFII gene

artículo científico publicado en 2005

Comparative genomic tools and databases: providing insights into the human genome

artículo científico publicado en 2003

Comparative genomics at the vertebrate extremes

artículo científico publicado en 2004

Comparative genomics reveals functional transcriptional control sequences in the Prop1 gene

artículo científico publicado en 2007

Comparative metagenomics reveals impact of contaminants on groundwater microbiomes

artículo científico publicado en 2015

Convergent evolution in primates and an insectivore.

artículo científico publicado en 2004

Critical Assessment of Metagenome Interpretation − a benchmark of computational metagenomics software

article

Critical Assessment of Metagenome Interpretation-a benchmark of metagenomics software.

artículo científico publicado en 2017

Cultivation and sequencing of rumen microbiome members from the Hungate1000 Collection.

artículo científico publicado en 2018

Deletion of ultraconserved elements yields viable mice

artículo científico publicado en 2007

Detection of weakly conserved ancestral mammalian regulatory sequences by primate comparisons

artículo científico publicado en 2007

Erratum: Corrigendum: Genome sequencing and analysis of the biomass-degrading fungus Trichoderma reesei (syn. Hypocrea jecorina)

scholarly article published in Nature Biotechnology

Evolution. Searching for new branches on the tree of life

artículo científico publicado en 2014

Exploiting human--fish genome comparisons for deciphering gene regulation

artículo científico publicado en 2004

Facile Recoding of Selenocysteine in Nature

artículo científico publicado en 2016

Fine tuning of craniofacial morphology by distant-acting enhancers

artículo científico publicado en 2013

Functional annotation of mouse mutations in embryonic stem cells by use of expression profiling

artículo científico

Functional autonomy of distant-acting human enhancers

artículo científico publicado en 2009

Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution

artículo científico publicado en 2004

Genome sequencing and analysis of the biomass-degrading fungus Trichoderma reesei (syn. Hypocrea jecorina)

artículo científico publicado en 2008

Genome-wide compendium and functional assessment of in vivo heart enhancers

artículo científico publicado en 2016

Genome-wide experimental determination of barriers to horizontal gene transfer.

artículo científico publicado en 2007

Genome-wide nucleosome map and cytosine methylation levels of an ancient human genome

artículo científico publicado en 2014

Genomic deletion of a long-range bone enhancer misregulates sclerostin in Van Buchem disease

artículo científico publicado en 2005

Genomic sequencing of Pleistocene cave bears

artículo científico publicado en 2005

Genomic views of distant-acting enhancers

artículo científico publicado en 2009

Global metagenomic survey reveals a new bacterial candidate phylum in geothermal springs

artículo científico publicado en 2016

Haplotype analysis of the apolipoprotein gene cluster on human chromosome 11.

artículo científico publicado en 2004

Haplotypes in the APOA1-C3-A4-A5 gene cluster affect plasma lipids in both humans and baboons

artículo científico publicado en 2004

High-throughput in vitro glycoside hydrolase (HIGH) screening for enzyme discovery

artículo científico publicado en 2011

Human-specific gain of function in a developmental enhancer

artículo científico publicado en 2008

Identification of ancient remains through genomic sequencing

artículo científico publicado en 2008

Improving the coverage of the cyanobacterial phylum using diversity-driven genome sequencing

artículo científico publicado en 2012

In vivo characterization of a vertebrate ultraconserved enhancer

artículo científico publicado en 2005

Initial sequencing and comparative analysis of the mouse genome

artículo científico publicado en 2002

Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter

artículo científico publicado en 2013

Insulin-mediated down-regulation of apolipoprotein A5 gene expression through the phosphatidylinositol 3-kinase pathway: role of upstream stimulatory factor

artículo científico publicado en 2005

Intraspecies sequence comparisons for annotating genomes

artículo científico publicado en 2004

Knockdown expression and hepatic deficiency reveal an atheroprotective role for SR-BI in liver and peripheral tissues

artículo científico publicado en 2006

Large-scale discovery of enhancers from human heart tissue

artículo científico publicado en 2011

Linkage and association between distinct variants of the APOA1/C3/A4/A5 gene cluster and familial combined hyperlipidemia

artículo científico publicado en 2003

Mapping cis-regulatory domains in the human genome using multi-species conservation of synteny.

artículo científico publicado en 2005

Megabase deletions of gene deserts result in viable mice

artículo científico publicado en 2004

Metagenome, metatranscriptome and single-cell sequencing reveal microbial response to Deepwater Horizon oil spill

artículo científico publicado en 2012

Metagenomic analysis of a permafrost microbial community reveals a rapid response to thaw

artículo científico publicado en 2011

Metagenomic insights into evolution of a heavy metal-contaminated groundwater microbial community

artículo científico publicado en 2010

Paleontology. New tricks with old bones

artículo científico publicado en 2008

Phylo-VISTA: An Interactive Visualization Tool for Multiple DNA Sequence Alignments

scholarly article published 1 April 2004

Phylo-VISTA: interactive visualization of multiple DNA sequence alignments

artículo científico publicado en 2004

Phylogenetic shadowing of primate sequences to find functional regions of the human genome

artículo científico publicado en 2003

Phylogenomically guided identification of industrially relevant GH1 β-glucosidases through DNA synthesis and nanostructure-initiator mass spectrometry

artículo científico publicado en 2014

Prehistoric genomes reveal the genetic foundation and cost of horse domestication

artículo científico publicado en 2014

Primate-specific evolution of an LDLR enhancer

artículo científico publicado en 2006

Progressive Loss of Function in a Limb Enhancer during Snake Evolution

artículo científico publicado en 2016

Rapid and pervasive changes in genome-wide enhancer usage during mammalian development

scientific article published on December 2013

Relative contribution of variation within the APOC3/A4/A5 gene cluster in determining plasma triglycerides

artículo científico publicado en 2002

SNPs in putative regulatory regions identified by human mouse comparative sequencing and transcription factor binding site data

artículo científico publicado en 2002

Scanning Human Gene Deserts for Long-Range Enhancers ⬇️

artículo científico publicado el 17 de octubre de 2003

Sequencing and analysis of Neanderthal genomic DNA

artículo científico publicado en 2006

Sequencing of multiple clostridial genomes related to biomass conversion and biofuel production

artículo científico publicado en 2010

Stop codon reassignments in the wild

artículo científico publicado en 2014

Strategies and tools for whole-genome alignments

artículo científico publicado en 2003

Symbiosis insights through metagenomic analysis of a microbial consortium

artículo científico publicado en 2006

Targeted deletion of the 9p21 non-coding coronary artery disease risk interval in mice

artículo científico publicado en 2010

Targeted replacement of mouse apolipoprotein A-I with human ApoA-I or the mutant ApoA-IMilano. Evidence of APOA-IM impaired hepatic secretion.

artículo científico publicado en 2002

Tenascin-X deficiency mimics Ehlers-Danlos syndrome in mice through alteration of collagen deposition

scientific journal article

The DNA sequence and biology of human chromosome 19

artículo científico publicado en 2004

The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 5

artículo científico publicado en 2004

The Epigenomic Landscape of Prokaryotes

artículo científico publicado en 2016

The airborne metagenome in an indoor urban environment

artículo científico publicado en 2008

The future of DNA sequencing

artículo científico publicado en 2017

The sequence and analysis of duplication-rich human chromosome 16

artículo científico publicado en 2004

Tissue-specific RNA expression marks distant-acting developmental enhancers

artículo científico publicado en 2014

Tissue-specific SMARCA4 binding at active and repressed regulatory elements during embryogenesis

artículo científico publicado en 2014

Tracking the in vivo evolution of multidrug resistance in Staphylococcus aureus by whole-genome sequencing

artículo científico publicado en 2007

Tracking the origins of Yakutian horses and the genetic basis for their fast adaptation to subarctic environments

artículo científico publicado en 2015

Transfer RNAs with novel cloverleaf structures

artículo científico publicado en 2016

Two independent apolipoprotein A5 haplotypes influence human plasma triglyceride levels

artículo científico publicado en 2002

Ultraconservation identifies a small subset of extremely constrained developmental enhancers

artículo científico publicado en 2008

Uncovering Earth’s virome

artículo científico publicado en 2016

[Facile Recoding of Selenocysteine in Nature].

artículo científico publicado en 2016

rVista for comparative sequence-based discovery of functional transcription factor binding sites

artículo científico publicado en 2002

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