Filtros de búsqueda

Lista de obras de Takashi Gojobori

A comparison of the molecular clock of hepatitis C virus in the United States and Japan predicts that hepatocellular carcinoma incidence in the United States will increase over the next two decades ⬇️

artículo científico publicado en 2002

A comprehensive survey of human polymorphisms at conserved splice dinucleotides and its evolutionary relationship with alternative splicing

artículo científico publicado en 2010

A genome-wide survey of the genes for planar polarity signaling or convergent extension-related genes in Ciona intestinalis and phylogenetic comparisons of evolutionary conserved signaling components

artículo científico publicado en 2003

A large variation in the rates of synonymous substitution for RNA viruses and its relationship to a diversity of viral infection and transmission modes

artículo científico publicado en 2004

A new database (GCD) on genome composition for eukaryote and prokaryote genome sequences and their initial analyses

artículo científico publicado en 2012

A non-sulfated chondroitin stabilizes membrane tubulation in cnidarian organelles

artículo científico publicado en 2010

A polymerase chain reaction-based method for cloning novel members of a gene family using a combination of degenerate and inhibitory primers

artículo científico publicado en 2002

A prioritization analysis of disease association by data-mining of functional annotation of human genes

artículo científico publicado en 2011

A reduction in selective immune pressure during the course of chronic hepatitis C correlates with diminished biochemical evidence of hepatic inflammation

artículo científico publicado en 2006

A web-based interactive developmental table for the ascidian Ciona intestinalis, including 3D real-image embryo reconstructions: I. From fertilized egg to hatching larva

artículo científico publicado en 2007

Accelerated pseudogenization on the neo-X chromosome in Drosophila miranda

artículo científico publicado en 2016

Adaptive divergence with gene flow in incipient speciation of Miscanthus floridulus/sinensis complex (Poaceae).

artículo científico publicado en 2014

Alternative splicing in human transcriptome: functional and structural influence on proteins.

artículo científico publicado en 2006

An evolutionary origin and selection process of goldfish

artículo científico publicado en 2008

Basin-scale seasonal changes in marine free-living bacterioplankton community in the Ofunato Bay

article

Biased biological functions of horizontally transferred genes in prokaryotic genomes

artículo científico publicado en 2004

Binary classification of protein molecules into intrinsically disordered and ordered segments ⬇️

artículo científico publicado el 22 de junio de 2011

Brachyury-downstream gene sets in a chordate, Ciona intestinalis: integrating notochord specification, morphogenesis and chordate evolution

artículo científico publicado en 2008

Building a bio-based industry in the Middle East through harnessing the potential of the Red Sea biodiversity

artículo científico publicado en 2017

CIBEX: center for information biology gene expression database

artículo científico publicado en 2003

CIG-DB: the database for human or mouse immunoglobulin and T cell receptor genes available for cancer studies

artículo científico publicado en 2010

Cancer-related mutations in BRCA1-BRCT cause long-range structural changes in protein-protein binding sites: a molecular dynamics study

artículo científico publicado en 2007

Cilium evolution: identification of a novel protein, nematocilin, in the mechanosensory cilium of Hydra nematocytes

artículo científico publicado en 2008

Clone identification in Japanese flowering cherry (<i>Prunus</i> subgenus <i>Cerasus</i>) cultivars using nuclear SSR markers ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2012

Cloning and functional analysis of ascidian Mitf in vivo: insights into the origin of vertebrate pigment cells

artículo científico publicado en 2003

Coevolution of axon guidance molecule Slit and its receptor Robo

artículo científico publicado en 2014

Comparative analysis of gene expression for convergent evolution of camera eye between octopus and human

artículo científico publicado en 2004

Comparative analysis of the base biases at the gene terminal portions in seven eukaryote genomes

artículo científico publicado en 2003

Comparative complete genome sequence analysis of the amino acid replacements responsible for the thermostability of Corynebacterium efficiens

artículo científico publicado en 2003

Comparative genome analyses of nervous system-specific genes

artículo científico publicado en 2005

Comparative genome analysis of three eukaryotic parasites with differing abilities to transform leukocytes reveals key mediators of Theileria-induced leukocyte transformation

artículo científico publicado en 2012

Comparative genomic analysis of translation initiation mechanisms for genes lacking the Shine-Dalgarno sequence in prokaryotes

artículo científico publicado en 2017

Comparative genomics of bidirectional gene pairs and its implications for the evolution of a transcriptional regulation system

artículo científico publicado en 2005

Comparative miRNAs analysis of Two contrasting broccoli inbred lines with divergent head-forming capacity under temperature stress

artículo científico publicado en 2015

Comparative sequencing of human and chimpanzee MHC class I regions unveils insertions/deletions as the major path to genomic divergence

artículo científico publicado en 2003

Comparative study of flux redistribution of metabolic pathway in glutamate production by two coryneform bacteria

artículo científico publicado en 2005

Comparison of gene expression profile of epiretinal membranes obtained from eyes with proliferative vitreoretinopathy to that of secondary epiretinal membranes

artículo científico publicado en 2013

Computational analysis and functional expression of ancestral copepod luciferase

artículo científico publicado en 2013

Corrigendum: The genome of Chenopodium quinoa

artículo científico publicado en 2017

Curated genome annotation of Oryza sativa ssp. japonica and comparative genome analysis with Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 2007

DDBJ dealing with mass data produced by the second generation sequencer

artículo científico publicado en 2008

DDBJ in preparation for overview of research activities behind data submissions.

artículo científico publicado en 2006

DDBJ launches a new archive database with analytical tools for next-generation sequence data

artículo científico publicado en 2009

DDBJ progress report

artículo científico publicado en 2011

DDBJ working on evaluation and classification of bacterial genes in INSDC

artículo científico publicado en 2006

DESM: portal for microbial knowledge exploration systems

artículo científico publicado en 2015

Databases of the marine metagenomics

artículo científico publicado en 2015

Degeneration after sexual differentiation in hydra and its relevance to the evolution of aging

artículo científico publicado en 2006

Detecting linkage between a trait and a marker in a random mating population without pedigree record

artículo científico publicado en 2009

Detection of apoptosis during planarian regeneration by the expression of apoptosis-related genes and TUNEL assay

artículo científico publicado en 2004

Development of an accurate classification system of proteins into structured and unstructured regions that uncovers novel structural domains: its application to human transcription factors

artículo científico publicado en 2009

Different Endosymbiotic Interactions in Two Hydra Species Reflect the Evolutionary History of Endosymbiosis

artículo científico publicado en 2016

Differential evolutionary rates of duplicated genes in protein interaction network

artículo científico publicado en 2006

Dissecting planarian central nervous system regeneration by the expression of neural-specific genes

artículo científico publicado en 2002

Distribution and effects of nonsense polymorphisms in human genes

artículo científico publicado en 2008

Diversity of preferred nucleotide sequences around the translation initiation codon in eukaryote genomes

artículo científico publicado en 2008

Dopamine receptor genes and evolutionary differentiation in the domestication of fighting cocks and long-crowing chickens

artículo científico publicado en 2014

Dynamic evolution of endogenous retrovirus-derived genes expressed in bovine conceptuses during the period of placentation

artículo científico publicado en 2013

Dynamic evolution of translation initiation mechanisms in prokaryotes

artículo científico publicado en 2010

Ecological genomics in Xanthomonas: the nature of genetic adaptation with homologous recombination and host shifts

artículo científico publicado en 2015

Editor’s Report for Genome Biology and Evolution, 2013.

artículo científico publicado en 2013

Endogenous non-retroviral RNA virus elements in mammalian genomes

artículo científico publicado en 2010

Estimation of ancestral gene set of bilaterian animals and its implication to dynamic change of gene content in bilaterian evolution

artículo científico publicado en 2005

Eukaryotic nuclear structure explains the evolutionary rate difference of ribosome export factors

artículo científico publicado en 2008

Evola: Ortholog database of all human genes in H-InvDB with manual curation of phylogenetic trees

artículo científico publicado en 2007

Evolution of Pacific Ocean and the Sea of Japan populations of the gobiid species, Pterogobius elapoides and Pterogobius zonoleucus, based on molecular and morphological analyses

artículo científico publicado en 2008

Evolution of bioluminescence in marine planktonic copepods

artículo científico publicado en 2012

Evolution of complex structures: minicollagens shape the cnidarian nematocyst

artículo científico publicado en 2008

Evolution of metabolic networks by gain and loss of enzymatic reaction in eukaryotes

artículo científico publicado en 2005

Evolution of vitamin B6 (pyridoxine) metabolism by gain and loss of genes

artículo científico publicado en 2004

Evolutionarily conserved transcription factor Apontic controls the G1/S progression by inducing cyclin E during eye development

artículo científico publicado en 2014

Evolutionary Transitions of MicroRNA-Target Pairs

artículo científico publicado en 2016

Evolutionary changes of multiple visual pigment genes in the complete genome of Pacific bluefin tuna

artículo científico publicado en 2013

Evolutionary conserved microRNAs are ubiquitously expressed compared to tick-specific miRNAs in the cattle tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus

artículo científico publicado en 2011

Evolutionary history of dog rabies in Brazil ⬇️

artículo científico publicado el 6 de octubre de 2010

Evolutionary origin of sex-related genes in the mouse brain

artículo científico publicado en 2007

Evolutionary patterns of recently emerged animal duplogs

artículo científico publicado en 2011

Evolutionary process of amino acid biosynthesis in Corynebacterium at the whole genome level

artículo científico publicado en 2004

Exploration and grading of possible genes from 183 bacterial strains by a common protocol to identification of new genes: Gene Trek in Prokaryote Space (GTPS).

artículo científico publicado en 2006

Eye-like ocelloids are built from different endosymbiotically acquired components

artículo científico publicado en 2015

FARNA: knowledgebase of inferred functions of non-coding RNA transcripts

artículo científico publicado en 2016

FGFR-related gene nou-darake restricts brain tissues to the head region of planarians

artículo científico publicado en 2002

Finding Nemo's Genes: A chromosome-scale reference assembly of the genome of the orange clownfish Amphiprion percula

article

Finding Nemo’s Genes: A chromosome-scale reference assembly of the genome of the orange clownfish Amphiprion percula

article

Function and evolutionary origin of unicellular camera-type eye structure

artículo científico publicado en 2015

G-compass: a web-based comparative genome browser between human and other vertebrate genomes

artículo científico publicado en 2009

GBE Editor's Report.

artículo científico publicado en 2010

GBE Editor’s Report.

artículo científico publicado en 2012

Gene cluster analysis method identifies horizontally transferred genes with high reliability and indicates that they provide the main mechanism of operon gain in 8 species of gamma-Proteobacteria

artículo científico publicado en 2006

Gene dosage imbalance of human chromosome 21 in mouse embryonic stem cells differentiating to neurons

artículo científico publicado en 2011

Gene expression profile of fibrovascular membranes from patients with proliferative diabetic retinopathy

artículo científico publicado en 2009

Genetic polymorphism of the swine major histocompatibility complex (SLA) class�I genes, SLA-1, -2 and -3 ⬇️

artículo científico publicado el 7 de noviembre de 2003

Genetic stability of human T lymphotropic virus type I despite antiviral pressures by CTLs

artículo científico publicado en 2007

Genome and transcriptome analysis of the food-yeast Candida utilis

artículo científico publicado en 2012

Global Ramifications of Dust and Sandstorm Microbiota

scientific article published in 2018

H-DBAS: alternative splicing database of completely sequenced and manually annotated full-length cDNAs based on H-Invitational

artículo científico publicado en 2007

H-DBAS: human-transcriptome database for alternative splicing: update 2010

artículo científico publicado en 2009

H-InvDB in 2009: extended database and data mining resources for human genes and transcripts

artículo científico publicado en 2009

H-InvDB in 2013: an omics study platform for human functional gene and transcript discovery

artículo científico publicado en 2012

Haemophilus influenzae

artículo científico publicado en 2003

Highly conserved upstream sequences for transcription factor genes and implications for the regulatory network

artículo científico publicado en 2004

Human genome network platform: a resource for TFRN analysis

artículo científico publicado en 2014

Identification of neurotransmitter receptor genes under significantly relaxed selective constraint by orthologous gene comparisons between humans and rodents

artículo científico publicado en 2002

In silico chromosome staining: reconstruction of Giemsa bands from the whole human genome sequence

artículo científico publicado en 2002

In silico exploration of Red Sea Bacillus genomes for natural product biosynthetic gene clusters.

artículo científico publicado en 2018

Increasing genetic diversity of hepatitis C virus in haemophiliacs with human immunodeficiency virus coinfection

artículo científico publicado en 2007

Induction of a noggin-like gene by ectopic DV interaction during planarian regeneration

artículo científico publicado en 2002

Infectious endogenous retroviruses in cats and emergence of recombinant viruses

artículo científico publicado en 2012

Influences of diurnal sampling bias on fixed-point monitoring of plankton biodiversity determined using a massively parallel sequencing-based technique

artículo científico publicado en 2015

Innexin gap junctions in nerve cells coordinate spontaneous contractile behavior in Hydra polyps

artículo científico publicado en 2014

Integrated database (2): Data oriented approach to genome network informatics

artículo científico publicado en 2004

Integrative annotation of 21,037 human genes validated by full-length cDNA clones

artículo científico publicado en 2004

Introduction to the Special Series

artículo científico publicado en 2011

Investigation of protein functions through data-mining on integrated human transcriptome database, H-Invitational database (H-InvDB).

artículo científico publicado en 2005

Large-scale identification and characterization of alternative splicing variants of human gene transcripts using 56,419 completely sequenced and manually annotated full-length cDNAs

artículo científico publicado en 2006

Length variation of CAG/CAA triplet repeats in 50 genes among 16 inbred mouse strains

artículo científico publicado en 2005

Long-range neural and gap junction protein-mediated cues control polarity during planarian regeneration

artículo científico publicado en 2009

Long-range neural and gap junction protein-mediated cues control polarity during planarian regeneration

Low conservation and species-specific evolution of alternative splicing in humans and mice: comparative genomics analysis using well-annotated full-length cDNAs

artículo científico publicado en 2008

Low genetic diversities of rabies virus populations within different hosts in Brazil

artículo científico publicado en 2009

Mapping human genetic diversity in Asia

artículo científico publicado en 2009

Mapping of chimpanzee full-length cDNAs onto the human genome unveils large potential divergence of the transcriptome

artículo científico publicado en 2007

Marine Metagenome as A Resource for Novel Enzymes

artículo científico publicado en 2015

Marine metagenomics as a source for bioprospecting

artículo científico publicado en 2015

Maser: one-stop platform for NGS big data from analysis to visualization

artículo científico publicado en 2018

Metabolic efficiency and amino acid composition in the proteomes of Escherichia coli and Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2002

Metagenome-based diversity analyses suggest a strong locality signal for bacterial communities associated with oyster aquaculture farms in Ofunato Bay

article

Metagenomic studies of the Red Sea.

artículo científico publicado en 2015

Methods for incorporating the hypermutability of CpG dinucleotides in detecting natural selection operating at the amino acid sequence level

artículo científico publicado en 2009

Microarray analysis of embryonic retinoic acid target genes in the ascidian Ciona intestinalis

artículo científico publicado en 2003

Midline governs axon pathfinding by coordinating expression of two major guidance systems

scientific article published on May 2009

Molecular characterization of the Pb recombination hotspot in the mouse major histocompatibility complex class II region

artículo científico publicado en 2002

Molecular evolutionary analyses implicate injection treatment for schistosomiasis in the initial hepatitis C epidemics in Japan

artículo científico publicado en 2005

Molecular hierarchy in neurons differentiated from mouse ES cells containing a single human chromosome 21.

artículo científico publicado en 2004

Multiple plastids collected by the dinoflagellate Dinophysis mitra through kleptoplastidy

artículo científico publicado en 2011

Nematogalectin, a nematocyst protein with GlyXY and galectin domains, demonstrates nematocyte-specific alternative splicing in Hydra

artículo científico publicado en 2010

No Evidence for Temperature-Dependence of the COVID-19 Epidemic

artículo científico publicado en 2020

Novel algorithm for automated genotyping of microsatellites

artículo científico publicado en 2004

Optimized ancestral state reconstruction using Sankoff parsimony

artículo científico publicado en 2009

Origin and evolutionary process of the CNS elucidated by comparative genomics analysis of planarian ESTs

artículo científico publicado en 2003

Origins of Japanese flowering cherry (Prunus subgenus Cerasus) cultivars revealed using nuclear SSR markers

artículo científico publicado en 2014

PATHcre8: A Tool That Facilitates the Searching for Heterologous Biosynthetic Routes

artículo científico publicado en 2020

Patterns of nucleotide substitution in pseudogenes and functional genes

article

Phylogenetic analysis of the complete genome of 18 Norwalk-like viruses

artículo científico publicado en 2002

Pigment cell lineage-specific expression activity of the ascidian tyrosinase-related gene

artículo científico publicado en 2004

Prediction of protein-destabilizing polymorphisms by manual curation with protein structure

artículo científico publicado en 2012

Radical amino acid change versus positive selection in the evolution of viral envelope proteins

artículo científico publicado en 2006

Rapid evolution of major histocompatibility complex class I genes in primates generates new disease alleles in humans via hitchhiking diversity

artículo científico publicado en 2006

Rate of evolution in brain-expressed genes in humans and other primates

artículo científico publicado en 2007

Search for the evolutionary origin of a brain: planarian brain characterized by microarray

artículo científico publicado en 2003

Seasonal changes in the abundance of bacterial genes related to dimethylsulfoniopropionate catabolism in seawater from Ofunato Bay revealed by metagenomic analysis

article

Seasonal changes in the communities of photosynthetic picoeukaryotes in Ofunato Bay as revealed by shotgun metagenomic sequencing

article

Selection pressure on human STR loci and its relevance in repeat expansion disease

artículo científico publicado en 2016

Single-cell technologies in environmental omics

artículo científico

Speciation of two gobioid species, Pterogobius elapoides and Pterogobius zonoleucus revealed by multi-locus nuclear and mitochondrial DNA analyses

artículo científico publicado en 2015

Specific expression of Gsta4 in mouse cochlear melanocytes: a novel role for hearing and melanocyte differentiation

artículo científico publicado en 2008

Strong positive selection and recombination drive the antigenic variation of the PilE protein of the human pathogen Neisseria meningitidis

artículo científico publicado en 2004

Substitution rate and structural divergence of 5'UTR evolution: comparative analysis between human and cynomolgus monkey cDNAs

artículo científico publicado en 2005

Systems medicine and integrated care to combat chronic noncommunicable diseases

artículo científico publicado en 2011

TACT: Transcriptome Auto-annotation Conducting Tool of H-InvDB.

artículo científico publicado en 2006

TOWARDS COORDINATED INTERNATIONAL SUPPORT OF CORE DATA RESOURCES FOR THE LIFE SCIENCES

artículo científico publicado en 2017

TP Atlas: integration and dissemination of advances in Targeted Proteins Research Program (TPRP)—structural biology project phase II in Japan ⬇️

artículo científico publicado el 29 de mayo de 2012

Taxonomic profiles in metagenomic analyses of free-living microbial communities in the Ofunato Bay

article

The DNA Data Bank of Japan launches a new resource, the DDBJ Omics Archive of functional genomics experiments ⬇️

artículo científico publicado en 2011

The GTOP database in 2009: updated content and novel features to expand and deepen insights into protein structures and functions.

artículo científico publicado en 2008

The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts

artículo científico publicado en 2008

The Human Anatomic Gene Expression Library (H-ANGEL), the H-Inv integrative display of human gene expression across disparate technologies and platforms

artículo científico publicado en 2005

The Promoter Signatures in Rice LEA Genes Can Be Used to Build a Co-expressing LEA Gene Network

article

The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): 2008 update

artículo científico publicado en 2007

The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): hub for Oryza sativa ssp. japonica genome information

artículo científico publicado en 2006

The Temporal Sequence of the Mammalian Neocortical Neurogenetic Program Drives Mediolateral Pattern in the Chick Pallium ⬇️

artículo científico publicado el 15 de marzo de 2012

The dynamic genome of Hydra

artículo científico publicado en 2010

The evolutionary emergence of cell type-specific genes inferred from the gene expression analysis of Hydra

artículo científico publicado en 2007

The evolutionary origin of long-crowing chicken: its evolutionary relationship with fighting cocks disclosed by the mtDNA sequence analysis

artículo científico publicado en 2004

The evolutionary position of nematodes

artículo científico publicado en 2002

The evolutionary relationship between gene duplication and alternative splicing

artículo científico publicado en 2008

The evolutionary study of small RNA-directed gene silencing pathways by investigating RNase III enzymes

artículo científico publicado en 2009

The expression of neural-specific genes reveals the structural and molecular complexity of the planarian central nervous system

artículo científico publicado en 2002

The first symbiont-free genome sequence of marine red alga, Susabi-nori (Pyropia yezoensis)

artículo científico publicado en 2013

The genome sequence and structure of rice chromosome 1.

artículo científico publicado en 2002

The genome stability in Corynebacterium species due to lack of the recombinational repair system ⬇️

artículo científico publicado el 23 de octubre de 2003

The mitochondrial genome of the pufferfish, Fugu rubripes, and ordinal teleostean relationships

artículo científico publicado en 2002

The origin and evolution of porcine reproductive and respiratory syndrome viruses

artículo científico publicado en 2005

The transcript repeat element: the human Alu sequence as a component of gene networks influencing cancer

scientific article published on August 2010

The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line.

artículo científico publicado en 2009

Tissue- and stage-dependent dosage compensation on the neo-X chromosome in Drosophila pseudoobscura

artículo científico publicado en 2013

Towards BioDBcore: a community-defined information specification for biological databases

artículo científico publicado en 2011

Towards BioDBcore: a community-defined information specification for biological databases

artículo científico publicado en 2011

Transcriptional interferences in cis natural antisense transcripts of humans and mice

artículo científico publicado en 2007

Two different classes of co-occurring motif pairs found by a novel visualization method in human promoter regions

artículo científico publicado en 2008

Two-step evolution of endosymbiosis between hydra and algae

artículo científico publicado en 2016

V-GAP: Viral genome assembly pipeline

artículo científico publicado en 2015

VaProS: a database-integration approach for protein/genome information retrieval

artículo científico publicado en 2016

VarySysDB: a human genetic polymorphism database based on all H-InvDB transcripts

artículo científico publicado en 2008

Welcome to Genome Biology and Evolution

artículo científico publicado en 2009

Where is the origin of the Japanese gamecocks?

artículo científico publicado en 2003

Whole genome association study of rheumatoid arthritis using 27 039 microsatellites

artículo científico publicado en 2005

Whole-genome screening indicates a possible burst of formation of processed pseudogenes and Alu repeats by particular L1 subfamilies in ancestral primates

artículo científico publicado en 2003

Zuckerkandl Prize

artículo científico publicado en 2002

cimp1, a novel astacin family metalloproteinase gene from East African cichlids, is differentially expressed between species during growth

artículo científico publicado en 2005

magp4 gene may contribute to the diversification of cichlid morphs and their speciation

artículo científico publicado en 2006

Obituary: Masatoshi Nei (1931–2023) ⬇️

artículo científico publicado en 2023

grandes datos: el futuro de la biocuración

artículo científico publicado en 2008

Dominio Público Uruguay está sostenido por:

Acerca de Dominio Público Uruguay

Ayuda