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Lista de obras de Steven Jones

'Inductive' charges on atoms in proteins: comparative docking with the extended steroid benchmark set and discovery of a novel SHBG ligand.

artículo científico publicado en 2005

A BAC clone fingerprinting approach to the detection of human genome rearrangements

artículo científico publicado en 2007

A Computational Approach to Finding Novel Targets for Existing Drugs

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 2011

A Hematogenous Route for Medulloblastoma Leptomeningeal Metastases.

artículo científico publicado en 2018

A Notch-dependent transcriptional hierarchy promotes mesenchymal transdifferentiation in the cardiac cushion.

artículo científico publicado en 2014

A Scalable Strand-Specific Protocol Enabling Full-Length Total RNA Sequencing From Single Cells

artículo científico publicado en 2021

A clinically validated diagnostic second-generation sequencing assay for detection of hereditary BRCA1 and BRCA2 mutations.

artículo científico publicado en 2013

A collaborative filtering based approach to biomedical knowledge discovery

artículo científico publicado en 2017

A functional genomic analysis of cell morphology using RNA interference

artículo científico publicado en 2003

A modified polymerase chain reaction-long serial analysis of gene expression protocol identifies novel transcripts in human CD34+ bone marrow cells

artículo científico publicado en 2007

A mouse atlas of gene expression: large-scale digital gene-expression profiles from precisely defined developing C57BL/6J mouse tissues and cells.

artículo científico publicado en 2005

A new frontier in personalized cancer therapy: mapping molecular changes.

scientific article published on July 2011

A new quinoline-based chemical probe inhibits the autophagy-related cysteine protease ATG4B

scientific article published in Scientific Reports

A novel mutation in EED associated with overgrowth

artículo científico publicado en 2015

A novel small-molecule inhibitor of the avian influenza H5N1 virus determined through computational screening against the neuraminidase.

artículo científico publicado en 2009

A pan-cancer analysis of alternative splicing events reveals novel tumor-associated splice variants of matriptase.

artículo científico publicado en 2014

A physical map of the highly heterozygous Populus genome: integration with the genome sequence and genetic map and analysis of haplotype variation

article

A physical map of the human genome

artículo científico publicado en 2001

A physical map of the mouse genome

artículo científico publicado en 2002

A platform for oncogenomic reporting and interpretation

artículo científico publicado en 2022

A set of BAC clones spanning the human genome

artículo científico publicado en 2004

A somatic reference standard for cancer genome sequencing

artículo científico publicado en 2016

A-to-I miR-378a-3p editing can prevent melanoma progression via regulation of PARVA expression

artículo científico publicado en 2018

ABySS: a parallel assembler for short read sequence data

artículo científico publicado en 2009

ACE 2 Coding Variants: A Potential X-linked Risk Factor for COVID-19 Disease

artículo científico publicado en 2020

ALEA: a toolbox for allele-specific epigenomics analysis

artículo científico publicado en 2014

ATR-X syndrome protein targets tandem repeats and influences allele-specific expression in a size-dependent manner.

artículo científico publicado en 2010

Ab initio parameterization of YFF1, a universal force field for drug-design applications

artículo científico publicado en 2011

Allelic ratios and the mutational landscape reveal biologically significant heterozygous SNVs

artículo científico publicado en 2012

Altered Gene Expression along the Glycolysis-Cholesterol Synthesis Axis Is Associated with Outcome in Pancreatic Cancer

artículo científico publicado en 2019

An approach to large scale identification of non-obvious structural similarities between proteins

artículo científico publicado en 2004

Analysis of FOXO1 mutations in diffuse large B-cell lymphoma

artículo científico publicado en 2013

Analysis of Normal Human Mammary Epigenomes Reveals Cell-Specific Active Enhancer States and Associated Transcription Factor Networks

artículo científico publicado en 2016

Analysis of Ugandan cervical carcinomas identifies human papillomavirus clade-specific epigenome and transcriptome landscapes

artículo científico publicado en 2020

Analysis of long-lived C. elegans daf-2 mutants using serial analysis of gene expression

artículo científico publicado en 2005

Analysis of the genome and transcriptome of Cryptococcus neoformans var. grubii reveals complex RNA expression and microevolution leading to virulence attenuation

artículo científico publicado en 2014

Annotating the regulatory genome.

artículo científico publicado en 2010

Application of genomics to identify therapeutic targets in recurrent pediatric papillary thyroid carcinoma.

artículo científico publicado en 2018

Assembling millions of short DNA sequences using SSAKE.

artículo científico publicado en 2006

Assembly of the Complete Sitka Spruce Chloroplast Genome Using 10X Genomics' GemCode Sequencing Data.

artículo científico publicado en 2016

Assessment and integration of publicly available SAGE, cDNA microarray, and oligonucleotide microarray expression data for global coexpression analyses.

artículo científico publicado en 2005

Assessment of SAGE in Transcript Identification

artículo científico publicado el 12 de mayo de 2003

Author Correction: Transcription phenotypes of pancreatic cancer are driven by genomic events during tumor evolution

artículo científico publicado en 2020

Beta-catenin expression is prognostic of improved non–small cell lung cancer survival

article published in 2012

BreakFusion: targeted assembly-based identification of gene fusions in whole transcriptome paired-end sequencing data

artículo científico publicado en 2012

Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) regulates RNA polymerase II serine 2 phosphorylation in human CD4+ T cells

artículo científico publicado en 2012

CGMIM: automated text-mining of Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) to identify genetically-associated cancers and candidate genes

artículo científico publicado en 2005

CancerMine: a literature-mined resource for drivers, oncogenes and tumor suppressors in cancer

scientific article published on 20 May 2019

Cell cycle regulators show diagnostic and prognostic utility for differentiated thyroid cancer

artículo científico publicado en 2007

ChAsE: chromatin analysis and exploration tool.

artículo científico publicado en 2016

Characterization of the human thyroid epigenome.

artículo científico

Circos: an information aesthetic for comparative genomics

artículo científico publicado en 2009

Clinical utility of type 1 growth factor receptor expression in colon cancer

artículo científico publicado en 2008

Clonal expansion and epigenetic reprogramming following deletion or amplification of mutant IDH1.

artículo científico publicado en 2017

Combined serial analysis of gene expression and transcription factor binding site prediction identifies novel-candidate-target genes of Nr2e1 in neocortex development

artículo científico publicado en 2015

Complete Chloroplast Genome Sequence of a White Spruce (Picea glauca, Genotype WS77111) from Eastern Canada

artículo científico publicado en 2019

Complete Chloroplast Genome Sequence of an Engelmann Spruce (Picea engelmannii, Genotype Se404-851) from Western Canada

artículo científico publicado en 2019

Complete Genome Sequence of Mycobacterium chimaera SJ42, a Nonoutbreak Strain from an Immunocompromised Patient with Pulmonary Disease

artículo científico publicado en 2017

Complete genomic landscape of a recurring sporadic parathyroid carcinoma

artículo científico publicado el 1 de julio de 2013

Complex Autism Spectrum Disorder with Epilepsy, Strabismus and Self-Injurious Behaviors in a Patient with a De Novo Heterozygous <i>POLR2A</i> Variant

artículo científico publicado en 2022

Compound heterozygous TRPV4 mutations in two siblings with a complex phenotype including severe intellectual disability and neuropathy

artículo científico publicado en 2017

Comprehensive genomic profiling of glioblastoma tumors, BTICs, and xenografts reveals stability and adaptation to growth environments

scientific article published on 30 August 2019

Comprehensive whole genome sequence analyses yields novel genetic and structural insights for Intellectual Disability.

artículo científico publicado en 2017

Coordinated expression of galectin-3 and caveolin-1 in thyroid cancer.

artículo científico publicado en 2012

Cross-cancer profiling of molecular alterations within the human autophagy interaction network

artículo científico publicado en 2015

Cryptococcus neoformans gene expression during experimental cryptococcal meningitis

artículo científico publicado en 2003

DNA methylation and SETDB1/H3K9me3 regulate predominantly distinct sets of genes, retroelements, and chimeric transcripts in mESCs

artículo científico publicado en 2011

De Novo Sequencing, Assembly, and Annotation of Four Threespine Stickleback Genomes Based on Microfluidic Partitioned DNA Libraries

artículo científico publicado en 2019

De novo assembly and analysis of RNA-seq data.

artículo científico publicado en 2010

Defects in the IFT-B component IFT172 cause Jeune and Mainzer-Saldino syndromes in humans

artículo científico publicado en 2013

Delving into Early Onset Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: How Does Age Fit In?

scientific article published on 21 September 2020

Detection and management of hypothyroidism following thyroid lobectomy: evaluation of a clinical algorithm

artículo científico publicado en 2011

Determinants of Tc-99m sestamibi SPECT scan sensitivity in primary hyperparathyroidism

article

Diagnostic utility of galectin-3 in thyroid cancer.

artículo científico publicado en 2010

Diagnostic value of next-generation sequencing in an unusual sphenoid tumor.

artículo científico publicado en 2014

Differential roles of RET isoforms in medullary and papillary thyroid carcinomas.

artículo científico publicado en 2016

Discovery of novel alternatively spliced C. elegans transcripts by computational analysis of SAGE data

artículo científico publicado en 2007

DiscoverySpace: an interactive data analysis application

artículo científico publicado en 2007

Draft genome of the mountain pine beetle, Dendroctonus ponderosae Hopkins, a major forest pest

artículo científico publicado en 2013

Drug repositioning for personalized medicine.

artículo científico publicado en 2012

Dynamic remodeling of individual nucleosomes across a eukaryotic genome in response to transcriptional perturbation

artículo científico publicado en 2008

ELT-2 is the predominant transcription factor controlling differentiation and function of the C. elegans intestine, from embryo to adult.

artículo científico publicado en 2008

Effect of TERT and ATM on gene expression profiles in human fibroblasts.

artículo científico publicado en 2004

Endogenous retrovirus transcript levels are associated with immunogenic signatures in multiple metastatic cancer types

artículo científico publicado en 2020

Epigenetic and transcriptional determinants of the human breast

artículo científico publicado en 2015

Establishing a Framework for the Clinical Translation of Germline Findings in Precision Oncology

artículo científico publicado en 2020

Evaluation of protocols for rRNA depletion-based RNA sequencing of nanogram inputs of mammalian total RNA

scientific article published on 31 October 2019

Evaluation of type 1 growth factor receptor family expression in benign and malignant thyroid lesions

artículo científico publicado en 2008

Evolution of gene structure in the conifer Picea glauca: a comparative analysis of the impact of intron size

artículo científico publicado en 2014

Evolutionary and Biomedical Insights from the Rhesus Macaque Genome

artículo científico publicado en 2007

Exome sequencing identifies a novel variant in ACTC1 associated with familial atrial septal defect.

artículo científico publicado en 2013

Expression of Gp78/Autocrine Motility Factor Receptor and Endocytosis of Autocrine Motility Factor in Human Thyroid Cancer Cells

artículo científico publicado en 2019

FindPeaks 3.1: a tool for identifying areas of enrichment from massively parallel short-read sequencing technology

artículo científico publicado en 2008

Functional genomics of the cilium, a sensory organelle

scientific journal article

GA4GH: International policies and standards for data sharing across genomic research and healthcare

artículo científico publicado en 2021

GPSM2 mutations cause the brain malformations and hearing loss in Chudley-McCullough syndrome

artículo científico publicado en 2012

Gene discovery for the bark beetle-vectored fungal tree pathogen Grosmannia clavigera.

artículo científico publicado en 2010

Gene expression profiling of oxidative stress response of C. elegans aging defective AMPK mutants using massively parallel transcriptome sequencing.

artículo científico publicado en 2011

Gene number in an invertebrate chordate, Ciona intestinalis

artículo científico publicado en 1998

Generation and annotation of lodgepole pine and oleoresin-induced expressed sequences from the blue-stain fungus Ophiostoma clavigerum, a Mountain Pine Beetle-associated pathogen

artículo científico publicado en 2007

Generation of ESTs in Vitis vinifera wine grape (Cabernet Sauvignon) and table grape (Muscat Hamburg) and discovery of new candidate genes with potential roles in berry development

artículo científico publicado en 2007

Generation of a wheat leaf rust, Puccinia triticina, EST database from stage-specific cDNA libraries

artículo científico publicado en 2007

Genes that may modulate longevity in C. elegans in both dauer larvae and long-lived daf-2 adults

artículo científico publicado en 2007

Genetic alterations activating kinase and cytokine receptor signaling in high-risk acute lymphoblastic leukemia

artículo científico publicado en 2012

Genetic basis of transcriptome differences between the founder strains of the rat HXB/BXH recombinant inbred panel.

artículo científico publicado en 2012

Genetic counseling in direct-to-consumer exome sequencing: a case report.

artículo científico publicado en 2014

Genome and transcriptome biomarkers of response to immune checkpoint inhibitors in advanced solid tumours

artículo científico publicado en 2020

Genome destabilizing mutator alleles drive specific mutational trajectories in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution

artículo científico publicado en 2004

Genome sequences of six Phytophthora species threatening forest ecosystems.

artículo científico publicado en 2016

Genome variation in Cryptococcus gattii, an emerging pathogen of immunocompetent hosts.

artículo científico publicado en 2011

Genome-Enhanced Detection and Identification (GEDI) of plant pathogens.

artículo científico publicado en 2018

Genome-Wide Profiles of Extra-cranial Malignant Rhabdoid Tumors Reveal Heterogeneity and Dysregulated Developmental Pathways.

artículo científico publicado en 2016

Genome-wide discovery of somatic coding and noncoding mutations in pediatric endemic and sporadic Burkitt lymphoma

artículo científico publicado en 2019

Genome-wide microRNA and messenger RNA profiling in rodent liver development implicates mir302b and mir20a in repressing transforming growth factor-beta signaling.

artículo científico publicado en 2013

Genome-wide profiles of STAT1 DNA association using chromatin immunoprecipitation and massively parallel sequencing

artículo científico publicado en 2007

Genomic Analysis of a Serotype 5 Streptococcus pneumoniae Outbreak in British Columbia, Canada, 2005-2009.

artículo científico publicado en 2016

Genomic analysis of a rare human tumor

artículo científico publicado en 2010

Genomic and epigenomic landscapes of adult de novo acute myeloid leukemia

artículo científico publicado en 2013

Genomic characterization of a well-differentiated grade 3 pancreatic neuroendocrine tumor.

artículo científico publicado en 2019

Genomic profiling of pelvic genital type leiomyosarcoma in a woman with a germline CHEK2:c.1100delC mutation and a concomitant diagnosis of metastatic invasive ductal breast carcinoma

artículo científico publicado en 2017

Genomics of hybrid poplar (Populus trichocarpax deltoides) interacting with forest tent caterpillars (Malacosoma disstria): normalized and full-length cDNA libraries, expressed sequence tags, and a cDNA microarray for the study of [...]

artículo científico publicado en 2006

Glioma-derived IL-33 orchestrates an inflammatory brain tumor microenvironment that accelerates glioma progression

artículo científico publicado en 2020

Global analysis of in vivo Foxa2-binding sites in mouse adult liver using massively parallel sequencing

artículo científico publicado en 2008

Hemithyroidectomy is the preferred initial operative approach for an indeterminate fine needle aspiration biopsy diagnosis

artículo científico publicado en 2012

High quality SNP calling using Illumina data at shallow coverage.

artículo científico publicado en 2010

High-throughput in vivo analysis of gene expression in Caenorhabditis elegans

artículo científico publicado en 2007

Hippo signaling influences HNF4A and FOXA2 enhancer switching during hepatocyte differentiation

artículo científico publicado en 2014

Hive plots--rational approach to visualizing networks.

artículo científico publicado en 2011

HoxA13 Regulates Phenotype Regionalization of Human Pregnant Myometrium.

artículo científico

Human variation database: an open-source database template for genomic discovery

artículo científico publicado el 2 de marzo de 2011

Hypermutation signature reveals a slippage and realignment model of translesion synthesis by Rev3 polymerase in cisplatin-treated yeast.

artículo científico publicado en 2017

Identification and Analyses of Extra-Cranial and Cranial Rhabdoid Tumor Molecular Subgroups Reveal Tumors with Cytotoxic T Cell Infiltration

scientific article published on 07 November 2019

Identification and characterization of Hoxa9 binding sites in hematopoietic cells

artículo científico publicado en 2012

Identification by full-coverage array CGH of human DNA copy number increases relative to chimpanzee and gorilla.

artículo científico publicado en 2005

Identification of a putative Tdp1 inhibitor (CD00509) by in vitro and cell-based assays.

artículo científico publicado en 2014

Identification of genes expressed in the hermaphrodite germ line of C. elegans using SAGE.

artículo científico publicado en 2009

Identification of novel lung genes in bronchial epithelium by serial analysis of gene expression

artículo científico publicado en 2006

Identifying cancer mutation targets across thousands of samples: MuteProc, a high throughput mutation analysis pipeline.

artículo científico publicado en 2013

Immunophenotyping of thyroid tumors identifies molecular markers altered during transformation of differentiated into anaplastic carcinoma

artículo científico publicado en 2011

Improved measures for evolutionary conservation that exploit taxonomy distances

artículo científico publicado en 2019

Improved white spruce (Picea glauca) genome assemblies and annotation of large gene families of conifer terpenoid and phenolic defense metabolism

artículo científico publicado en 2015

Increasing quality, throughput and speed of sample preparation for strand-specific messenger RNA sequencing

artículo científico publicado en 2017

Incremental value and clinical impact of neck sonography for primary hyperparathyroidism: a risk-adjusted analysis

artículo científico publicado en 2013

Integrated Genomic and Functional microRNA Analysis Identifies miR-30-5p as a Tumor Suppressor and Potential Therapeutic Nanomedicine in Head and Neck Cancer

scientific article published on 05 February 2019

Integrated and sequence-ordered BAC- and YAC-based physical maps for the rat genome

artículo científico publicado en 2004

Integrative genomic analysis of ghost cell odontogenic carcinoma

artículo científico publicado en 2015

Integrative genomic analysis of matched primary and metastatic pediatric osteosarcoma

scientific article published on 28 August 2019

Iron-regulated transcription and capsule formation in the fungal pathogen Cryptococcus neoformans

artículo científico publicado en 2005

IslandPath: aiding detection of genomic islands in prokaryotes

artículo científico publicado en 2003

JAGuaR: junction alignments to genome for RNA-seq reads

artículo científico publicado en 2014

LINKS: Scalable, alignment-free scaffolding of draft genomes with long reads.

artículo científico publicado en 2015

Large-scale production of SAGE libraries from microdissected tissues, flow-sorted cells, and cell lines

artículo científico publicado en 2006

Large-scale profiling of microRNAs for The Cancer Genome Atlas.

artículo científico publicado en 2015

Lessons learned from the application of whole-genome analysis to the treatment of patients with advanced cancers

artículo científico publicado en 2015

LongSAGE profiling of nine human embryonic stem cell lines.

artículo científico publicado en 2007

Loss of the Notch effector RBPJ promotes tumorigenesis

artículo científico publicado en 2014

MEG3 long noncoding RNA regulates the TGF-β pathway genes through formation of RNA-DNA triplex structures.

artículo científico publicado en 2015

MEN1 mutations in Hürthle cell (oncocytic) thyroid carcinoma

artículo científico publicado en 2015

MHC class II transactivator CIITA is a recurrent gene fusion partner in lymphoid cancers

artículo científico publicado en 2011

Management of PET diagnosed thyroid incidentalomas in British Columbia Canada: Critical importance of the PET report

artículo científico publicado en 2017

Mating factor linkage and genome evolution in basidiomycetous pathogens of cereals

scientific article published in 2006

Megabase-scale methylation phasing using nanopore long reads and NanoMethPhase

artículo científico publicado en 2021

Meta-analysis and meta-review of thyroid cancer gene expression profiling studies identifies important diagnostic biomarkers.

artículo científico publicado en 2006

Modern drug design: the implication of using artificial neuronal networks and multiple molecular dynamic simulations.

artículo científico publicado en 2017

Molecular characterisation of metastatic pancreatic neuroendocrine tumours (PNETs) using whole genome and transcriptome sequencing.

artículo científico publicado en 2017

Molecular etiology of an indolent lymphoproliferative disorder determined by whole-genome sequencing

artículo científico publicado en 2016

Molecular phenotyping of thyroid tumors identifies a marker panel for differentiated thyroid cancer diagnosis

artículo científico publicado en 2008

Mutation ofFOXL2in Granulosa-Cell Tumors of the Ovary

scientific article published on 10 June 2009

Mutational analysis reveals the origin and therapy-driven evolution of recurrent glioma

artículo científico publicado en 2013

Mutational and structural analysis of diffuse large B-cell lymphoma using whole-genome sequencing

artículo científico publicado en 2013

Mutational evolution in a lobular breast tumour profiled at single nucleotide resolution

artículo científico publicado en 2009

Mutations in ILK, encoding integrin-linked kinase, are associated with arrhythmogenic cardiomyopathy

artículo científico publicado en 2019

Mutations in SGOL1 cause a novel cohesinopathy affecting heart and gut rhythm

artículo científico publicado en 2014

NRG1 Gene Fusions Are Recurrent, Clinically Actionable Gene Rearrangements in KRAS Wild-Type Pancreatic Ductal Adenocarcinoma

scientific article published on 08 May 2019

Next-generation tag sequencing for cancer gene expression profiling

artículo científico publicado en 2009

ORCA: a comprehensive bioinformatics container environment for education and research

scientific article published on 01 November 2019

ORegAnno 3.0: a community-driven resource for curated regulatory annotation

artículo científico publicado en 2016

ORegAnno: an open access database and curation system for literature-derived promoters, transcription factor binding sites and regulatory variation

artículo científico publicado en 2006

On the Deep Order-Preserving Submatrix Problem: A Best Effort Approach

Opposing Effects of CREBBP Mutations Govern the Phenotype of Rubinstein-Taybi Syndrome and Adult SHH Medulloblastoma

artículo científico publicado en 2018

Organellar Genomes of White Spruce (Picea glauca): Assembly and Annotation

artículo científico publicado en 2015

PICS: probabilistic inference for ChIP-seq

artículo científico publicado en 2011

Papillary thyroid carcinoma: prognostic significance of cancer presentation

Patient selection for a developmental therapeutics program using whole genome and Transcriptome analysis

artículo científico publicado en 2020

Personalized oncogenomics in the management of gastrointestinal carcinomas-early experiences from a pilot study.

artículo científico publicado en 2016

Personalized oncogenomics: clinical experience with malignant peritoneal mesothelioma using whole genome sequencing.

artículo científico publicado en 2015

Phosphorylated caveolin-1 regulates Rho/ROCK-dependent focal adhesion dynamics and tumor cell migration and invasion

artículo científico publicado en 2008

Physical maps for genome analysis of serotype A and D strains of the fungal pathogen Cryptococcus neoformans

artículo científico publicado en 2002

Poly‐gene fusion transcripts and chromothripsis in prostate cancer

artículo científico publicado el 25 de agosto de 2012

Population sequencing reveals clonal diversity and ancestral inbreeding in the grapevine cultivar Chardonnay

artículo científico publicado en 2018

Precursor States of Brain Tumor Initiating Cell Lines Are Predictive of Survival in Xenografts and Associated with Glioblastoma Subtypes

artículo científico publicado en 2015

Prediction of genomic functional elements.

artículo científico publicado en 2006

Predictive utility of cyclo-oxygenase-2 expression by colon and rectal cancer

scientific article published on 12 March 2014

Profiling the HeLa S3 transcriptome using randomly primed cDNA and massively parallel short-read sequencing

artículo científico publicado en 2008

Prognostic significance of autocrine motility factor receptor expression by colorectal cancer and lymph node metastases

artículo científico publicado en 2015

Putative BRAF activating fusion in a medullary thyroid cancer.

artículo científico publicado en 2016

Pyruvate Kinase Inhibits Proliferation during Postnatal Cerebellar Neurogenesis and Suppresses Medulloblastoma Formation.

artículo científico publicado en 2017

RECQ-like helicases Sgs1 and BLM regulate R-loop-associated genome instability

artículo científico publicado en 2017

RTNduals: an R/Bioconductor package for analysis of co-regulation and inference of dual regulons

scientific article published on 01 December 2019

RTNsurvival: an R/Bioconductor package for regulatory network survival analysis

artículo científico publicado en 2019

Rare SUZ12 variants commonly cause an overgrowth phenotype

scientific article published on 17 November 2019

Reduced adenosine-to-inosine miR-455-5p editing promotes melanoma growth and metastasis

artículo científico publicado en 2015

Retrospective review using targeted deep sequencing reveals mutational differences between gastroesophageal junction and gastric carcinomas

artículo científico publicado en 2015

Retrotransposon-induced heterochromatin spreading in the mouse revealed by insertional polymorphisms

artículo científico publicado en 2011

Rise of the Machines: Advances in Deep Learning for Cancer Diagnosis

scientific article published on 28 February 2019

SNP discovery in black cottonwood (Populus trichocarpa) by population transcriptome resequencing.

artículo científico publicado en 2011

SOX9 modulates the expression of key transcription factors required for heart valve development.

artículo científico publicado en 2015

Salmo salar and Esox lucius full-length cDNA sequences reveal changes in evolutionary pressures on a post-tetraploidization genome.

artículo científico publicado en 2010

Serial analysis of gene expression profiles of developmental stages in non-small cell lung carcinoma

artículo científico publicado en 2004

Serial analysis of gene expression reveals conserved links between protein kinase A, ribosome biogenesis, and phosphate metabolism in Ustilago maydis

artículo científico publicado en 2005

Small molecule epigenetic screen identifies novel EZH2 and HDAC inhibitors that target glioblastoma brain tumor-initiating cells.

artículo científico publicado en 2016

Software for automated analysis of DNA fingerprinting gels.

artículo científico publicado en 2003

Somatic mosaicism for the p.His1047Arg mutation in PIK3CA in a girl with mesenteric lipomatosis.

artículo científico publicado en 2014

Somatic mutations altering EZH2 (Tyr641) in follicular and diffuse large B-cell lymphomas of germinal-center origin

artículo científico publicado en 2010

Sources of erroneous sequences and artifact chimeric reads in next generation sequencing of genomic DNA from formalin-fixed paraffin-embedded samples.

artículo científico publicado en 2019

Spark: a navigational paradigm for genomic data exploration

artículo científico publicado en 2012

Spruce giga‐genomes: structurally similar yet distinctive with differentially expanding gene families and rapidly evolving genes

artículo científico publicado en 2022

Subtype-discordant pancreatic ductal adenocarcinoma tumors show intermediate clinical and molecular characteristics

scientific article published on 13 October 2020

System-level analysis of neuroblastoma tumor-initiating cells implicates AURKB as a novel drug target for neuroblastoma.

artículo científico publicado en 2010

THOR: targeted high-throughput ortholog reconstructor

artículo científico publicado en 2006

Targeted CNS Delivery Using Human MiniPromoters and Demonstrated Compatibility with Adeno-Associated Viral Vectors.

artículo científico publicado en 2014

Temperature-regulated transcription in the pathogenic fungus Cryptococcus neoformans.

artículo científico publicado en 2002

Text-based phenotypic profiles incorporating biochemical phenotypes of inborn errors of metabolism improve phenomics-based diagnosis

artículo científico publicado en 2018

Text-mining clinically relevant cancer biomarkers for curation into the CIViC database

scientific article published on 03 December 2019

The Atlantic salmon genome provides insights into rediploidization

artículo científico publicado en 2016

The Genome of Black Cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)

artículo científico publicado en 2006

The Genome of the Beluga Whale (Delphinapterus leucas).

artículo científico publicado en 2017

The Genome of the North American Brown Bear or Grizzly: Ursus arctos ssp. horribilis

article

The Genome of the Northern Sea Otter (Enhydra lutris kenyoni).

artículo científico publicado en 2017

The Genome of the Steller Sea Lion (Eumetopias jubatus)

artículo científico publicado en 2019

The clonal and mutational evolution spectrum of primary triple-negative breast cancers

artículo científico publicado en 2012

The expression level of small non-coding RNAs derived from the first exon of protein-coding genes is predictive of cancer status.

artículo científico publicado en 2014

The genome of the forest insect pest <i>Pissodes strobi</i> reveals genome expansion and evidence of a <i>Wolbachia</i> endosymbiont

artículo científico publicado en 2022

The genome sequence of the spontaneously hypertensive rat: Analysis and functional significance

artículo científico publicado en 2010

The genomic and transcriptomic landscape of anaplastic thyroid cancer: implications for therapy.

artículo científico publicado en 2015

The molecular signature and cis-regulatory architecture of a C. elegans gustatory neuron.

artículo científico publicado en 2007

The new paradigm of flow cell sequencing.

scientific article published on June 2008

The pink salmon genome: Uncovering the genomic consequences of a two-year life cycle

artículo científico publicado en 2021

The transcriptional landscape of Shh medulloblastoma

artículo científico publicado en 2021

Tigmint: correcting assembly errors using linked reads from large molecules

artículo científico publicado en 2018

Transcription phenotypes of pancreatic cancer are driven by genomic events during tumor evolution

scientific article published on 13 January 2020

Transcriptome analysis of the normal human mammary cell commitment and differentiation process

artículo científico publicado en 2008

Transcriptome resources and functional characterization of monoterpene synthases for two host species of the mountain pine beetle, lodgepole pine (Pinus contorta) and jack pine (Pinus banksiana).

artículo científico publicado en 2013

Transferrin receptor 2 (TfR2) and HFE mutational analysis in non-C282Y iron overload: identification of a novel TfR2 mutation

artículo científico publicado en 2002

Tumor necrosis factor overcomes immune evasion in p53-mutant medulloblastoma

artículo científico publicado en 2020

Tumor-associated macrophages and survival in classic Hodgkin's lymphoma

artículo científico publicado en 2010

Tumour-suppressor microRNAs regulate ovarian cancer cell physical properties and invasive behaviour.

artículo científico publicado en 2016

Twist1 transcriptional targets in the developing atrio-ventricular canal of the mouse

artículo científico publicado en 2012

Uncovering Clinically Relevant Gene Fusions with Integrated Genomic and Transcriptomic Profiling of Metastatic Cancers

scientific article published on 04 November 2020

VisRseq: R-based visual framework for analysis of sequencing data

artículo científico publicado en 2015

Whole genome duplication and enrichment of metal cation transporters revealed by de novo genome sequencing of extremely halotolerant black yeast Hortaea werneckii

artículo científico publicado en 2013

Whole-genome and transcriptome profiling of a metastatic thyroid-like follicular renal cell carcinoma

artículo científico publicado en 2018

Whole-genome profiling of mutagenesis in Caenorhabditis elegans

artículo científico publicado en 2010

Whole-genome sequencing and social-network analysis of a tuberculosis outbreak

artículo científico publicado en 2011

akirinis required for diakinesis bivalent structure and synaptonemal complex disassembly at meiotic prophase I

artículo científico publicado el 30 de enero de 2013

cSurvival: a web resource for biomarker interactions in cancer outcomes and in cell lines

artículo científico publicado en 2022

miR-509-3p is clinically significant and strongly attenuates cellular migration and multi-cellular spheroids in ovarian cancer.

scientific article published on 27 March 2016

ntEdit: scalable genome sequence polishing

scientific article published on 01 November 2019

rAAV-compatible MiniPromoters for restricted expression in the brain and eye.

artículo científico publicado en 2016