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Lista de obras de Sandro Bottaro

Accurate multiple time step in biased molecular simulations. ⬇️

artículo científico publicado en 2014

An efficient null model for conformational fluctuations in proteins

artículo científico publicado en 2012

Barnaba: software for analysis of nucleic acid structures and trajectories

scientific article published on 12 November 2018

Biophysical experiments and biomolecular simulations: A perfect match?

artículo científico publicado en 2018

Computer Folding of RNA Tetraloops: Identification of Key Force Field Deficiencies.

artículo científico publicado en 2016

Conformational ensembles of RNA oligonucleotides from integrating NMR and molecular simulations

artículo científico publicado en 2018

Correction to Variational Optimization of an All-Atom Implicit Solvent Force Field To Match Explicit Solvent Simulation Data

artículo científico publicado en 2016

Effects and limitations of a nucleobase-driven backmapping procedure for nucleic acids using steered molecular dynamics

artículo científico publicado en 2017

Elastic network models for RNA: a comparative assessment with molecular dynamics and SHAPE experiments. ⬇️

artículo científico publicado en 2015

Empirical Corrections to the Amber RNA Force Field with Target Metadynamics. ⬇️

artículo científico publicado en 2016

Formulation of probabilistic models of protein structure in atomic detail using the reference ratio method.

artículo científico publicado en 2013

Free Energy Landscape of GAGA and UUCG RNA Tetraloops ⬇️

artículo científico publicado en 2016

Generative probabilistic models extend the scope of inferential structure determination

artículo científico publicado en 2011

Kissing loop interaction in adenine riboswitch: insights from umbrella sampling simulations ⬇️

artículo científico publicado en 2015

Mapping the Universe of RNA Tetraloop Folds.

artículo científico publicado en 2017

PHAISTOS: a framework for Markov chain Monte Carlo simulation and inference of protein structure

artículo científico publicado en 2013

Potentials of mean force for protein structure prediction vindicated, formalized and generalized

artículo científico publicado en 2010

RNA folding pathways in stop motion ⬇️

artículo científico publicado en 2016

Structure and dynamics of a nanodisc by integrating NMR, SAXS and SANS experiments with molecular dynamics simulations

scientific article published on 30 July 2020

Subtle Monte Carlo Updates in Dense Molecular Systems

artículo científico publicado en 2012

The role of nucleobase interactions in RNA structure and dynamics. ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Variational Optimization of an All-Atom Implicit Solvent Force Field to Match Explicit Solvent Simulation Data

artículo científico publicado en 2013

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