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Lista de obras de Simone Marsili

Calculation of the potential of mean force from nonequilibrium measurements via maximum likelihood estimators

artículo científico publicado en 2008

Conformational structure of the MOG-derived peptide 101-108 in solution

artículo científico publicado en 2011

Correction to "Free Energy Reconstruction in Bidirectional Force Spectroscopy Experiments: The Effect of the Device Stiffness".

artículo científico publicado en 2016

Crooks equation for steered molecular dynamics using a Nosé-Hoover thermostat.

artículo científico publicado en 2006

Energy-Driven Undocking (EDU-HREM) in Solute Tempering Replica Exchange Simulations

artículo científico publicado en 2014

Epigenomic Co-localization and Co-evolution Reveal a Key Role for 5hmC as a Communication Hub in the Chromatin Network of ESCs

artículo científico publicado en 2016

Fragment 101-108 of myelin oligodendrocyte glycoprotein: a possible lead compound for multiple sclerosis

artículo científico publicado en 2009

Free energy reconstruction in bidirectional force spectroscopy experiments: the effect of the device stiffness

artículo científico publicado en 2010

From residue coevolution to protein conformational ensembles and functional dynamics

artículo científico publicado en 2015

Generalization of the Jarzynski and Crooks nonequilibrium work theorems in molecular dynamics simulations.

artículo científico publicado en 2007

Insights into the conformational switching mechanism of the human vascular endothelial growth factor receptor type 2 kinase domain.

artículo científico publicado en 2012

Intraligand hydrophobic interactions rationalize drug affinities for peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein

artículo científico publicado en 2011

Large-Scale Conformational Transitions and Dimerization Are Encoded in the Amino-Acid Sequences of Hsp70 Chaperones

artículo científico publicado en 2015

New advances in metadynamics

Numerical verification of the generalized Crooks nonequilibrium work theorem for non-Hamiltonian molecular dynamics simulations.

artículo científico publicado en 2007

ORAC: a molecular dynamics simulation program to explore free energy surfaces in biomolecular systems at the atomistic level

artículo científico publicado en 2010

Recovering the Crooks equation for dynamical systems in the isothermal-isobaric ensemble: a strategy based on the equations of motion

artículo científico publicado en 2007

Self-healing umbrella sampling: a non-equilibrium approach for quantitative free energy calculations

scientific article published on 01 July 2006

Thermodynamics of stacking interactions in proteins.

artículo científico publicado en 2008

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