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Lista de obras de Caroline C Friedel

4-thiouridine inhibits rRNA synthesis and causes a nucleolar stress response

artículo científico publicado en 2013

A comprehensive evaluation of alignment algorithms in the context of RNA-seq

artículo científico publicado en 2012

A systematic analysis of host factors reveals a Med23-interferon-λ regulatory axis against herpes simplex virus type 1 replication

artículo científico publicado en 2013

Analysis of intraviral protein-protein interactions of the SARS coronavirus ORFeome

artículo científico publicado en 2007

Calpain-mediated cleavage of collapsin response mediator protein-2 drives acute axonal degeneration

artículo científico publicado en 2016

Clonal expansion analysis of transposon insertions by high-throughput sequencing identifies candidate cancer genes in a PiggyBac mutagenesis screen

artículo científico publicado en 2013

Computational analysis of virus-host interactomes.

artículo científico publicado en 2013

Deciphering the modulation of gene expression by type I and II interferons combining 4sU-tagging, translational arrest and in silico promoter analysis.

artículo científico publicado en 2013

Evolutionarily conserved herpesviral protein interaction networks

artículo científico publicado en 2009

FERN - a Java framework for stochastic simulation and evaluation of reaction networks

artículo científico publicado en 2008

FERN – Stochastic Simulation and Evaluation of Reaction Networks

Genome-Wide Assessment of AU-Rich Elements by the AREScore Algorithm ⬇️

artículo científico publicado el 5 de enero de 2012

HALO--a Java framework for precise transcript half-life determination.

artículo científico publicado en 2010

HSV-1-induced disruption of transcription termination resembles a cellular stress response but selectively increases chromatin accessibility downstream of genes.

artículo científico publicado en 2018

Herpes simplex virus blocks host transcription termination via the bimodal activities of ICP27

artículo científico publicado en 2020

High-resolution gene expression profiling for simultaneous kinetic parameter analysis of RNA synthesis and decay

artículo científico publicado en 2008

Identifying the topology of protein complexes from affinity purification assays

artículo científico publicado en 2009

Inferring topology from clustering coefficients in protein-protein interaction networks

artículo científico publicado en 2006

Influence of degree correlations on network structure and stability in protein-protein interaction networks

artículo científico publicado en 2007

Integrative functional genomics decodes herpes simplex virus 1

artículo científico publicado en 2020

Metabolic tagging and purification of nascent RNA: implications for transcriptomics.

artículo científico publicado en 2009

Microglia and macrophages promote corralling, wound compaction and recovery after spinal cord injury via Plexin-B2

artículo científico publicado en 2020

Mining RNA-seq data for infections and contaminations

artículo científico publicado en 2013

Plexin-B2 facilitates glioblastoma infiltration by modulating cell biomechanics

artículo científico publicado en 2021

Prediction of Poly(A) Sites by Poly(A) Read Mapping

artículo científico publicado en 2017

ProCope--protein complex prediction and evaluation

artículo científico publicado en 2008

Quantitative proteomics of the integrin adhesome show a myosin II‐dependent recruitment of LIM domain proteins ⬇️

artículo científico publicado el 11 de febrero de 2011

RC3H1 post-transcriptionally regulates A20 mRNA and modulates the activity of the IKK/NF-κB pathway

artículo científico publicado en 2015

Rapid Genome-wide Recruitment of RNA Polymerase II Drives Transcription, Splicing, and Translation Events during T Cell Responses.

artículo científico publicado en 2017

Real-time Analysis of Transcription Factor Binding, Transcription, Translation, and Turnover to Display Global Events During Cellular Activation

artículo científico publicado en 2018

Reliable gene signatures for microarray classification: assessment of stability and performance

artículo científico publicado en 2006

Support vector machines for separation of mixed plant-pathogen EST collections based on codon usage.

artículo científico publicado en 2004

Systematic analysis of viral and cellular microRNA targets in cells latently infected with human gamma-herpesviruses by RISC immunoprecipitation assay

artículo científico publicado en 2010

The Hepatitis E virus intraviral interactome

artículo científico publicado en 2015

The SARS-coronavirus-host interactome: identification of cyclophilins as target for pan-coronavirus inhibitors

artículo científico publicado en 2011

Time-resolved single-cell RNA-seq using metabolic RNA labelling

artículo científico publicado en 2022

Toward the complete interactome

artículo científico publicado en 2006

Transcriptome analysis of dominant-negative Brd4 mutants identifies Brd4-specific target genes of small molecule inhibitor JQ1.

artículo científico publicado en 2017

Virus-host interactomes and global models of virus-infected cells.

artículo científico

Watchdog - a workflow management system for the distributed analysis of large-scale experimental data

artículo científico publicado en 2018

Widespread disruption of host transcription termination in HSV-1 infection.

artículo científico publicado en 2015

Women in the European Virus Bioinformatics Center

artículo científico publicado en 2022

p53-Regulated Networks of Protein, mRNA, miRNA, and lncRNA Expression Revealed by Integrated Pulsed Stable Isotope Labeling With Amino Acids in Cell Culture (pSILAC) and Next Generation Sequencing (NGS) Analyses

artículo científico publicado en 2015

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