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Lista de obras de Julia Ponomarenko

An integrative approach to inferring gene regulatory module networks

artículo científico publicado en 2012

Analysis of Human RSV Immunity at the Molecular Level: Learning from the Past and Present

artículo científico publicado en 2015

Antibody-protein interactions: benchmark datasets and prediction tools evaluation

artículo científico publicado en 2007

Assigning new GO annotations to protein data bank sequences by combining structure and sequence homology

artículo científico publicado en 2005

BiologicalNetworks 2.0--an integrative view of genome biology data

artículo científico publicado en 2010

BiologicalNetworks--tools enabling the integration of multi-scale data for the host-pathogen studies

artículo científico publicado en 2011

Building an automated classification of DNA-binding protein domains.

artículo científico publicado en 2002

Conservancy of mAb Epitopes in Ebolavirus Glycoproteins of Previous and 2014 Outbreaks

artículo científico publicado en 2014

Control of RelB during dendritic cell activation integrates canonical and noncanonical NF-κB pathways

scientific journal article

Curation of complex, context-dependent immunological data

artículo científico publicado en 2006

ElliPro: a new structure-based tool for the prediction of antibody epitopes

artículo científico publicado en 2008

EpitopeViewer: a Java application for the visualization and analysis of immune epitopes in the Immune Epitope Database and Analysis Resource (IEDB)

artículo científico publicado en 2007

IEDB-3D: structural data within the immune epitope database

artículo científico publicado en 2011

Immune epitope database analysis resource

artículo científico publicado en 2012

Immune epitope database analysis resource (IEDB-AR).

artículo científico publicado en 2008

IntegromeDB: an integrated system and biological search engine

artículo científico publicado en 2012

IκBε is a key regulator of B cell expansion by providing negative feedback on cRel and RelA in a stimulus-specific manner

artículo científico

Limitations of Ab initio predictions of peptide binding to MHC class II molecules

artículo científico publicado en 2010

Pergola: Boosting Visualization and Analysis of Longitudinal Data by Unlocking Genomic Analysis Tools

scholarly article published 26 October 2018

Pre-existing immunity against swine-origin H1N1 influenza viruses in the general human population

artículo científico publicado en 2009

SELEX_DB: a database on in vitro selected oligomers adapted for recognizing natural sites and for analyzing both SNPs and site-directed mutagenesis data

artículo científico publicado el 1 de enero de 2002

Scalable Design of Paired CRISPR Guide RNAs for Genomic Deletion

artículo científico publicado en 2017

Semantic integration of data on transcriptional regulation

artículo científico publicado en 2010

Ten Simple Rules on How to Organize a Scientific Retreat

artículo científico publicado en 2017

The design and implementation of the immune epitope database and analysis resource

artículo científico publicado en 2005

The immune epitope database (IEDB) 3.0.

artículo científico publicado en 2014

The immune epitope database and analysis resource: from vision to blueprint

artículo científico publicado en 2005

The microbiome in respiratory medicine: current challenges and future perspectives

artículo científico publicado en 2017

The specificity of innate immune responses is enforced by repression of interferon response elements by NF-κB p50

artículo científico publicado en 2011

Towards a consensus on datasets and evaluation metrics for developing B-cell epitope prediction tools

artículo científico publicado en 2007

rSNP_Guide, a database system for analysis of transcription factor binding to DNA with variations: application to genome annotation

artículo científico publicado en 2003

rSNP_Guide: an integrated database-tools system for studying SNPs and site-directed mutations in transcription factor binding sites

artículo científico publicado en 2002