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Lista de obras de David Langenberger

A multi-split mapping algorithm for circular RNA, splicing, trans-splicing and fusion detection

artículo científico publicado en 2014

Alu elements in ANRIL non-coding RNA at chromosome 9p21 modulate atherogenic cell functions through trans-regulation of gene networks

artículo científico publicado en 2013

Computational prediction of microRNA genes

artículo científico publicado en 2014

DARIO: a ncRNA detection and analysis tool for next-generation sequencing experiments

artículo científico publicado en 2011

Dicer-Processed Small RNAs: Rules and Exceptions

article

EpiDiverse Toolkit: a pipeline suite for the analysis of bisulfite sequencing data in ecological plant epigenetics

artículo científico publicado en 2021

Evidence for human microRNA-offset RNAs in small RNA sequencing data

artículo científico publicado en 2009

Identification and classification of small RNAs in transcriptome sequence data.

artículo científico publicado en 2010

In silico target network analysis of de novo-discovered, tick saliva-specific microRNAs reveals important combinatorial effects in their interference with vertebrate host physiology

artículo científico publicado en 2017

MYC/MIZ1-dependent gene repression inversely coordinates the circadian clock with cell cycle and proliferation.

artículo científico publicado en 2016

Mapping the RNA-Seq trash bin: unusual transcripts in prokaryotic transcriptome sequencing data.

artículo científico publicado en 2013

Multi-platform next-generation sequencing of the domestic turkey (Meleagris gallopavo): genome assembly and analysis

artículo científico publicado en 2010

Recurrent mutation of the ID3 gene in Burkitt lymphoma identified by integrated genome, exome and transcriptome sequencing

artículo científico publicado en 2012

Signatures of mutational processes in human cancer

artículo científico publicado en 2013

TargetSpy: a supervised machine learning approach for microRNA target prediction

artículo científico publicado en 2010

Traces of post-transcriptional RNA modifications in deep sequencing data

artículo científico publicado en 2011

deepBlockAlign: a tool for aligning RNA-seq profiles of read block patterns

artículo científico publicado en 2011

miRanalyzer: a microRNA detection and analysis tool for next-generation sequencing experiments

artículo científico publicado en 2009

microRNA target predictions across seven Drosophila species and comparison to mammalian targets

artículo científico publicado en 2005

plantDARIO: web based quantitative and qualitative analysis of small RNA-seq data in plants

artículo científico publicado en 2014