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Lista de obras de Bernard Moret

A Fast and Exact Algorithm for the Exemplar Breakpoint Distance.

artículo científico publicado en 2016

A linear-time algorithm for computing inversion distance between signed permutations with an experimental study.

artículo científico publicado en 2001

A maximum-likelihood approach for building cell-type trees by lifting

artículo científico publicado en 2016

A metric for phylogenetic trees based on matching.

artículo científico publicado en 2012

A new genomic evolutionary model for rearrangements, duplications, and losses that applies across eukaryotes and prokaryotes.

artículo científico publicado en 2011

A transcript perspective on evolution.

artículo científico publicado en 2013

Advances in phylogeny reconstruction from gene order and content data

artículo científico publicado en 2005

An Exact Algorithm to Compute the Double-Cut-and-Join Distance for Genomes with Duplicate Genes

artículo científico publicado en 2014

An Exact Characterization of Greedy Structures

An empirical analysis of algorithms for constructing a minimum spanning tree

scholarly article

Bootstrapping phylogenies inferred from rearrangement data.

artículo científico publicado en 2012

ChIPnorm: a statistical method for normalizing and identifying differential regions in histone modification ChIP-seq libraries.

artículo científico publicado en 2012

Comparing genomes with rearrangements and segmental duplications

artículo científico publicado en 2015

Constructive complexity

Distance-based genome rearrangement phylogeny

artículo científico publicado en 2006

Efficiently computing the Robinson-Foulds metric.

artículo científico publicado en 2007

Estimating true evolutionary distances under rearrangements, duplications, and losses

artículo científico publicado en 2010

Estimating true evolutionary distances under the DCJ model

artículo científico publicado en 2008

Evaluating synteny for improved comparative studies

artículo científico publicado en 2014

Fast and accurate phylogenetic reconstruction from high-resolution whole-genome data and a novel robustness estimator.

artículo científico publicado en 2011

Fast phylogenetic methods for the analysis of genome rearrangement data: an empirical study

artículo científico publicado en 2002

Finding an Optimal Inversion Median: Experimental Results

FluReF, an automated flu virus reassortment finder based on phylogenetic trees.

artículo científico publicado en 2011

Gene rearrangement analysis and ancestral order inference from chloroplast genomes with inverted repeat.

artículo científico publicado en 2008

Heuristics for the inversion median problem.

artículo científico publicado en 2010

How many bootstrap replicates are necessary?

artículo científico publicado en 2010

Hurdles and sorting by inversions: combinatorial, statistical, and experimental results.

artículo científico publicado en 2009

Inferring transcript phylogenies ⬇️

artículo científico publicado el 11 de junio de 2012

Inversion Medians Outperform Breakpoint Medians in Phylogeny Reconstruction from Gene-Order Data

article

Inversion-based genomic signatures.

artículo científico publicado en 2009

Local and Systemic Effects of Brassinosteroid Perception in Developing Phloem

artículo científico publicado en 2020

Local auxin competition explains fragmented differentiation patterns

artículo científico publicado en 2020

Maximum independent sets of commuting and noninterfering inversions

artículo científico publicado en 2009

Maximum likelihood phylogenetic reconstruction from high-resolution whole-genome data and a tree of 68 eukaryotes.

artículo científico publicado en 2013

NEMo: An Evolutionary Model With Modularity for PPI Networks

artículo científico publicado en 2017

NETGEN: generating phylogenetic networks with diploid hybrids.

artículo científico publicado en 2006

New Genome Similarity Measures based on Conserved Gene Adjacencies

artículo científico publicado en 2017

On Computing Breakpoint Distances for Genomes with Duplicate Genes

artículo científico publicado en 2016

Phylogenetic networks: modeling, reconstructibility, and accuracy

artículo científico publicado en 2004

Probabilistic partitioning methods to find significant patterns in ChIP-Seq data

artículo científico publicado en 2014

Refining regulatory networks through phylogenetic transfer of information.

artículo científico publicado en 2012

Refining transcriptional regulatory networks using network evolutionary models and gene histories

artículo científico publicado en 2010

Scaling up accurate phylogenetic reconstruction from gene-order data

artículo científico publicado en 2003

Sequence-Based Synteny Analysis of Multiple Large Genomes

artículo científico publicado en 2018

Sorting genomes with rearrangements and segmental duplications through trajectory graphs.

artículo científico publicado en 2013

Sorting signed permutations by inversions in O(nlogn) time

artículo científico publicado en 2010

Study of cell differentiation by phylogenetic analysis using histone modification data

artículo científico publicado en 2014

TIBA: a tool for phylogeny inference from rearrangement data with bootstrap analysis

artículo científico publicado en 2012

The accuracy of fast phylogenetic methods for large datasets

scientific article published on 01 January 2002

Towards the development of computational tools for evaluating phylogenetic network reconstruction methods.

artículo científico publicado en 2003

Uncovering hidden phylogenetic consensus in large data sets.

artículo científico publicado en 2011

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