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Lista de obras de Mark V Ivanov

A Comprehensive Evaluation of Consensus Spectrum Generation Methods in Proteomics

publication published on 13 May 2022

Adaptation of Decoy Fusion Strategy for Existing Multi-Stage Search Workflows

artículo científico publicado en 2016

Biosaur: An open‐source Python software for liquid chromatography–mass spectrometry peptide feature detection with ion mobility support

artículo científico publicado en 2021

Brain Proteome of Drosophila melanogaster Is Enriched with Nuclear Proteins

scientific article published on 01 January 2019

Breath analysis in real time by mass spectrometry in chronic obstructive pulmonary disease

artículo científico publicado en 2014

Brute-Force Approach for Mass Spectrometry-Based Variant Peptide Identification in Proteogenomics without Personalized Genomic Data.

artículo científico publicado en 2018

Comparative evaluation of label-free quantification methods for shotgun proteomics

artículo científico publicado en 2017

Comparative proteomics as a tool for identifying specific alterations within interferon response pathways in human glioblastoma multiforme cells.

artículo científico publicado en 2017

Comparison of False Discovery Rate Control Strategies for Variant Peptide Identifications in Shotgun Proteogenomics

artículo científico publicado en 2017

Depletion of human serum albumin in embryo culture media for in vitro fertilization using monolithic columns with immobilized antibodies.

artículo científico publicado en 2016

DirectMS1: MS/MS-Free Identification of 1000 Proteins of Cellular Proteomes in 5 Minutes

artículo científico publicado en 2020

DirectMS1Quant: Ultrafast Quantitative Proteomics with MS/MS-Free Mass Spectrometry

artículo científico publicado en 2022

Empirical multidimensional space for scoring peptide spectrum matches in shotgun proteomics.

artículo científico publicado en 2014

Exome-based proteogenomics of HEK-293 human cell line: Coding genomic variants identified at the level of shotgun proteome.

artículo científico

Exome-driven characterization of the cancer cell lines at the proteome level: the NCI-60 case study.

artículo científico publicado en 2014

IdentiPy: an extensible search engine for protein identification in shotgun proteomics.

artículo científico publicado en 2018

Identification of Single Amino Acid Substitutions in Proteogenomics.

artículo científico publicado en 2018

MS/MS-Free Protein Identification in Complex Mixtures Using Multiple Enzymes with Complementary Specificity

artículo científico publicado en 2017

Methionine to isothreonine conversion as a source of false discovery identifications of genetically encoded variants in proteogenomics

artículo científico publicado en 2015

Proteogenomics of Malignant Melanoma Cell Lines: The Effect of Stringency of Exome Data Filtering on Variant Peptide Identification in Shotgun Proteomics

artículo científico publicado en 2018

Proteogenomics of adenosine-to-inosine RNA editing in the fruit fly

artículo científico publicado en 2018

Proteome-Wide Analysis of ADAR-Mediated Messenger RNA Editing during Fruit Fly Ontogeny

artículo científico publicado en 2020

Pyteomics 4.0: Five Years of Development of a Python Proteomics Framework

artículo científico publicado en 2019

Pyteomics—a Python Framework for Exploratory Data Analysis and Rapid Software Prototyping in Proteomics

artículo científico publicado el 5 de enero de 2013

Scavager: A Versatile Postsearch Validation Algorithm for Shotgun Proteomics Based on Gradient Boosting

artículo científico publicado en 2018

Unbiased False Discovery Rate Estimation for Shotgun Proteomics Based on the Target-Decoy Approach

artículo científico publicado en 2016

Validation of Peptide Identification Results in Proteomics Using Amino Acid Counting

article