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Lista de obras de Philippe Hupé

A critical function for transforming growth factor-β, interleukin 23 and proinflammatory cytokines in driving and modulating human TH-17 responses

article

ACTuDB, a new database for the integrated analysis of array-CGH and clinical data for tumors.

artículo científico publicado en 2007

ART-DeCo: easy tool for detection and characterization of cross-contamination of DNA samples in diagnostic next-generation sequencing analysis

artículo científico publicado en 2019

Analysis of array CGH data: from signal ratio to gain and loss of DNA regions

artículo científico publicado en 2004

Assessment of the novel online delineation workshop dummy run approach using FALCON within a European multicentre trial in cervical cancer (RAIDs).

artículo científico publicado en 2017

Bioinformatics for precision medicine in oncology: principles and application to the SHIVA clinical trial

artículo científico publicado en 2014

CAPweb: a bioinformatics CGH array Analysis Platform

artículo científico publicado en 2006

Challenges in the stratification of breast tumors for tailored therapies.

artículo científico publicado en 2006

Clinical and genetic landscape of treatment naive cervical cancer: Alterations in PIK3CA and in epigenetic modulators associated with sub-optimal outcome.

artículo científico publicado en 2019

Combinatorial code governing cellular responses to complex stimuli

artículo científico publicado en 2015

EMA - A R package for Easy Microarray data analysis

artículo científico publicado en 2010

Extrachromosomal amplification mechanisms in a glioma with amplified sequences from multiple chromosome loci

artículo científico publicado en 2010

Frequent PTEN genomic alterations and activated phosphatidylinositol 3-kinase pathway in basal-like breast cancer cells

artículo científico publicado en 2008

Frequent genomic structural alterations at HPV insertion sites in cervical carcinoma

artículo científico publicado en 2010

From prospective biobanking to precision medicine: BIO-RAIDs - an EU study protocol in cervical cancer

artículo científico publicado en 2015

Genomic profiling and identification of high-risk uveal melanoma by array CGH analysis of primary tumors and liver metastases

artículo científico publicado en 2009

High PTP4A3 Phosphatase Expression Correlates with Metastatic Risk in Uveal Melanoma Patients

artículo científico publicado en 2010

High-Resolution Mapping of DNA Breakpoints to Define True Recurrences Among Ipsilateral Breast Cancers

artículo científico publicado en 2007

Histo-genomic stratification reveals the frequent amplification/overexpression of CCNE1 and BRD4 genes in non-BRCAness high grade ovarian carcinoma

artículo científico publicado en 2015

ITALICS: an algorithm for normalization and DNA copy number calling for Affymetrix SNP arrays

artículo científico publicado en 2008

Independent transcriptional reprogramming and apoptosis induction by cisplatin

artículo científico publicado en 2012

Live-cell chromosome dynamics and outcome of X chromosome pairing events during ES cell differentiation

artículo científico publicado en 2011

Microbe-host interplay in atopic dermatitis and psoriasis

artículo científico publicado en 2019

Multi-factor data normalization enables the detection of copy number aberrations in amplicon sequencing data

artículo científico publicado en 2014

Multiparametric analysis of cytokine-driven human Th17 differentiation reveals a differential regulation of IL-17 and IL-22 production.

artículo científico publicado en 2009

Multiple-checkpoint inhibition of thymic stromal lymphopoietin-induced TH2 response by TH17-related cytokines

artículo científico publicado en 2012

NormaCurve: a SuperCurve-based method that simultaneously quantifies and normalizes reverse phase protein array data

artículo científico publicado en 2012

Patient-derived xenografts recapitulate molecular features of human uveal melanomas

artículo científico publicado en 2013

Precision medicine in cancer: challenges and recommendations from an EU-funded cervical cancer biobanking study

artículo científico publicado en 2016

Preferential occurrence of chromosome breakpoints within early replicating regions in neuroblastoma

artículo científico publicado en 2005

Prognostic Impact of Vitamin B6 Metabolism in Lung Cancer

article

Proteomic screening identifies a YAP-driven signaling network linked to tumor cell proliferation in human schwannomas

artículo científico publicado en 2014

QUARTIC: QUick pArallel algoRithms for high-Throughput sequencIng data proCessing

scientific article published on 06 April 2020

SMETHILLIUM: spatial normalization method for Illumina infinium HumanMethylation BeadChip

artículo científico publicado en 2011

Search for a gene expression signature of breast cancer local recurrence in young women

artículo científico publicado en 2012

Spatial normalization of array-CGH data

artículo científico publicado en 2006

Spatiotemporal control of interferon-induced JAK/STAT signalling and gene transcription by the retromer complex.

artículo científico publicado en 2016

Spi-1/PU.1 activates transcription through clustered DNA occupancy in erythroleukemia

artículo científico publicado en 2012

Spi-1/PU.1 oncogene accelerates DNA replication fork elongation and promotes genetic instability in the absence of DNA breakage

artículo científico publicado en 2010

Stability-based comparison of class discovery methods for DNA copy number profiles

artículo científico publicado en 2013

The ERM proteins interact with the HOPS complex to regulate the maturation of endosomes

artículo científico publicado en 2011

Ultrahigh dose-rate FLASH irradiation increases the differential response between normal and tumor tissue in mice.

artículo científico publicado en 2014

Using Transcriptional Signatures to Assess Immune Cell Function: From Basic Mechanisms to Immune-Related Disease

artículo científico

VAMP: visualization and analysis of array-CGH, transcriptome and other molecular profiles

artículo científico publicado en 2006

Whole-genome profiling helps to classify phyllodes tumours of the breast.

artículo científico publicado en 2016

[Biological network modelling and precision medicine in oncology]

artículo científico publicado en 2014

miR-181a and miR-630 regulate cisplatin-induced cancer cell death

artículo científico publicado en 2010