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Lista de obras de Judith Klein-Seetharaman

A critical assessment of Mus musculus gene function prediction using integrated genomic evidence

artículo científico publicado en 2008

A minimal ligand binding pocket within a network of correlated mutations identified by multiple sequence and structural analysis of G protein coupled receptors ⬇️

artículo científico publicado el 29 de junio de 2012

A mitochondria-targeted inhibitor of cytochrome c peroxidase mitigates radiation-induced death

artículo científico publicado en 2011

A mitochondrial pathway for biosynthesis of lipid mediators

artículo científico publicado en 2014

A mixture of feature experts approach for protein-protein interaction prediction

artículo científico publicado en 2007

Additive effects of chlorin e6 and metal ion binding on the thermal stability of rhodopsin in vitro

artículo científico publicado en 2009

Adsorption of surfactant lipids by single-walled carbon nanotubes in mouse lung upon pharyngeal aspiration

artículo científico publicado en 2012

Allosteric Modulation of G Protein Coupled Receptors by Cytoplasmic, Transmembrane and Extracellular Ligands

artículo científico publicado en 2010

Alternative paths in HIV-1 targeted human signal transduction pathways

artículo científico publicado en 2009

BIPS: BIANA Interolog Prediction Server. A tool for protein–protein interaction inference ⬇️

artículo científico publicado el 11 de junio de 2012

Biodegradation of single-walled carbon nanotubes by eosinophil peroxidase

artículo científico publicado en 2013

Carbon nanotubes degraded by neutrophil myeloperoxidase induce less pulmonary inflammation

artículo científico publicado en 2010

Cardiolipin Interactions with Proteins

artículo científico publicado en 2015

Cardiolipin externalization to the outer mitochondrial membrane acts as an elimination signal for mitophagy in neuronal cells

artículo científico publicado en 2013

Cardiolipin signaling mechanisms: collapse of asymmetry and oxidation

artículo científico publicado en 2015

Characterization of membrane protein non-native states. 1. Extent of unfolding and aggregation of rhodopsin in the presence of chemical denaturants

artículo científico publicado en 2010

Characterization of membrane protein non-native states. 2. The SDS-unfolded states of rhodopsin

artículo científico publicado en 2010

Characterization of the simultaneous decay kinetics of metarhodopsin states II and III in rhodopsin by solution-state NMR spectroscopy

artículo científico publicado en 2014

Chlorophyll-Derivative Modulation of Rhodopsin Signaling Properties through Evolutionarily Conserved Interaction Pathways

artículo científico publicado en 2017

Combined inhibition of PLC{gamma}-1 and c-Src abrogates epidermal growth factor receptor-mediated head and neck squamous cell carcinoma invasion

artículo científico publicado en 2008

Comparing human-Salmonella with plant-Salmonella protein-protein interaction predictions

artículo científico

Comparison of probabilistic combination methods for protein secondary structure prediction

artículo científico publicado en 2004

Comparison of the molecular properties of retinitis pigmentosa P23H and N15S amino acid replacements in rhodopsin.

artículo científico publicado en 2019

Determining confidence of predicted interactions between HIV-1 and human proteins using conformal method ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2012

Dichotomous roles for externalized cardiolipin in extracellular signaling: promotion of phagocytosis and attenuation of innate immunity

artículo científico publicado en 2015

Differential dynamics in the G protein-coupled receptor rhodopsin revealed by solution NMR.

scholarly article

Differential dynamics of extracellular and cytoplasmic domains in denatured States of rhodopsin

artículo científico publicado en 2014

Discovering pathways by orienting edges in protein interaction networks

artículo científico publicado en 2010

Dual function of mitochondrial Nm23-H4 protein in phosphotransfer and intermembrane lipid transfer: a cardiolipin-dependent switch

artículo científico publicado en 2013

Dual role of interactions between membranous and soluble portions of helical membrane receptors for folding and signaling

artículo científico publicado en 2005

Dynamics in rhodopsin

artículo científico publicado en 2002

Early integration of the individual student in academic activities: a novel classroom concept for graduate education in molecular biophysics and structural biology

artículo científico publicado en 2014

Evaluation of different biological data and computational classification methods for use in protein interaction prediction

artículo científico publicado en 2006

Flexibility of the cytoplasmic domain of the phototaxis transducer II from Natronomonas pharaonis

artículo científico publicado en 2008

Glutamic acid-rich proteins of rod photoreceptors are natively unfolded

artículo científico publicado en 2005

Heterolytic reduction of fatty acid hydroperoxides by cytochrome c/cardiolipin complexes: antioxidant function in mitochondria.

artículo científico publicado en 2009

Human immunodeficiency virus type 1 Vpr: oligomerization is an essential feature for its incorporation into virus particles

artículo científico publicado en 2010

Identification of Motions in Membrane Proteins by Elastic Network Models and Their Experimental Validation ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2012

Identification of core amino acids stabilizing rhodopsin

artículo científico publicado en 2004

Isotope Labeling in Insect Cells ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2012

Isotope Labeling in Mammalian Cells ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2012

Isotope labeling of mammalian GPCRs in HEK293 cells and characterization of the C-terminus of bovine rhodopsin by high resolution liquid NMR spectroscopy

artículo científico publicado en 2007

Known unknowns of cardiolipin signaling: the best is yet to come

artículo científico publicado en 2017

Ligand-independent antiapoptotic function of estrogen receptor-beta in lung cancer cells

artículo científico publicado en 2010

Lipid bodies containing oxidatively truncated lipids block antigen cross-presentation by dendritic cells in cancer

artículo científico publicado en 2017

Long-range interactions within a nonnative protein

artículo científico publicado en 2002

Mechanistic investigations of horseradish peroxidase-catalyzed degradation of single-walled carbon nanotubes

artículo científico publicado en 2009

Mitochondrial redox opto-lipidomics reveals mono-oxygenated cardiolipins as pro-apoptotic death signals

artículo científico publicado en 2016

Mitochondrial targeting of electron scavenging antioxidants: regulation of selective oxidation vs random chain reactions

artículo científico publicado en 2009

Molecular speciation and dynamics of oxidized triacylglycerols in lipid droplets: mass spectrometry and coarse-grained simulations

artículo científico publicado en 2014

Multitask Matrix Completion for Learning Protein Interactions Across Diseases

artículo científico publicado en 2017

Multitask learning for host-pathogen protein interactions

artículo científico publicado en 2013

NMR spectroscopy of phosphorylated wild-type rhodopsin: mobility of the phosphorylated C-terminus of rhodopsin in the dark and upon light activation

artículo científico publicado en 2004

NMR-based screening of membrane protein ligands

artículo científico publicado en 2010

Oxidized arachidonic and adrenic PEs navigate cells to ferroptosis

artículo científico publicado en 2016

Oxidized lipids block antigen cross-presentation by dendritic cells in cancer

artículo científico publicado en 2014

Prediction and comparison of Salmonella-human and Salmonella-Arabidopsis interactomes

artículo científico publicado en 2012

Prediction of interactions between HIV-1 and human proteins by information integration.

artículo científico publicado en 2009

Preferential binding of allosteric modulators to active and inactive conformational states of metabotropic glutamate receptors

artículo científico publicado en 2008

Protein complex identification by supervised graph local clustering

artículo científico publicado en 2008

Refining literature curated protein interactions using expert opinions

artículo científico publicado en 2015

Retinal proteins as model systems for membrane protein folding

artículo científico publicado en 2013

Semi-supervised multi-task learning for predicting interactions between HIV-1 and human proteins ⬇️

artículo científico publicado el 15 de septiembre de 2010

Shape and oligomerization state of the cytoplasmic domain of the phototaxis transducer II from Natronobacterium pharaonis

artículo científico publicado en 2006

Similarity of the non-amyloid-β component and C-terminal tail of monomeric and tetrameric alpha-synuclein with 14-3-3 sigma

artículo científico publicado en 2021

Specificity of lipoprotein-associated phospholipase A(2) toward oxidized phosphatidylserines: liquid chromatography-electrospray ionization mass spectrometry characterization of products and computer modeling of interactions

artículo científico publicado en 2012

Structural and Functional Consequences of the Weak Binding of Chlorin e6 to Bovine Rhodopsin

artículo científico publicado en 2019

Structural characterization of cardiolipin-driven activation of cytochrome C into a peroxidase and membrane perturbation

artículo científico publicado en 2018

Structure and dynamics of the insulin receptor: implications for receptor activation and drug discovery.

artículo científico publicado en 2017

Systematic prediction of human membrane receptor interactions

artículo científico publicado en 2009

TMpro web server and web service: transmembrane helix prediction through amino acid property analysis

artículo científico publicado en 2007

Techniques for transferring host-pathogen protein interactions knowledge to new tasks

artículo científico

Techniques to cope with missing data in host–pathogen protein interaction prediction ⬇️

artículo científico publicado el 15 de septiembre de 2012

The Cytoplasmic Rhodopsin-Protein Interface: Potential for Drug Discovery ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2012

The brown adipocyte protein CIDEA promotes lipid droplet fusion via a phosphatidic acid-binding amphipathic helix

artículo científico publicado en 2015

The current Salmonella‐host interactome ⬇️

artículo científico publicado el 27 de diciembre de 2011

The effect of loops on the structural organization of alpha-helical membrane proteins

scientific article published on March 2009

The enzymatic oxidation of graphene oxide

artículo científico publicado en 2011

The importance of valine 114 in ligand binding in beta(2)-adrenergic receptor

artículo científico publicado en 2010

Topography of tyrosine residues and their involvement in peroxidation of polyunsaturated cardiolipin in cytochrome c/cardiolipin peroxidase complexes

artículo científico publicado en 2011

Towards personalised molecular feedback for weight loss

artículo científico publicado en 2019

Transmembrane helix prediction using amino acid property features and latent semantic analysis

artículo científico publicado en 2008

Vibrational resonance, allostery, and activation in rhodopsin-like G protein-coupled receptors

artículo científico publicado en 2016

Virus interactions with human signal transduction pathways

artículo científico publicado en 2011

X-ray structure, thermodynamics, elastic properties and MD simulations of cardiolipin/dimyristoylphosphatidylcholine mixed membranes

artículo científico publicado en 2014

pH-dependent interaction of rhodopsin with cyanidin-3-glucoside. 1. Structural aspects

artículo científico publicado en 2009

pH-dependent interaction of rhodopsin with cyanidin-3-glucoside. 2. Functional aspects

artículo científico publicado en 2009

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