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Lista de obras de Tanya Z Berardini

A MOD(ern) perspective on literature curation.

artículo científico publicado en 2010

Accelerating literature curation with text-mining tools: a case study of using PubTator to curate genes in PubMed abstracts

artículo científico publicado en 2012

AgBioData consortium recommendations for sustainable genomics and genetics databases for agriculture

article

Annotation of gene product function from high-throughput studies using the Gene Ontology

article

Arabidopsis database and stock resources

artículo científico

Assessment of community-submitted ontology annotations from a novel database-journal partnership

artículo científico publicado el 1 de enero de 2012

Biocurators and biocuration: surveying the 21st century challenges

artículo científico publicado en 2012

Building an efficient curation workflow for the Arabidopsis literature corpus.

artículo científico publicado en 2012

Cross-product extensions of the Gene Ontology

artículo científico publicado en 2010

Crowdsourcing biocuration: The Community Assessment of Community Annotation with Ontologies (CACAO)

artículo científico publicado en 2021

Cyclophilin 40 is required for microRNA activity in Arabidopsis

scholarly article

Dovetailing biology and chemistry: integrating the Gene Ontology with the ChEBI chemical ontology

artículo científico publicado en 2013

Functional annotation of the Arabidopsis genome using controlled vocabularies

artículo científico publicado en 2004

Gene Ontology Consortium: going forward

artículo científico publicado en 2015

Gene Ontology annotations and resources

artículo científico publicado en 2012

HASTY, the Arabidopsis ortholog of exportin 5/MSN5, regulates phase change and morphogenesis.

artículo científico publicado en 2003

Identification of Neuronal Isozyme Specific Residues by Comparison of Goldfish Aldolase C to Other Aldolases

artículo científico publicado el 1 de agosto de 1997

Improving Interpretation of Cardiac Phenotypes and Enhancing Discovery With Expanded Knowledge in the Gene Ontology

artículo científico publicado en 2018

Methods for gene ontology annotation.

artículo científico

Modeling biochemical pathways in the gene ontology

artículo científico publicado en 2016

PhyloGenes: An online phylogenetics and functional genomics resource for plant gene function inference

scientific article published on 30 December 2020

PubSearch and PubFetch: a simple management system for semiautomated retrieval and annotation of biological information from the literature.

artículo científico publicado en 2006

RNAcentral: a comprehensive database of non-coding RNA sequences

artículo científico publicado en 2017

RNAcentral: a hub of information for non-coding RNA sequences

artículo científico publicado en 2018

Recurated protein interaction datasets

article

Regulation of vegetative phase change in Arabidopsis thaliana by cyclophilin 40.

artículo científico publicado en 2001

Representing ontogeny through ontology: a developmental biologist's guide to the gene ontology

artículo científico publicado en 2010

Spatial clustering of isozyme-specific residues reveals unlikely determinants of isozyme specificity in fructose-1,6-bisphosphate aldolase

artículo científico publicado en 2003

Sustainable funding for biocuration: The Arabidopsis Information Resource (TAIR) as a case study of a subscription-based funding model

artículo científico publicado en 2016

TAIR: a resource for integrated Arabidopsis data

artículo científico publicado en 2002

TermGenie - a web-application for pattern-based ontology class generation

artículo científico publicado en 2014

Text mining in the biocuration workflow: applications for literature curation at WormBase, dictyBase and TAIR

artículo científico publicado en 2012

The Arabidopsis Information Resource (TAIR): gene structure and function annotation.

artículo científico publicado en 2007

The Arabidopsis Information Resource (TAIR): improved gene annotation and new tools

artículo científico publicado el 2 de diciembre de 2011

The Arabidopsis information resource: Making and mining the "gold standard" annotated reference plant genome.

artículo científico publicado en 2015

The Gene Ontology (GO) Cellular Component Ontology: integration with SAO (Subcellular Anatomy Ontology) and other recent developments

artículo científico publicado en 2013

The Gene Ontology (GO) database and informatics resource

artículo científico publicado en 2004

The Gene Ontology knowledgebase in 2023

scientific article published in 2023

The plant ontology as a tool for comparative plant anatomy and genomic analyses

artículo científico publicado en 2012

The representation of heart development in the gene ontology

artículo científico