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Lista de obras de Amos Bairoch

'98 Escherichia coli SWISS-2DPAGE database update.

artículo científico publicado en 1998

2-D databases on the World Wide Web.

artículo científico publicado en 1999

A Preliminary Study on the Prediction of Human Protein Functions

A chromosome-centric human proteome project (C-HPP) to characterize the sets of proteins encoded in chromosome 17.

artículo científico publicado en 2012

A comprehensive web resource on RNA helicases from the baker's yeast Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2000

A cross-reference table between the Protein Data Bank of macromolecular structures and the National Biomedical Research Foundation-Protein Identification Resource amino acid sequence data bank

artículo científico publicado en 1989

A diverse transketolase family that includes the RecP protein of Streptococcus pneumoniae, a protein implicated in genetic recombination

artículo científico publicado en 1993

A generalized profile syntax for biomolecular sequence motifs and its function in automatic sequence interpretation

artículo científico publicado en 1994

A high-stringency blueprint of the human proteome

scientific article published on 16 October 2020

A large collection of bioinformatics question-query pairs over federated knowledge graphs: methodology and applications ⬇️

artículo científico publicado en 2024

A large-scale evaluation of computational protein function prediction

artículo científico publicado en 2013

A large-scale protein-function database

artículo científico publicado en 2010

A molecular scanner to automate proteomic research and to display proteome images

artículo científico publicado en 1999

A new bioinformatics tool to help assess the significance of BRCA1 variants.

artículo científico publicado en 2018

A new generation of information retrieval tools for biologists: the example of the ExPASy WWW server

artículo científico publicado en 1994

A novel zinc-binding motif found in two ubiquitous deaminase families

artículo científico publicado en 1994

A possible mechanism for metal-ion induced DNA-protein dissociation in a family of prokaryotic transcriptional regulators

artículo científico publicado en 1993

A standard nomenclature for referencing and authentication of pluripotent stem cells

artículo científico publicado en 2018

A superfamily of metalloenzymes unifies phosphopentomutase and cofactor-independent phosphoglycerate mutase with alkaline phosphatases and sulfatases

artículo científico publicado en 1998

A testis-specific gene, TPTE, encodes a putative transmembrane tyrosine phosphatase and maps to the pericentromeric region of human chromosomes 21 and 13, and to chromosomes 15, 22, and Y

artículo científico publicado en 1999

A unique signature identifies a family of zinc-dependent metallopeptidases.

artículo científico publicado en 1989

Amino acid sequence determination by gas chromatography—mass spectrometry of permethylated peptides

article published in 1983

Animal toxins: How is complexity represented in databases?

artículo científico publicado en 2010

Annotating single amino acid polymorphisms in the UniProt/Swiss-Prot knowledgebase.

artículo científico publicado en 2008

Annotation of functional impact of voltage-gated sodium channel mutations

artículo científico publicado en 2017

Annotation of glycoproteins in the SWISS-PROT database

artículo científico publicado en 2001

Annotation of post-translational modifications in the Swiss-Prot knowledge base

artículo científico publicado en 2004

Arac/XylS family of transcriptional regulators

artículo científico publicado en 1997

Automated annotation of microbial proteomes in SWISS-PROT.

artículo científico publicado en 2003

Bioinformatics for Human Proteomics: Current State and Future Status

Bioinformatics for Human Proteomics: Current State and Future Status

Brain Metastasis Cell Lines Panel: a public resource of organotropic cell lines

artículo científico publicado en 2020

C11orf83, a mitochondrial cardiolipin-binding protein involved in bc1 complex assembly and supercomplex stabilization

artículo científico publicado en 2015

C2orf62 and TTC17 are involved in actin organization and ciliogenesis in zebrafish and human

artículo científico publicado en 2014

CLASTR: The Cellosaurus STR similarity search tool ‐ A precious help for cell line authentication

artículo científico publicado en 2019

CTdatabase: a knowledge-base of high-throughput and curated data on cancer-testis antigens

artículo científico publicado en 2008

Calcium-binding affinity and calcium-enhanced activity of Clostridium thermocellum endoglucanase D.

artículo científico publicado en 1990

Calling on a million minds for community annotation in WikiProteins

artículo científico publicado en 2008

Cell Lines as Biological Models: Practical Steps for More Reliable Research

scientific article published on 15 June 2019

Cellosaurus

on-line knowledge resource on cell lines

Collaborative annotation of genes and proteins between UniProtKB/Swiss-Prot and dictyBase

artículo científico publicado en 2009

Complementation of the DNA repair defect in xeroderma pigmentosum group G cells by a human cDNA related to yeast RAD2

artículo científico publicado en 1993

Constructing a 2-D database for the World Wide Web.

artículo científico publicado en 1999

Construction of the gyrB Database for the Identification and Classification of Bacteria

artículo científico publicado en 1998

Converting neXtProt into Linked Data and nanopublications

artículo científico publicado en 2015

Correction to "Large-Scale Reanalysis of Publicly Available HeLa Cell Proteomics Data in the Context of the Human Proteome Project"

artículo científico publicado en 2019

Creating a specialist protein resource network: a meeting report for the protein bioinformatics and community resources retreat

artículo científico publicado en 2015

Current status of the SWISS-2DPAGE database

artículo científico publicado en 1998

D Databases on the World Wide Web

scholarly article

DERA is the human deoxyribose phosphate aldolase and is involved in stress response

artículo científico publicado en 2014

Data Integration in Proteomics

Deep Question Answering for protein annotation

artículo científico publicado en 2015

Detailed peptide characterization using PEPTIDEMASS--a World-Wide-Web-accessible tool.

artículo científico publicado en 1997

EF-hand motifs in inositol phospholipid-specific phospholipase C

artículo científico publicado en 1990

ENZYME

database of biological enzymes

Eukaryotic aldehyde dehydrogenase (ALDH) genes: human polymorphisms, and recommended nomenclature based on divergent evolution and chromosomal mapping

artículo científico publicado en 1999

Evidence for the existence of a mutated enkephalin sequence in preproenkephalin.

artículo científico publicado en 1982

Evolutionary relationships between catabolic pathways for aromatics: conservation of gene order and nucleotide sequences of catechol oxidation genes of pWW0 and NAH7 plasmids

artículo científico publicado en 1987

ExPASy: The proteomics server for in-depth protein knowledge and analysis

artículo científico publicado en 2003

Exploring the Uncharacterized Human Proteome Using neXtProt

Federated two-dimensional electrophoresis database: a simple means of publishing two-dimensional electrophoresis data

artículo científico publicado en 1996

Fifteen years SIB Swiss Institute of Bioinformatics: life science databases, tools and support

artículo científico publicado en 2014

FindPept, a tool to identify unmatched masses in peptide mass fingerprinting protein identification

artículo científico publicado en 2002

From genome to proteome--aim of human proteomics.

artículo científico publicado en 2004

Functional identification of APIP as human mtnB, a key enzyme in the methionine salvage pathway

artículo científico publicado en 2012

Functionally and structurally relevant residues in PROSITE motif descriptors

Functionathon: a manual data mining workflow to generate functional hypotheses for uncharacterized human proteins and its application by undergraduate students

artículo científico publicado en 2021

GENOME MAPS 8: Building Gene Families

artículo científico publicado en 1997

GPCRDB: an information system for G protein-coupled receptors

artículo científico publicado en 1998

Go hunting in sequence databases but watch out for the traps

artículo científico publicado en 1996

HAMAP: a database of completely sequenced microbial proteome sets and manually curated microbial protein families in UniProtKB/Swiss-Prot

artículo científico publicado en 2009

High-quality protein knowledge resource: SWISS-PROT and TrEMBL.

artículo científico publicado en 2002

High-throughput mass spectrometric discovery of protein post-translational modifications.

artículo científico publicado en 1999

Human aldehyde dehydrogenase genes: alternatively spliced transcriptional variants and their suggested nomenclature

artículo científico publicado en 2009

Human liver protein map: Update 1993

article by Graham J. Hughes et al published 1993 in Electrophoresis

Human liver protein map: a reference database established by microsequencing and gel comparison

artículo científico publicado en 1992

Human liver protein map: update 1993

artículo científico publicado en 1993

ICEPO: the ion channel electrophysiology ontology

artículo científico publicado en 2016

Improving protein identification from peptide mass fingerprinting through a parameterized multi-level scoring algorithm and an optimized peak detection

artículo científico publicado en 1999

Improving protein identification from peptide mass fingerprinting through a parameterized multi-level scoring algorithm and an optimized peak detection

article

Incidences of problematic cell lines are lower in papers that use RRIDs to identify cell lines

Industrial-scale proteomics: from liters of plasma to chemically synthesized proteins

artículo científico publicado en 2004

Infrastructure for the life sciences: design and implementation of the UniProt website

artículo científico publicado en 2009

Inside SWISS-2DPAGE database

artículo científico publicado en 1995

IntAct: an open source molecular interaction database

artículo científico publicado en 2004

IntEnz, the integrated relational enzyme database

artículo científico publicado en 2004

Integrating two-dimensional gel databases using the Melanie II software.

artículo científico publicado en 1996

InterPro, progress and status in 2005

artículo científico publicado en 2005

InterPro--an integrated documentation resource for protein families, domains and functional sites

artículo científico publicado en 2000

InterPro: an integrated documentation resource for protein families, domains and functional sites

artículo científico publicado en 2002

InterPro: the integrative protein signature database

artículo científico publicado en 2009

Interleukin-1-inducible genes in endothelial cells. Cloning of a new gene related to C-reactive protein and serum amyloid P component

artículo científico publicado en 1992

Internet Resources for Protein Identification and Characterization

Key challenges for the creation and maintenance of specialist protein resources

artículo científico publicado en 2015

Kinases and cancer

artículo científico publicado en 2018

LISTA, LISTA-HOP and LISTA-HON: a comprehensive compilation of protein encoding sequences and its associated homology databases from the yeast Saccharomyces

artículo científico publicado en 1996

LISTA, LISTA-HOP and LISTA-HON: a comprehensive compilation of protein encoding sequences and its associated homology databases from the yeast Saccharomyces

artículo científico publicado en 1994

Large-Scale Reanalysis of Publicly Available HeLa Cell Proteomics Data in the Context of the Human Proteome Project

artículo científico publicado en 2018

Low molecular weight proteins: a challenge for post-genomic research.

artículo científico publicado en 1998

Managing the data explosion. A report on the HUPO-PSI Workshop. August 2008, Amsterdam, The Netherlands

artículo científico publicado en 2009

Mass spectrometry in high-throughput proteomics: ready for the big time.

artículo científico publicado en 2010

Metrics for the Human Proteome Project 2013-2014 and strategies for finding missing proteins

artículo científico publicado en 2013

Missing protein landscape of human chromosomes 2 and 14: Progress and current status

artículo científico publicado en 2016

Molecular basis of symbiosis between Rhizobium and legumes

artículo científico publicado en 1997

Multiple parameter cross-species protein identification using MultiIdent--a world-wide web accessible tool.

artículo científico publicado en 1998

N-terminome analysis of the human mitochondrial proteome.

artículo científico

NEWT, a new taxonomy portal

artículo científico publicado en 2003

New developments in linking of biological databases and computer-generation of annotation: SWISS-PROT and its computer-annotated supplement TREMBL

New developments in the InterPro database

artículo científico publicado en 2007

New families in the classification of glycosyl hydrolases based on amino acid sequence similarities

artículo científico publicado en 1993

New insulin-like proteins with atypical disulfide bond pattern characterized in Caenorhabditis elegans by comparative sequence analysis and homology modeling.

artículo científico publicado en 1998

Nucleotide sequences of the Acinetobacter calcoaceticus benABC genes for benzoate 1,2-dioxygenase reveal evolutionary relationships among multicomponent oxygenases

artículo científico publicado en 1991

Ongoing and future developments at the Universal Protein Resource

artículo científico publicado en 2011

OpenFluDB, a database for human and animal influenza virus

artículo científico publicado en 2010

PA26 is a candidate gene for heterotaxia in humans: identification of a novel PA26-related gene family in human and mouse

artículo científico publicado en 2003

PC/GENE

software package for the analysis of genes and proteines

PROSITE, a protein domain database for functional characterization and annotation

artículo científico publicado en 2010

PROSITE: a dictionary of sites and patterns in proteins

artículo científico publicado en 1991

PROSITE: a dictionary of sites and patterns in proteins

artículo científico publicado en 1992

PROSITE: a documented database using patterns and profiles as motif descriptors

artículo científico publicado en 2002

PROSITE: recent developments

artículo científico publicado en 1994

Plant protein annotation in the UniProt knowledgebase

artículo científico publicado en 2005

Plasma and red blood cell protein maps: update 1993

artículo científico publicado en 1993

Post-translational modifications: a challenge for proteomics and bioinformatics

artículo científico publicado en 2004

Potential DNA slippage structures acquired during evolutionary divergence of Acinetobacter calcoaceticus chromosomal benABC and Pseudomonas putida TOL pWW0 plasmid xylXYZ, genes encoding benzoate dioxygenases

artículo científico publicado en 1991

ProRule: a new database containing functional and structural information on PROSITE profiles

artículo científico publicado en 2005

Proposals for the naming of chloroplast genes. III. Nomenclature for open reading frames encoded in chloroplast genomes

article

Protein Databases

article from 2005

Protein Identification and Analysis Tools on the ExPASy Server

article

Protein Sequence Variants: Resources and Tools

Protein Variations: Resources and Tools

Protein annotation: detective work for function prediction

artículo científico publicado en 1998

Protein identification and analysis tools in the ExPASy server

artículo científico publicado en 1999

Protein identification with N and C-terminal sequence tags in proteome projects

artículo científico publicado en 1998

Protein sequence annotation in the genome era: the annotation concept of SWISS-PROT+TREMBL.

artículo científico publicado en 1997

Protein sequence databases

Protein variety and functional diversity: Swiss-Prot annotation in its biological context

artículo científico publicado en 2005

Proteome Analysis

Proteome Databases

article

Proto-vav and gene expression.

artículo científico publicado en 1992

Querying NeXtProt Nanopublications and Their Value for Insights on Sequence Variants and Tissue Expression

artículo científico publicado en 2018

Querying neXtProt nanopublications and their value for insights on sequence variants and tissue expression

artículo científico publicado en 2014

Recent improvements to the PROSITE database

artículo científico publicado en 2004

Representation of functional information in the SWISS-PROT data bank

artículo científico publicado en 1999

Review of the selected proceedings of the Fifth International Workshop on Data Integration in the Life Sciences 2008.

artículo científico publicado en 2008

SEQANALREF: a sequence analysis bibliographic reference databank

artículo científico publicado en 1991

SWISS-2DPAGE: a database of two-dimensional gel electrophoresis images

artículo científico publicado en 1993

SWISS-PROT: connecting biomolecular knowledge via a protein database.

artículo científico publicado en 2001

ScanProsite: a reference implementation of a PROSITE scanning tool

artículo científico publicado en 2002

ScanProsite: detection of PROSITE signature matches and ProRule-associated functional and structural residues in proteins

artículo científico publicado en 2006

Sequence patterns in protein kinases.

artículo científico publicado en 1988

Sequence similarities in calcium-binding proteins

artículo científico publicado en 1988

Sequences and topology: Predicting evolution.

artículo científico publicado en 1997

Serendipity in bioinformatics, the tribulations of a Swiss bioinformatician through exciting times!

artículo científico publicado en 2000

Sharing of worldwide spread knowledge using hypermedia facilities & fast communication protocols (Mosaic and World Wide Web): the example of ExPASy

artículo científico publicado en 1995

Signal Traitment and Virtual Images Production (1/2)

article

Standard guidelines for the chromosome-centric human proteome project

artículo científico publicado en 2012

Standards for Reporting Enzyme Data: The STRENDA Consortium: What it aims to do and why it should be helpful

article by Keith F. Tipton et al published May 2014 in Perspectives in Science

Suggestion to research groups working on protein and peptide sequence

artículo científico publicado en 1982

Swiss-Prot: juggling between evolution and stability

artículo científico publicado en 2004

The 1999 SWISS-2DPAGE database update

artículo científico publicado en 2000

The 20 years of PROSITE

artículo científico publicado en 2008

The ABCD database: a repository for chemically defined antibodies

scientific article published on 01 January 2020

The Cellosaurus, a cell-line knowledge resource ⬇️

artículo científico publicado en 2018

The Chromosome-Centric Human Proteome Project for cataloging proteins encoded in the genome.

artículo científico publicado en 2012

The ENZYME data bank

artículo científico publicado en 1994

The ENZYME data bank

artículo científico publicado en 1993

The ENZYME data bank in 1995

artículo científico publicado en 1996

The ENZYME data bank in 1999

artículo científico publicado en 1999

The ENZYME database in 2000

artículo científico publicado en 2000

The Feature Viewer: A visualization tool for positional annotations on a sequence

scientific article published on 27 January 2020

The Impact of 3D Structures on a Protein Knowledgebase: From Proteins to Systems

The InterPro database, 2003 brings increased coverage and new features

artículo científico publicado en 2003

The InterPro database, an integrated documentation resource for protein families, domains and functional sites

artículo científico publicado en 2001

The PROSITE database, its status in 1995.

artículo científico publicado en 1996

The PROSITE database, its status in 1997.

artículo científico publicado en 1997

The PROSITE database, its status in 1999

artículo científico publicado en 1999

The PROSITE database, its status in 2002

artículo científico publicado en 2002

The PROSITE database.

artículo científico publicado en 2006

The PROSITE dictionary of sites and patterns in proteins, its current status

artículo científico publicado en 1993

The SIB Swiss Institute of Bioinformatics Semantic Web of data

artículo científico publicado en 2023

The SWISS-2DPAGE database of two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis, its status in 1995.

artículo científico publicado en 1996

The SWISS-2DPAGE database of two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis.

artículo científico publicado en 1994

The SWISS-2DPAGE database: what has changed during the last year

artículo científico publicado en 1999

The SWISS-PROT protein knowledgebase and its supplement TrEMBL in 2003

artículo científico publicado en 2003

The SWISS-PROT protein sequence data bank

artículo científico publicado en 1991

The SWISS-PROT protein sequence data bank and its new supplement TREMBL

artículo científico publicado en 1996

The SWISS-PROT protein sequence data bank and its supplement TrEMBL

artículo científico publicado en 1997

The SWISS-PROT protein sequence data bank and its supplement TrEMBL in 1998 ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1998

The SWISS-PROT protein sequence data bank and its supplement TrEMBL in 1999.

artículo científico publicado en 1999

The SWISS-PROT protein sequence data bank, recent developments

artículo científico publicado en 1993

The SWISS-PROT protein sequence data bank.

artículo científico publicado en 1992

The SWISS-PROT protein sequence data bank: current status

artículo científico publicado en 1994

The SWISS-PROT protein sequence database and its supplement TrEMBL in 2000.

artículo científico publicado en 2000

The SWISS-PROT protein sequence database: its relevance to human molecular medical research.

artículo científico publicado en 1997

The Sulfinator: predicting tyrosine sulfation sites in protein sequences

artículo científico publicado en 2002

The Swiss-Prot protein knowledgebase and ExPASy: providing the plant community with high quality proteomic data and tools

artículo científico publicado en 2004

The Swiss-Prot variant page and the ModSNP database: a resource for sequence and structure information on human protein variants

artículo científico

The UDP glycosyltransferase gene superfamily: recommended nomenclature update based on evolutionary divergence

artículo científico publicado en 1997

The UniProtKB/Swiss-Prot knowledgebase and its plant proteome annotation program

artículo científico publicado en 2008

The Universal Protein Resource (UniProt)

artículo científico publicado en 2005

The Universal Protein Resource (UniProt): an expanding universe of protein information

artículo científico publicado en 2006

The application of bioinformatics to mass spectrometry.

artículo científico publicado en 2002

The future of annotation/biocuration

The human proteome project: Current state and future direction

artículo científico

The human proteomics initiative (HPI).

artículo científico publicado en 2001

The neXtProt knowledgebase in 2020: data, tools and usability improvements

artículo científico publicado en 2020

The neXtProt knowledgebase on human proteins: 2017 update

artículo científico publicado en 2016

The neXtProt knowledgebase on human proteins: current status

artículo científico publicado en 2015

The xylS gene positive regulator of TOL plasmid pWWO: identification, sequence analysis and overproduction leading to constitutive expression of meta cleavage operon

artículo científico publicado en 1987

The yeast SWISS-2DPAGE database

artículo científico publicado en 1996

Towards BioDBcore: a community-defined information specification for biological databases

artículo científico publicado en 2011

Towards BioDBcore: a community-defined information specification for biological databases

artículo científico publicado en 2011

Tox-Prot, the toxin protein annotation program of the Swiss-Prot protein knowledgebase.

artículo científico publicado en 2004

Triage by ranking to support the curation of protein interactions

artículo científico publicado en 2017

Two-dimensional gel electrophoresis for proteome projects: the effects of protein hydrophobicity and copy number

artículo científico publicado en 1998

Two-dimensional gel electrophoresis ofEscherichia coli homogenates: TheEscherichia coli SWISS-2DPAGE database

article

UniPathway: a resource for the exploration and annotation of metabolic pathways

artículo científico publicado en 2011

UniProt: the Universal Protein knowledgebase

artículo científico publicado en 2004

UniProtKB/Swiss-Prot

artículo científico publicado en 2007

UniProtKB/Swiss-Prot Manual and Automated Annotation of Complete Proteomes: The Dictyostelium discoideum Case Study

article

UniProtKB/Swiss-Prot: New and Future Developments

Updating the sequence-based classification of glycosyl hydrolases

artículo científico publicado en 1996

Using PC/GENE for protein and nucleic acid analysis

artículo científico publicado en 1988

ViralZone: a knowledge resource to understand virus diversity

artículo científico publicado en 2011

cis-diol dehydrogenases encoded by the TOL pWW0 plasmid xylL gene and the Acinetobacter calcoaceticus chromosomal benD gene are members of the short-chain alcohol dehydrogenase superfamily

artículo científico publicado en 1992

neXtProt: a knowledge platform for human proteins

artículo científico publicado en 2012

neXtProt: organizing protein knowledge in the context of human proteome projects

artículo científico publicado en 2013

PROSITE

database of protein domains, families and functional sites

Swiss-Prot

The manually curated portion of the UniProt database of protein sequence information.

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