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Lista de obras de Tommy Kaplan

A high-resolution enhancer atlas of the developing telencephalon

artículo científico publicado en 2013

A hyperdynamic H3.3 nucleosome marks promoter regions in pluripotent embryonic stem cells.

artículo científico publicado en 2017

A novel Bayesian DNA motif comparison method for clustering and retrieval

artículo científico publicado en 2008

Ab initio construction of a eukaryotic transcriptome by massively parallel mRNA sequencing

artículo científico publicado en 2009

Ab initio prediction of transcription factor targets using structural knowledge

artículo científico publicado en 2005

CIS: compound importance sampling method for protein-DNA binding site p-value estimation

artículo científico publicado en 2004

Cell cycle- and chaperone-mediated regulation of H3K56ac incorporation in yeast

artículo científico publicado en 2008

Comparative analysis of T4 DNA ligases and DNA polymerases used in chromosome conformation capture assays.

artículo científico publicado en 2015

Comparative parallel multi-omics analysis during the induction of pluripotent and trophectoderm states

artículo científico publicado en 2022

Comprehensive human cell-type methylation atlas reveals origins of circulating cell-free DNA in health and disease

artículo científico publicado en 2018

Contribution of epigenetic mechanisms to variation in cancer risk among tissues.

artículo científico publicado en 2017

Disease-associated astrocytes in Alzheimer's disease and aging

artículo científico publicado en 2020

Dual functions of TAF7L in adipocyte differentiation

artículo científico publicado en 2013

Dynamics of Replication-Independent Histone Turnover in Budding Yeast

artículo científico publicado en 2007

Establishment of regions of genomic activity during the Drosophila maternal to zygotic transition

artículo científico publicado en 2014

Evaluation of PSI-BLAST alignment accuracy in comparison to structural alignments.

artículo científico publicado en 2000

Extensive divergence of transcription factor binding in Drosophila embryos with highly conserved gene expression

artículo científico publicado en 2013

Gene expression: Running to stand still

artículo científico publicado en 2012

Genome-wide analysis of androgen receptor targets reveals COUP-TF1 as a novel player in human prostate cancer

artículo científico publicado en 2012

Genome-wide search for Zelda-like chromatin signatures identifies GAF as a pioneer factor in early fly development.

artículo científico publicado en 2017

Genomic retargeting of p53 and CTCF is associated with transcriptional changes during oncogenic HRas-induced transformation

artículo científico publicado en 2020

Glimmers in the midnight zone: characterization of aligned identical residues in sequence-dissimilar proteins sharing a common fold.

artículo científico publicado en 2000

Hierarchical role for transcription factors and chromatin structure in genome organization along adipogenesis.

artículo científico publicado en 2017

High throughput determination of TGFβ1/SMAD3 targets in A549 lung epithelial cells

artículo científico publicado en 2011

Large-scale discovery of enhancers from human heart tissue

artículo científico publicado en 2011

Nucleosome positioning from tiling microarray data

artículo científico publicado en 2008

Post-transcriptional 3´-UTR cleavage of mRNA transcripts generates thousands of stable uncapped autonomous RNA fragments.

artículo científico publicado en 2017

Promoter-enhancer interactions identified from Hi-C data using probabilistic models and hierarchical topological domains.

artículo científico publicado en 2017

Quantitative models of the mechanisms that control genome-wide patterns of transcription factor binding during early Drosophila development

artículo científico publicado en 2011

Roles for H2A.Z and its acetylation in GAL1 transcription and gene induction, but not GAL1-transcriptional memory

artículo científico publicado en 2010

Single-nucleosome mapping of histone modifications in S. cerevisiae

artículo científico publicado en 2005

Stable Binding of the Conserved Transcription Factor Grainy Head to its Target Genes Throughout Drosophila melanogaster Development

artículo científico publicado en 2016

Structure and function of a transcriptional network activated by the MAPK Hog1.

artículo científico publicado en 2008

TAF7L modulates brown adipose tissue formation

artículo científico publicado en 2014

Taf7l cooperates with Trf2 to regulate spermiogenesis

scientific article published on 30 September 2013

Triangular correlation (TrC) between cancer aggressiveness, cell uptake capability, and cell deformability

scientific article published on 15 January 2020

Zelda binding in the early Drosophila melanogaster embryo marks regions subsequently activated at the maternal-to-zygotic transition

artículo científico publicado en 2011

Zelda is differentially required for chromatin accessibility, transcription factor binding, and gene expression in the early Drosophila embryo.

artículo científico publicado en 2015

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