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Lista de obras de Daniel Blankenberg

28-way vertebrate alignment and conservation track in the UCSC Genome Browser

artículo científico publicado en 2007

A framework for collaborative analysis of ENCODE data: making large-scale analyses biologist-friendly

artículo científico publicado en 2007

An encyclopedia of mouse DNA elements (Mouse ENCODE).

artículo científico publicado en 2012

Analysis of nested alternate open reading frames and their encoded proteins

artículo científico publicado en 2022

Analysis of next-generation sequencing data using Galaxy

artículo científico publicado en 2014

Biology Needs Evolutionary Software Tools: Let's Build Them Right.

artículo científico publicado en 2018

Child Weight Gain Trajectories Linked To Oral Microbiota Composition

artículo científico publicado en 2018

CloudMap: a cloud-based pipeline for analysis of mutant genome sequences

artículo científico publicado en 2012

Community-led, integrated, reproducible multi-omics with anvi'o

artículo científico publicado en 2021

Controlling for contamination in re-sequencing studies with a reproducible web-based phylogenetic approach

artículo científico publicado en 2014

Dissemination of scientific software with Galaxy ToolShed

artículo científico publicado en 2014

Expanding the Galaxy's reference data

publication published on 29 April 2022

Expanding the Galaxy’s reference data

artículo científico publicado en 2020

Galaxy External Display Applications: closing a dataflow interoperability loop

scientific article published on 01 February 2020

Galaxy Training: A powerful framework for teaching!

Galaxy: a platform for interactive large-scale genome analysis

artículo científico publicado en 2005

Galaxy: a web-based genome analysis tool for experimentalists

artículo científico publicado en 2010

Integrating diverse databases into an unified analysis framework: a Galaxy approach

artículo científico publicado en 2011

Integrative genomic analysis by interoperation of bioinformatics tools in GenomeSpace

artículo científico

Making whole genome multiple alignments usable for biologists

artículo científico publicado en 2011

Manipulation of FASTQ data with Galaxy

artículo científico publicado en 2010

Maternal age effect and severe germ-line bottleneck in the inheritance of human mitochondrial DNA.

artículo científico publicado en 2014

No more business as usual: Agile and effective responses to emerging pathogen threats require open data and open analytics

scientific article published on 13 August 2020

Online resources for genomic analysis using high-throughput sequencing

artículo científico publicado en 2015

PDAUG: a Galaxy based toolset for peptide library analysis, visualization, and machine learning modeling

scientific article published on 28 May 2022

Quantitative sequence-function relationships in proteins based on gene ontology

artículo científico publicado en 2007

Recommendations for the packaging and containerizing of bioinformatics software

Recommendations for the packaging and containerizing of bioinformatics software

artículo científico publicado en 2018

SimText: a text mining framework for interactive analysis and visualization of similarities among biomedical entities

artículo científico publicado en 2021

Software engineering for scientific big data analysis

artículo científico publicado en 2019

Sptlc1 is essential for myeloid differentiation and hematopoietic homeostasis

scientific article published on 01 November 2019

The Galaxy platform for accessible, reproducible and collaborative biomedical analyses: 2016 update

artículo científico publicado en 2016

The Galaxy platform for accessible, reproducible and collaborative biomedical analyses: 2018 update.

artículo científico publicado en 2018

Using Galaxy to perform large-scale interactive data analyses

artículo científico publicado en 2012

Wrangling Galaxy's reference data

artículo científico publicado en 2014

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