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Lista de obras de Runsheng Chen

A binary matrix factorization algorithm for protein complex prediction.

artículo científico publicado en 2011

A differential sequencing-based analysis of the C. elegans noncoding transcriptome

artículo científico publicado en 2012

A global identification and analysis of small nucleolar RNAs and possible intermediate-sized non-coding RNAs in Oryza sativa

artículo científico publicado en 2012

A novel scoring schema for peptide identification by searching protein sequence databases using tandem mass spectrometry data.

artículo científico publicado en 2006

Active retrotransposons help maintain pericentromeric heterochromatin required for faithful cell division

artículo científico publicado en 2020

An iterative algorithm to quantify factors influencing peptide fragmentation during tandem mass spectrometry

artículo científico publicado en 2007

Analysis of potential functional regions using local degeneracy: mutational hotspots in human factor IX are localized in high-degeneracy regions

scientific article published on 01 November 1994

Analysis of the p53/CEP-1 regulated non-coding transcriptome in C. elegans by an NSR-seq strategy

artículo científico publicado en 2014

Analyzing and modeling the inhibitory effect of phosphatidic acid on the GTP-gamma-S binding activity of Goalpha

artículo científico publicado en 2008

Association of the Polymorphism rs13259960 in SLEAR With Predisposition to Systemic Lupus Erythematosus

scientific article published on 12 January 2020

Autosomal similarity revealed by eukaryotic genomic comparison.

artículo científico publicado en 2004

Characterization of l-asparaginase fused with a protective ScFv and the protection mechanism.

artículo científico publicado en 2000

CloudLCA: finding the lowest common ancestor in metagenome analysis using cloud computing.

artículo científico publicado en 2012

Coincident indices of exons and introns.

artículo científico publicado en 1993

Comparison of properties of tumor necrosis factor-alpha converting enzyme (TACE) and some matrix metalloproteases (MMPs) in catalytic domains

artículo científico publicado en 2006

Conservation analysis of small RNA genes in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2004

Conservation of ribosomal protein gene ordering in 16 complete genomes

artículo científico publicado en 2000

Conserved distances between vertebrate highly conserved elements

artículo científico publicado en 2006

Date of origin of the SARS coronavirus strains

artículo científico publicado en 2004

Development of a versatile, target-oriented tiling microarray assay for measuring allele-specific gene expression

artículo científico publicado en 2010

Discovery of Plasma Membrane-Associated RNAs through APEX-seq

scientific article published in 2021

Dynamic changes in subgraph preference profiles of crucial transcription factors

artículo científico publicado en 2006

Estimating the quality of reprogrammed cells using ES cell differentiation expression patterns

artículo científico publicado en 2011

Evolution and migration history of the Chinese population inferred from Chinese Y-chromosome evidence

artículo científico publicado en 2004

Evolutionarily conserved multisubunit RBL2/p130 and E2F4 protein complex represses human cell cycle-dependent genes in quiescence

artículo científico publicado en 2007

Experimental RNomics and genomic comparative analysis reveal a large group of species-specific small non-message RNAs in the silkworm Bombyx mori

artículo científico publicado en 2011

Expression in Escherichia coli, purification and characterization of Thermoanaerobacter tengcongensis ribosome recycling factor

scientific article published on 01 July 2005

Faster and more accurate global protein function assignment from protein interaction networks using the MFGO algorithm

artículo científico publicado en 2006

Fractal dimension of exon and intron sequences

artículo científico publicado en 1995

Fractal geometry study of DNA binding proteins

artículo científico publicado en 1994

Functional Characterization of Long Noncoding RNA Lnc_bc060912 in Human Lung Carcinoma Cells.

artículo científico publicado en 2015

G protein beta 3 subunit gene variants and essential hypertension in the northern Chinese Han population.

artículo científico publicado en 2005

Generating a long DNA fragment of the target ncRNA for quantitative polymerase chain reaction by combining ncRNA-oligos hybridization and oligos ligation.

artículo científico publicado en 2015

Genome-scale identification of Caenorhabditis elegans regulatory elements by tiling-array mapping of DNase I hypersensitive sites.

artículo científico publicado en 2009

Genome-wide analysis of mammalian DNA segment fusion/fission.

artículo científico publicado en 2005

Genome-wide association study in Han Chinese identifies four new susceptibility loci for coronary artery disease

artículo científico publicado en 2012

Genome-wide identification of cancer-related polyadenylated and non-polyadenylated RNAs in human breast and lung cell lines.

artículo científico

GenomeComp: a visualization tool for microbial genome comparison

artículo científico publicado en 2003

Global epigenetic and transcriptional trends among two rice subspecies and their reciprocal hybrids

artículo científico publicado en 2010

Global identification and characterization of transcriptionally active regions in the rice genome

artículo científico publicado en 2007

Gold nanoparticle-assisted primer walking for closing the human chromosomal gap

article published in 2013

Identification and analysis of intermediate-size noncoding RNAs in the rhesus macaque fetal brain.

artículo científico publicado en 2017

Identification of intermediate-size non-coding RNAs involved in the UV-induced DNA damage response in C. elegans

artículo científico publicado en 2012

Identifying Hfq-binding small RNA targets in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2006

In vivo analysis of Caenorhabditis elegans noncoding RNA promoter motifs

artículo científico publicado en 2008

Integrated analysis of multiple data sources reveals modular structure of biological networks

artículo científico publicado en 2006

Integrated sequence-structure motifs suffice to identify microRNA precursors.

artículo científico publicado en 2012

Lateralization of gene expression in the honeybee brain during olfactory learning

artículo científico publicado en 2016

Lipoprotein lipase gene polymorphisms and blood pressure levels in the Northern Chinese Han population

scientific article published on 01 June 2004

LncKdm2b controls self-renewal of embryonic stem cells via activating expression of transcription factor Zbtb3.

artículo científico publicado en 2018

LncRNA HAND2-AS1 promotes liver cancer stem cell self-renewal via BMP signaling

scientific article published on 23 July 2019

Long Noncoding RNA ADINR Regulates Adipogenesis by Transcriptionally Activating C/EBPα

artículo científico publicado en 2015

Long non-coding RNAs function annotation: a global prediction method based on bi-colored networks

artículo científico publicado en 2012

Long noncoding RNA lncKdm2b is required for ILC3 maintenance by initiation of Zfp292 expression.

artículo científico publicado en 2017

MicroRNA-encoding long non-coding RNAs

artículo científico publicado en 2008

Microarray analysis of ncRNA expression patterns in Caenorhabditis elegans after RNAi against snoRNA associated proteins

artículo científico publicado en 2008

Model-based analysis of two-color arrays (MA2C).

artículo científico publicado en 2007

Modeling and docking of the three-dimensional structure of the human melanocortin 4 receptor

artículo científico publicado en 2003

NMPP: a user-customized NimbleGen microarray data processing pipeline

artículo científico publicado en 2006

NONCODE 2016: an informative and valuable data source of long non-coding RNAs.

artículo científico publicado en 2015

NONCODE v3.0: integrative annotation of long noncoding RNAs

artículo científico publicado en 2012

NONCODE: an integrated knowledge database of non-coding RNAs

artículo científico publicado en 2005

NONCODEv4: exploring the world of long non-coding RNA genes

artículo científico publicado en 2014

NPInter v2.0: an updated database of ncRNA interactions

artículo científico publicado en 2013

NPInter v3.0: an upgraded database of noncoding RNA-associated interactions

artículo científico publicado en 2016

NPInter: the noncoding RNAs and protein related biomacromolecules interaction database

artículo científico publicado en 2006

One novel long noncoding RNA lnc10 in Drosophila.

artículo científico publicado en 2014

Organization of the Caenorhabditis elegans small non-coding transcriptome: genomic features, biogenesis, and expression

artículo científico publicado en 2005

Phylophenetic properties of metabolic pathway topologies as revealed by global analysis

artículo científico publicado en 2006

Predicting housekeeping genes based on Fourier analysis

artículo científico publicado en 2011

Prediction of structured non-coding RNAs in the genomes of the nematodesCaenorhabditis elegans andCaenorhabditis briggsae

scholarly article by Kristin Missal et al published 15 July 2006 in Journal of Experimental Zoology. Part B: Molecular and Developmental Evolution

Profiling Caenorhabditis elegans non-coding RNA expression with a combined microarray

artículo científico publicado en 2006

Proteome-wide analysis of protein function composition reveals the clustering and phylogenetic properties of organisms

artículo científico publicado en 2002

Regulatory elements of Caenorhabditis elegans ribosomal protein genes

artículo científico publicado en 2012

SmProt: a database of small proteins encoded by annotated coding and non-coding RNA loci

artículo científico publicado en 2017

Small RNA in rice genome

scientific article published on 01 October 2002

Structural and functional analysis of a MADS box containing genomic DNA sequence cloned from rice

artículo científico publicado en 1998

Systematic identification and characterization of chicken (Gallus gallus) ncRNAs

artículo científico publicado en 2009

Systematic identification and evolutionary features of rhesus monkey small nucleolar RNAs

artículo científico publicado en 2010

Systematic identification of genes involved in divergent skeletal muscle growth rates of broiler and layer chickens

artículo científico publicado en 2009

Systematic identification of non-coding RNA 2,2,7-trimethylguanosine cap structures in Caenorhabditis elegans

artículo científico publicado en 2007

The Caenorhabditis elegans intermediate-size transcriptome shows high degree of stage-specific expression

artículo científico publicado en 2011

The DNA sequence, annotation and analysis of human chromosome 3

artículo científico publicado en 2006

The Landscape of Viral Expression Reveals Clinically Relevant Viruses with Potential Capability of Promoting Malignancy in Lower-Grade Glioma

artículo científico publicado en 2016

The interactome as a tree--an attempt to visualize the protein-protein interaction network in yeast

artículo científico publicado en 2004

The long noncoding RNA SNHG1 promotes tumor growth through regulating transcription of both local and distal genes

artículo científico publicado en 2017

The long noncoding RNA lncTCF7 promotes self-renewal of human liver cancer stem cells through activation of Wnt signaling

artículo científico

The properties and functions of virus encoded microRNA, siRNA, and other small noncoding RNAs

scientific article published on 01 January 2008

Transcription network analysis by a sparse binary factor analysis algorithm.

artículo científico publicado en 2012

Transcriptional inhibiton of Hoxd4 expression by miRNA-10a in human breast cancer cells

artículo científico publicado en 2009

Utilizing sequence intrinsic composition to classify protein-coding and long non-coding transcripts

scientific article published on 27 July 2013

antiCODE: a natural sense-antisense transcripts database

artículo científico publicado en 2007

β-Catenin safeguards the ground state of mousepluripotency by strengthening the robustness of the transcriptional apparatus

scientific article published on 17 July 2020