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Lista de obras de Philip N Benfey

3D phenotyping and quantitative trait locus mapping identify core regions of the rice genome controlling root architecture

artículo científico publicado en 2013

A Co-opted Regulator of Lateral Root Development Controls Nodule Organogenesis in Lotus

artículo científico publicado en 2020

A Friend in Need (of Nutrients) Is a….

artículo científico publicado en 2016

A SIMPLE Pipeline for Mapping Point Mutations.

artículo científico publicado en 2017

A bistable circuit involving SCARECROW-RETINOBLASTOMA integrates cues to inform asymmetric stem cell division

artículo científico publicado en 2012

A broad competence to respond to SHORT ROOT revealed by tissue-specific ectopic expression

artículo científico publicado en 2004

A gene expression map of the Arabidopsis root

artículo científico publicado en 2003

A gene regulatory network for root epidermis cell differentiation in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2012

A high-resolution root spatiotemporal map reveals dominant expression patterns.

artículo científico publicado en 2007

A microfluidic device and computational platform for high-throughput live imaging of gene expression

artículo científico publicado en 2012

A single-cell Arabidopsis root atlas reveals developmental trajectories in wild-type and cell identity mutants

artículo científico publicado en 2022

A stele-enriched gene regulatory network in the Arabidopsis root

artículo científico publicado en 2011

ASYMMETRIC CELL DIVISION IN PLANTS.

artículo científico publicado en 1999

Advanced imaging techniques for the study of plant growth and development

artículo científico publicado en 2014

An auxin gradient and maximum in the Arabidopsis root apex shown by high-resolution cell-specific analysis of IAA distribution and synthesis

artículo científico publicado en 2009

An evolutionarily conserved mechanism delimiting SHR movement defines a single layer of endodermis in plants

artículo científico

Analyzing lateral root development: how to move forward

artículo científico publicado en 2012

Anchorene is a carotenoid-derived regulatory metabolite required for anchor root formation in Arabidopsis

scientific article published on 27 November 2019

Apical-basal polarity: why plant cells don't stand on their heads.

artículo científico publicado en 2005

Arabidopsis thaliana as a model organism in systems biology

artículo científico publicado en 2009

Auxin minimum triggers the developmental switch from cell division to cell differentiation in the Arabidopsis root

artículo científico publicado en 2017

Bimodular auxin response controls organogenesis in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2010

Both the conserved GRAS domain and nuclear localization are required for SHORT-ROOT movement

scientific article published on 04 December 2008

Brassinosteroid gene regulatory networks at cellular resolution in the <i>Arabidopsis</i> root

artículo científico publicado en 2023

COBRA, an Arabidopsis extracellular glycosyl-phosphatidyl inositol-anchored protein, specifically controls highly anisotropic expansion through its involvement in cellulose microfibril orientation

article by François Roudier et al published June 2005 in The Plant Cell

Cell identity mediates the response of Arabidopsis roots to abiotic stress.

artículo científico publicado en 2008

Cell identity regulators link development and stress responses in the Arabidopsis root

artículo científico publicado en 2011

Cell signalling by microRNA165/6 directs gene dose-dependent root cell fate.

artículo científico publicado en 2010

Cell type-specific expression profiling in plants via cell sorting of protoplasts from fluorescent reporter lines

artículo científico publicado en 2005

Cell type‐specific transcriptional profiling: implications for metabolite profiling ⬇️

artículo científico publicado el 1 de abril de 2012

Cell wall remodeling and vesicle trafficking mediate the root clock in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2020

Combining expression and comparative evolutionary analysis. The COBRA gene family

artículo científico publicado en 2006

Control of Arabidopsis Root Development ⬇️

artículo científico publicado el 9 de febrero de 2012

Control of Arabidopsis lateral root primordium boundaries by MYB36.

artículo científico publicado en 2016

Correction: Whole-Genome Analysis of the SHORT-ROOT Developmental Pathway in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2006

Cortex proliferation: simple phenotype, complex regulatory mechanisms

artículo científico publicado en 2009

Detecting separate time scales in genetic expression data

artículo científico publicado en 2010

Distinct sensitivities to phosphate deprivation suggest that RGF peptides play disparate roles in Arabidopsis thaliana root development

artículo científico publicado en 2015

Establishment of Expression in the SHORTROOT-SCARECROW Transcriptional Cascade through Opposing Activities of Both Activators and Repressors.

artículo científico publicado en 2016

Evolution, interactions, and biological networks

artículo científico publicado en 2007

Fluorescence-activated cell sorting in plant developmental biology

artículo científico publicado en 2010

Framework for gradual progression of cell ontogeny in the Arabidopsis root meristem

artículo científico publicado en 2017

From genotype to phenotype: systems biology meets natural variation

artículo científico publicado en 2008

Functional genomics of root growth and development in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2008

GTL1 and DF1 regulate root hair growth through transcriptional repression of ROOT HAIR DEFECTIVE 6-LIKE 4 in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2018

Genes and networks regulating root anatomy and architecture.

artículo científico

Genotypic recognition and spatial responses by rice roots

artículo científico publicado en 2013

Getting to the root of plant biology: impact of the Arabidopsis genome sequence on root research

artículo científico publicado en 2010

GiA Roots: software for the high throughput analysis of plant root system architecture.

artículo científico publicado en 2012

Growth control of root architecture

scholarly article published 2012

HEC of a job regulating stem cells.

artículo científico publicado en 2014

High-Resolution Expression Map of the Arabidopsis Root Reveals Alternative Splicing and lincRNA Regulation

artículo científico publicado en 2016

High-Throughput, Noninvasive Imaging of Root Systems

scientific article published on 01 January 2013

High-resolution experimental and computational profiling of tissue-specific known and novel miRNAs in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2011

High-resolution metabolic mapping of cell types in plant roots

artículo científico publicado en 2013

High-throughput RNA isolation technologies. New tools for high-resolution gene expression profiling in plant systems.

artículo científico publicado en 2005

High-throughput phenotyping of multicellular organisms: finding the link between genotype and phenotype ⬇️

artículo científico publicado el 28 de marzo de 2011

Histone Deacetylase HDA19 Affects Root Cortical Cell Fate by Interacting with SCARECROW

scientific article published on 08 February 2019

Identifying Gene Regulatory Networks in Arabidopsis by In Silico Prediction, Yeast-1-Hybrid, and Inducible Gene Profiling Assays

artículo científico publicado en 2016

Imaging and analysis platform for automatic phenotyping and trait ranking of plant root systems

artículo científico publicado en 2010

Information processing without brains--the power of intercellular regulators in plants

artículo científico publicado en 2010

Integrated detection of natural antisense transcripts using strand-specific RNA sequencing data

artículo científico publicado en 2013

Integrated functional networks of process, tissue, and developmental stage specific interactions in Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 2010

Integrating gene flow, crop biology, and farm management in on‐farm conservation of avocado (Persea americana, Lauraceae) ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2003

Integrative systems biology: an attempt to describe a simple weed

artículo científico publicado en 2012

Intercellular communication during plant development.

scientific article published on 08 March 2011

Intercellular movement of the putative transcription factor SHR in root patterning.

artículo científico publicado en 2001

Intergenic and genic sequence lengths have opposite relationships with respect to gene expression

artículo científico publicado en 2008

Interplay between SCARECROW, GA and LIKE HETEROCHROMATIN PROTEIN 1 in ground tissue patterning in the Arabidopsis root

artículo científico publicado en 2009

Lateral Root Initiation: The Emergence of New Primordia Following Cell Death

scientific article published on 01 February 2020

MYB36 regulates the transition from proliferation to differentiation in the Arabidopsis root

artículo científico publicado en 2015

Manipulating large-scale Arabidopsis microarray expression data: identifying dominant expression patterns and biological process enrichment

artículo científico publicado en 2009

Maturation of the ground tissue of the root is regulated by gibberellin and SCARECROW and requires SHORT-ROOT.

artículo científico publicado en 2005

Mechanism and function of root circumnutation

artículo científico publicado en 2021

Mechanism and function of root circumnutation

Mechanism of Dual Targeting of the Phytochrome Signaling Component HEMERA/pTAC12 to Plastids and the Nucleus.

artículo científico publicado en 2017

Mechanisms regulating SHORT-ROOT intercellular movement

artículo científico publicado en 2004

MicroRNA miR396 Regulates the Switch between Stem Cells and Transit-Amplifying Cells in Arabidopsis Roots

artículo científico publicado en 2015

Minimum requirements for changing and maintaining endodermis cell identity in the Arabidopsis root

artículo científico publicado en 2018

Molecular analysis of the SCARECROW gene in maize reveals a common basis for radial patterning in diverse meristems.

artículo científico publicado en 2000

Network building: transcriptional circuits in the root

artículo científico publicado en 2004

Omics meet networks - using systems approaches to infer regulatory networks in plants

scientific article published on 28 December 2009

Oscillating gene expression determines competence for periodic Arabidopsis root branching

artículo científico publicado en 2010

Paired-end analysis of transcription start sites in Arabidopsis reveals plant-specific promoter signatures

artículo científico publicado en 2014

Patterning the primary root in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2012

Periodic root branching in Arabidopsis requires synthesis of an uncharacterized carotenoid derivative

artículo científico publicado en 2014

Phage-Resistant Bacteria Reveal a Role for Potassium in Root Colonization

artículo científico publicado en 2021

Plant science decadal vision 2020-2030: Reimagining the potential of plants for a healthy and sustainable future

scientific article published on 01 August 2020

Plant stem cell niches: standing the test of time

artículo científico publicado en 2008

Polarized Radicals ⬇️

artículo científico publicado el 11 de abril de 2013

Primer and interviews: Gene regulation in Arabidopsis thaliana. Interview by Julie C. Kiefer

artículo científico publicado en 2009

Protocol for fast scRNA-seq raw data processing using scKB and non-arbitrary quality control with COPILOT

artículo científico publicado en 2022

Protonophore- and pH-insensitive glucose and sucrose accumulation detected by FRET nanosensors in Arabidopsis root tips

artículo científico publicado en 2008

Quantification of transcription factor expression from Arabidopsis images

artículo científico publicado en 2006

Quantitative trait locus mapping reveals regions of the maize genome controlling root system architecture.

artículo científico publicado en 2015

RGF1 controls root meristem size through ROS signalling

scientific article published on 04 December 2019

Receptor-like kinase ACR4 restricts formative cell divisions in the Arabidopsis root.

artículo científico publicado en 2008

Reconstructing spatiotemporal gene expression data from partial observations

artículo científico publicado en 2009

Regulation of Division and Differentiation of Plant Stem Cells

artículo científico publicado en 2018

Root development

artículo científico publicado en 2000

Root layers: complex regulation of developmental patterning

artículo científico publicado en 2008

Shootward and rootward: peak terminology for plant polarity

article

Signaling in and out: control of cell division and differentiation in the shoot and root.

artículo científico publicado en 2002

Signals that regulate stem cell activity during plant development

artículo científico publicado en 2005

Spatial coordination between stem cell activity and cell differentiation in the root meristem

artículo científico publicado en 2013

Spatiotemporal regulation of cell-cycle genes by SHORTROOT links patterning and growth.

artículo científico publicado en 2010

Stem cell research goes underground: the RETINOBLASTOMA-RELATED gene in root development

artículo científico publicado en 2005

Super-resolution ribosome profiling reveals unannotated translation events in Arabidopsis.

artículo científico publicado en 2016

Symmetry breaking in plants: molecular mechanisms regulating asymmetric cell divisions in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2009

Systems approaches to identifying gene regulatory networks in plants.

artículo científico publicado en 2008

Systems biology.

artículo científico publicado en 2004

The AUXIN BINDING PROTEIN 1 is required for differential auxin responses mediating root growth

artículo científico publicado en 2009

The COBRA family of putative GPI-anchored proteins in Arabidopsis. A new fellowship in expansion

artículo científico publicado en 2002

The Lateral Root Cap Acts as an Auxin Sink that Controls Meristem Size

artículo científico publicado en 2019

The SCARECROW gene regulates an asymmetric cell division that is essential for generating the radial organization of the Arabidopsis root.

artículo científico publicado en 1996

The auxin influx carrier LAX3 promotes lateral root emergence

article

The bHLH transcription factor POPEYE regulates response to iron deficiency in Arabidopsis roots

artículo científico publicado en 2010

The protein expression landscape of the Arabidopsis root.

artículo científico publicado en 2012

Time-based patterning in development: The role of oscillating gene expression.

artículo científico publicado en 2011

Tissue-Specific Transcriptome Profiling in Arabidopsis Roots

artículo científico publicado en 2017

To branch or not to branch: the role of pre-patterning in lateral root formation

artículo científico publicado en 2013

Tracking transcription factor mobility and interaction in Arabidopsis roots with fluorescence correlation spectroscopy

artículo científico publicado en 2016

Transcription factors and hormones: new insights into plant cell differentiation

artículo científico publicado en 2006

Transcriptional and posttranscriptional regulation of transcription factor expression in Arabidopsis roots

artículo científico publicado en 2006

Transcriptional control of tissue formation throughout root development

artículo científico publicado en 2015

Transcriptional networks controlling plant development

artículo científico publicado en 2001

Transcriptional networks in root cell fate specification

artículo científico publicado en 2008

Transcriptional profile of the Arabidopsis root quiescent center

artículo científico publicado en 2005

Transcriptional regulation of ROS controls transition from proliferation to differentiation in the root

artículo científico publicado en 2010

Transcriptional switches direct plant organ formation and patterning.

artículo científico publicado en 2012

Uncovering Gene Regulatory Networks Controlling Plant Cell Differentiation

artículo científico publicado en 2017

Unique cell-type-specific patterns of DNA methylation in the root meristem.

artículo científico publicado en 2016

Unraveling the dynamic transcriptome

artículo científico publicado en 2006

Using cauliflower to find conserved non-coding regions in Arabidopsis

scientific article published on 01 June 2002

Whole-genome analysis of the SHORT-ROOT developmental pathway in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2006

X-Ray Computed Tomography Reveals the Response of Root System Architecture to Soil Texture

artículo científico publicado en 2016

managedpop: a computer simulation to project allelic diversity in managed populations with overlapping generations

artículo científico publicado en 2002

β-Cyclocitral is a conserved root growth regulator

scientific article published on 08 May 2019

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