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Lista de obras de Crina-Maria Ionescu

AtomicChargeCalculator: interactive web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug-like molecules

artículo científico publicado en 2015

Charge profile analysis reveals that activation of pro-apoptotic regulators Bax and Bak relies on charge transfer mediated allosteric regulation

artículo científico publicado en 2012

Consistency of sugar structures and their annotation in the PDB.

artículo científico publicado en 2014

CrocoBLAST: Running BLAST efficiently in the age of next-generation sequencing

artículo científico publicado en 2017

Empirical charges for chemoinformatics applications.

artículo científico publicado en 2014

How Does the Methodology of 3D Structure Preparation Influence the Quality of pKa Prediction?

scientific article published on 11 June 2015

MOLE 2.0: advanced approach for analysis of biomacromolecular channels

artículo científico publicado en 2013

MOLEonline 2.0: interactive web-based analysis of biomacromolecular channels

artículo científico publicado en 2012

MotiveValidator: interactive web-based validation of ligand and residue structure in biomolecular complexes

artículo científico publicado en 2014

PatternQuery: web application for fast detection of biomacromolecular structural patterns in the entire Protein Data Bank

artículo científico publicado en 2015

Predicting pK(a) values of substituted phenols from atomic charges: comparison of different quantum mechanical methods and charge distribution schemes

artículo científico publicado en 2011

Predicting pKa values from EEM atomic charges

artículo científico publicado en 2013

QM quality atomic charges for proteins.

artículo científico publicado en 2014

QSPR designer – employ your own descriptors in the automated QSAR modeling process.

artículo científico publicado en 2012

Rapid calculation of accurate atomic charges for proteins via the electronegativity equalization method

artículo científico publicado en 2013

Searching for tunnels of proteins – comparison of approaches and available software tools.

artículo científico publicado en 2012

SiteBinder – an improved approach for comparing multiple protein structural motifs. Case studies on biologically important motifs.

artículo científico publicado en 2012

SiteBinder: An Improved Approach for Comparing Multiple Protein Structural Motifs

scientific database

ValidatorDB: database of up-to-date validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank

artículo científico publicado en 2015

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