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Lista de obras de Gary L Andersen

A framework for human microbiome research

artículo científico publicado en 2012

A novel ecological role of the Firmicutes identified in thermophilic microbial fuel cells

artículo científico publicado en 2008

Accurate taxonomy assignments from 16S rRNA sequences produced by highly parallel pyrosequencers

artículo científico publicado en 2008

Airway microbiota and pathogen abundance in age-stratified cystic fibrosis patients

artículo científico publicado en 2010

An improved Greengenes taxonomy with explicit ranks for ecological and evolutionary analyses of bacteria and archaea

artículo científico publicado en 2012

Analysis of leaf and root transcriptomes of soil-grown Avena barbata plants

artículo científico publicado en 2011

Animal-to-animal variation in fecal microbial diversity among beef cattle

artículo científico publicado en 2010

Application of a high-density oligonucleotide microarray approach to study bacterial population dynamics during uranium reduction and reoxidation

artículo científico publicado en 2006

Application of phylogenetic microarray analysis to discriminate sources of fecal pollution.

artículo científico

Assays for the rapid and specific identification of North American Yersinia pestis and the common laboratory strain CO92.

artículo científico publicado en 2008

Automated group assignment in large phylogenetic trees using GRUNT: GRouping, Ungrouping, Naming Tool

artículo científico publicado en 2007

Bacterial Community Structure in Geographically Distributed Biological Wastewater Treatment Reactors

artículo científico publicado en 2010

Bacterial Diversity in the Cecum of the World’s Largest Living Rodent (Hydrochoerus hydrochaeris)

artículo científico publicado en 2011

Bacterial communities associated with a mineral weathering profile at a sulphidic mine tailings dump in arid Western Australia

article

Bacterial communities in commercial aircraft high-efficiency particulate air (HEPA) filters assessed by PhyloChip analysis ⬇️

artículo científico publicado el 8 de junio de 2012

Bacterial community structure corresponds to performance during cathodic nitrate reduction

artículo científico publicado en 2010

Bacterial community structure transformed after thermophilically composting human waste in Haiti.

artículo científico publicado en 2017

Bacterial diversity analysis of Huanglongbing pathogen-infected citrus, using PhyloChip arrays and 16S rRNA gene clone library sequencing

artículo científico publicado en 2009

Bacterial diversity and White Plague Disease-associated community changes in the Caribbean coral Montastraea faveolata

artículo científico publicado en 2009

Bacterial diversity of terrestrial crystalline volcanic rocks, Iceland

artículo científico publicado en 2011

Bacterial diversity of weathered terrestrial Icelandic volcanic glasses.

artículo científico publicado en 2010

Biodegradation of dispersed Macondo crude oil by indigenous Gulf of Mexico microbial communities.

artículo científico publicado en 2016

Biogeography of bacterioplankton in the tropical seawaters of Singapore

artículo científico publicado en 2013

Caulobacter crescentus as a whole-cell uranium biosensor

artículo científico publicado en 2007

Changes in the microbial community structure of bacteria, archaea and fungi in response to elevated CO(2) and warming in an Australian native grassland soil

artículo científico publicado en 2012

Changes of soil bacterial diversity as a consequence of agricultural land use in a semi-arid ecosystem

artículo científico publicado en 2013

Characterization of coastal urban watershed bacterial communities leads to alternative community-based indicators

artículo científico publicado en 2010

Chronic kidney disease alters intestinal microbial flora

artículo científico publicado en 2012

Comparative genomics of "Dehalococcoides ethenogenes" 195 and an enrichment culture containing unsequenced "Dehalococcoides" strains

artículo científico publicado en 2008

Comparative genomics of two newly isolated Dehalococcoides strains and an enrichment using a genus microarray

artículo científico publicado en 2011

Comparing bacterial community composition between healthy and white plague-like disease states in Orbicella annularis using PhyloChip™ G3 microarrays.

artículo científico publicado en 2013

Comparing bacterial community composition of healthy and dark spot-affected Siderastrea siderea in Florida and the Caribbean

artículo científico publicado en 2014

Comparison of fecal biota from specific pathogen free and feral mice

artículo científico publicado en 2006

Comparison of innovative molecular approaches and standard spore assays for assessment of surface cleanliness

artículo científico publicado en 2011

Comparison of the fecal microbiota in feral and domestic goats

artículo científico publicado en 2011

Compartmentalized microbial composition, oxygen gradients and nitrogen fixation in the gut of Odontotaenius disjunctus

artículo científico publicado en 2013

Complete Genome Sequence of Yersinia pestis Strains Antiqua and Nepal516: Evidence of Gene Reduction in an Emerging Pathogen

artículo científico publicado en 2006

Complexity and variability of gut commensal microbiota in polyphagous lepidopteran larvae

artículo científico publicado en 2012

Comprehensive aligned sequence construction for automated design of effective probes (CASCADE-P) using 16S rDNA.

artículo científico publicado en 2003

Comprehensive census of bacteria in clean rooms by using DNA microarray and cloning methods

artículo científico publicado en 2009

Coral transcriptome and bacterial community profiles reveal distinct Yellow Band Disease states in Orbicella faveolata.

artículo científico publicado en 2014

Core-satellite populations and seasonality of water meter biofilms in a metropolitan drinking water distribution system

artículo científico publicado en 2015

Coupling genetic and chemical microbiome profiling reveals heterogeneity of archaeome and bacteriome in subsurface biofilms that are dominated by the same archaeal species

artículo científico publicado en 2014

Deciphering the rhizosphere microbiome for disease-suppressive bacteria

artículo científico publicado en 2011

Deep-sea oil plume enriches indigenous oil-degrading bacteria

artículo científico publicado en 2010

Despite strong seasonal responses, soil microbial consortia are more resilient to long-term changes in rainfall than overlying grassland.

artículo científico publicado en 2009

Developing microbe-plant interactions for applications in plant-growth promotion and disease control, production of useful compounds, remediation and carbon sequestration

artículo científico publicado en 2009

Development of a high-volume aerosol collection system for the identification of air-borne micro-organisms

artículo científico publicado en 2002

Diversity of anaerobic microbes in spacecraft assembly clean rooms

artículo científico publicado en 2010

Diversity of bacterioplankton in contrasting Tibetan lakes revealed by high-density microarray and clone library analysis

artículo científico publicado en 2013

Ecogenomics reveals metals and land-use pressures on microbial communities in the waterways of a megacity

artículo científico publicado en 2015

Effect of rainfall-induced soil geochemistry dynamics on grassland soil microbial communities

artículo científico publicado en 2012

Effects of TiO2 and Ag nanoparticles on polyhydroxybutyrate biosynthesis by activated sludge bacteria.

artículo científico publicado en 2014

Environmental determinants of and impact on childhood asthma by the bacterial community in household dust

artículo científico publicado en 2010

Environmental genomics reveals a single-species ecosystem deep within Earth

artículo científico publicado en 2008

Environmental microarray analyses of Antarctic soil microbial communities

artículo científico publicado en 2008

Establishment of uncharacterized plasmids in Escherichia coli by in vitro transposition

artículo científico publicado en 2002

Evaluation of methods for the extraction of DNA from drinking water distribution system biofilms

artículo científico publicado en 2011

Evaluation of molecular community analysis methods for discerning fecal sources and human waste

artículo científico publicado en 2013

Expansion of urease- and uricase-containing, indole- and p-cresol-forming and contraction of short-chain fatty acid-producing intestinal microbiota in ESRD.

artículo científico publicado en 2014

Functional biogeography as evidence of gene transfer in hypersaline microbial communities

artículo científico publicado en 2010

Genome differences that distinguish Bacillus anthracis from Bacillus cereus and Bacillus thuringiensis

artículo científico publicado en 2003

Genome-Resolved Metagenomic Analysis Reveals Roles for Candidate Phyla and Other Microbial Community Members in Biogeochemical Transformations in Oil Reservoirs.

artículo científico publicado en 2016

Global transcriptomic and proteomic responses of Dehalococcoides ethenogenes strain 195 to fixed nitrogen limitation

artículo científico publicado en 2011

Greengenes, a chimera-checked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB

artículo científico publicado en 2006

High-density 16S microarray and clone library-based microbial community composition of the Phoenix spacecraft assembly clean room

artículo científico publicado en 2010

High-density PhyloChip profiling of stimulated aquifer microbial communities reveals a complex response to acetate amendment

artículo científico publicado en 2012

High-density microarray of small-subunit ribosomal DNA probes

artículo científico publicado en 2002

High-density universal 16S rRNA microarray analysis reveals broader diversity than typical clone library when sampling the environment

artículo científico publicado en 2007

Humic acid-oxidizing, nitrate-reducing bacteria in agricultural soils.

artículo científico publicado en 2011

Identification by Subtractive Hybridization of Sequences Specific for Salmonella enterica Serovar Enteritidis ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2001

Identification of genes associated with survival of Salmonella enterica serovar Enteritidis in chicken egg albumen

artículo científico publicado en 2006

Identification of nucleotide sequences for the specific and rapid detection of Yersinia pestis.

artículo científico publicado en 2001

Influence of geogenic factors on microbial communities in metallogenic Australian soils.

artículo científico publicado en 2012

Influence of trace erythromycin and eryhthromycin-H2O on carbon and nutrients removal and on resistance selection in sequencing batch reactors (SBRs).

artículo científico publicado en 2009

Integrated microbial survey analysis of prokaryotic communities for the PhyloChip microarray

artículo científico publicado en 2010

Intestinal microbiota as novel biomarkers of prior radiation exposure

artículo científico publicado en 2012

Long-term sustainability of a high-energy, low-diversity crustal biome

artículo científico publicado en 2006

Methane-Oxidizing Bacteria Shunt Carbon to Microbial Mats at a Marine Hydrocarbon Seep ⬇️

artículo científico publicado en 2017

Microbial Response to the MC-252 Oil and Corexit 9500 in the Gulf of Mexico

artículo científico publicado en 2012

Microbial and mineralogical characterizations of soils collected from the deep biosphere of the former Homestake gold mine, South Dakota

artículo científico publicado en 2010

Microbial biogeography across a full-scale wastewater treatment plant transect: evidence for immigration between coupled processes

artículo científico publicado en 2014

Microbial community analysis of a coastal salt marsh affected by the Deepwater Horizon oil spill

artículo científico publicado en 2012

Microbial community dynamics of an urban drinking water distribution system subjected to phases of chloramination and chlorination treatments

artículo científico publicado en 2012

Microbial community responses to organophosphate substrate additions in contaminated subsurface sediments

artículo científico publicado en 2014

Microbial community structures of novel Icelandic hot spring systems revealed by PhyloChip G3 analysis

artículo científico publicado en 2014

Microbial diversity in uranium mining-impacted soils as revealed by high-density 16S microarray and clone library

artículo científico publicado en 2010

Microbial secondary succession in a chronosequence of chalk grasslands

artículo científico publicado en 2010

Microbial source tracking in impaired watersheds using PhyloChip and machine-learning classification

artículo científico

New perspectives on viable microbial communities in low-biomass cleanroom environments

artículo científico publicado en 2012

Olive-mill wastewater bacterial communities display a cultivar specific profile

artículo científico publicado en 2011

PCR amplification-independent methods for detection of microbial communities by the high-density microarray PhyloChip

artículo científico publicado en 2011

PhyloChip hybridization uncovered an enormous bacterial diversity in the rhizosphere of different potato cultivars: many common and few cultivar-dependent taxa

artículo científico publicado en 2011

PhyloChip™ microarray comparison of sampling methods used for coral microbial ecology

artículo científico publicado en 2011

Phylogenetic microarray analysis of a microbial community performing reductive dechlorination at a TCE-contaminated site

artículo científico publicado en 2011

Prokaryotic community profiles at different operational stages of a Greek solar saltern

artículo científico publicado en 2008

PyNAST: a flexible tool for aligning sequences to a template alignment

artículo científico publicado en 2010

Pyrosequencing analysis of bacterial biofilm communities in water meters of a drinking water distribution system

artículo científico publicado en 2010

Quo vadis? Microbial profiling revealed strong effects of cleanroom maintenance and routes of contamination in indoor environments

artículo científico publicado en 2015

Rapid quantification and taxonomic classification of environmental DNA from both prokaryotic and eukaryotic origins using a microarray

artículo científico publicado en 2005

Reply to Delmont and Eren: Strain variants and population structure during the Deepwater Horizon oil spill

artículo científico publicado en 2017

Selective progressive response of soil microbial community to wild oat roots

artículo científico publicado en 2008

Sequence-specific identification of 18 pathogenic microorganisms using microarray technology.

artículo científico publicado en 2002

Shifts in the phylogenetic structure and functional capacity of soil microbial communities follow alteration of native tussock grassland ecosystems

scholarly article by Steven A. Wakelin et al published February 2013 in Soil Biology and Biochemistry

Simrank: Rapid and sensitive general-purpose k-mer search tool

artículo científico publicado en 2011

Simulation of Deepwater Horizon oil plume reveals substrate specialization within a complex community of hydrocarbon degraders

artículo científico publicado en 2017

Single-Nucleotide Polymorphisms Reveal Spatial Diversity Among Clones of Yersinia pestis During Plague Outbreaks in Colorado and the Western United States

artículo científico publicado en 2015

Soil microbial community successional patterns during forest ecosystem restoration.

artículo científico publicado en 2011

Structure, function and diversity of the healthy human microbiome

artículo científico publicado en 2012

Succession of hydrocarbon-degrading bacteria in the aftermath of the deepwater horizon oil spill in the gulf of Mexico

artículo científico publicado en 2013

Sustainable syntrophic growth of Dehalococcoides ethenogenes strain 195 with Desulfovibrio vulgaris Hildenborough and Methanobacterium congolense: global transcriptomic and proteomic analyses

artículo científico publicado en 2011

Tackling the minority: sulfate-reducing bacteria in an archaea-dominated subsurface biofilm

artículo científico publicado en 2012

Temperature and injection water source influence microbial community structure in four Alaskan North Slope hydrocarbon reservoirs

artículo científico publicado en 2014

Temporal transcriptomic microarray analysis of "Dehalococcoides ethenogenes" strain 195 during the transition into stationary phase

artículo científico publicado en 2008

The influence of in situ chemical oxidation on microbial community composition in groundwater contaminated with chlorinated solvents

artículo científico publicado en 2012

The response of marine picoplankton to ocean acidification

artículo científico publicado en 2012

Transcriptomic microarray analysis of corrinoid responsive genes in Dehalococcoides ethenogenes strain 195.

artículo científico publicado en 2009

Truffle brûlés have an impact on the diversity of soil bacterial communities

artículo científico publicado en 2013

Urban aerosols harbor diverse and dynamic bacterial populations

artículo científico publicado en 2006

Use of subtractive hybridization for comprehensive surveys of prokaryotic genome differences

artículo científico publicado en 2002

Whole-genome transcriptional analysis of heavy metal stresses in Caulobacter crescentus

artículo científico publicado en 2005

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