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Lista de obras de Lukáš Pravda

Anatomy of enzyme channels

artículo científico publicado en 2014

AtomicChargeCalculator: interactive web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug-like molecules

artículo científico publicado en 2015

Biomacromolecular Fragments and Patterns

Channel Characteristics

ChannelsDB: database of biomacromolecular tunnels and pores

artículo científico publicado en 2017

Characterization via Charges

Complete Process of Data Extraction and Analysis

Concluding Remarks

Detection and Extraction of Fragments

Detection of Channels

Exercises Solution

Finding enzyme cofactors in Protein Data Bank

artículo científico publicado en 2019

Introduction

LiteMol suite: interactive web-based visualization of large-scale macromolecular structure data

artículo científico publicado en 2017

MOLE 2.0: advanced approach for analysis of biomacromolecular channels

artículo científico publicado en 2013

MOLEonline: a web-based tool for analyzing channels, tunnels and pores (2018 update).

artículo científico publicado en 2018

Mole 2.5 - Tool for Detection and Analysis of Macromolecular Pores and Channels

scholarly article by Karel Berka et al published February 2017 in Biophysical Journal

MotiveValidator: interactive web-based validation of ligand and residue structure in biomolecular complexes

artículo científico publicado en 2014

PDBe: improved findability of macromolecular structure data in the PDB

artículo científico publicado en 2020

PDBsum: Structural summaries of PDB entries

artículo científico publicado en 2017

PatternQuery: web application for fast detection of biomacromolecular structural patterns in the entire Protein Data Bank

artículo científico publicado en 2015

Structural Bioinformatics Databases of General Use

Structural Bioinformatics Tools for Drug Design

The Diversity of Yellow-Related Proteins in Sand Flies (Diptera: Psychodidae).

artículo científico publicado en 2016

The Eighth Central European Conference "Chemistry towards Biology": Snapshot

artículo científico publicado en 2016

Validation

book chapter in Structural Bioinformatics Tools for Drug Design (2016)

ValidatorDB: database of up-to-date validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank

artículo científico publicado en 2015

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