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Lista de obras de Kristen Naegle

ASPEN, a methodology for reconstructing protein evolution with improved accuracy using ensemble models

scientific article published on 17 October 2019

ASPEN: Analyzing and reconstructing protein divergence using sequence subsampling

artículo científico publicado en 2017

Accounting for noise when clustering biological data

artículo científico publicado en 2012

An integrated comparative phosphoproteomic and bioinformatic approach reveals a novel class of MPM-2 motifs upregulated in EGFRvIII-expressing glioblastoma cells

artículo científico publicado en 2008

Avoiding common pitfalls when clustering biological data

artículo científico publicado en 2016

Criteria for biological reproducibility: what does "n" mean?

artículo científico

Design Considerations for a 10GHz CMOS Transmit-Receive Switch

scholarly article

Different Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) Agonists Produce Unique Signatures for the Recruitment of Downstream Signaling Proteins

artículo científico publicado en 2016

Ensemble clustering of phosphoproteomic data identifies differences in protein interactions and cell-cell junction integrity of HER2-overexpressing cells

artículo científico publicado en 2017

High-Resolution Identification of Specificity Determining Positions in the LacI Protein Family Using Ensembles of Sub-Sampled Alignments.

artículo científico publicado en 2016

Injury-Induced HDAC5 Nuclear Export Is Essential for Axon Regeneration

artículo científico publicado en 2015

Injury-induced HDAC5 nuclear export is essential for axon regeneration.

artículo científico publicado en 2013

MCAM: multiple clustering analysis methodology for deriving hypotheses and insights from high-throughput proteomic datasets

artículo científico publicado en 2011

New analysis pipeline for high-throughput domain-peptide affinity experiments improves SH2 interaction data

artículo científico publicado en 2020

PTMScout, a Web resource for analysis of high throughput post-translational proteomics studies

artículo científico publicado en 2010

Phosphoproteomics of collagen receptor networks reveals SHP-2 phosphorylation downstream of wild-type DDR2 and its lung cancer mutants

artículo científico publicado en 2013

ProteoClade: A taxonomic toolkit for multi-species and metaproteomic analysis

artículo científico publicado en 2020

ProteomeScout: a repository and analysis resource for post-translational modifications and proteins.

artículo científico publicado en 2014

Reproducible Analysis of Post-Translational Modifications in Proteomes--Application to Human Mutations

artículo científico publicado en 2015

Ten simple rules for effective presentation slides

artículo científico publicado en 2021

Using ProteomeScout: A Resource of Post-Translational Modifications, Their Experiments, and the Proteins That They Annotate

artículo científico publicado en 2017

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