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Lista de obras de Rafael Jimenez

A community proposal to integrate proteomics activities in ELIXIR

artículo científico publicado en 2017

A global perspective on bioinformatics training needs

A new reference implementation of the PSICQUIC web service

scientific article published on 13 May 2013

Best practices in bioinformatics training for life scientists

artículo científico publicado en 2013

BioCIDER: a Contextualisation InDEx for biological Resources discovery

artículo científico publicado en 2017

BioContainers: An open-source and community-driven framework for software standardization

artículo científico publicado en 2017

BioJS: an open source JavaScript framework for biological data visualization

artículo científico publicado en 2013

BioJS: an open source standard for biological visualisation - its status in 2014

artículo científico publicado en 2014

Bioinformatics Training Network (BTN): a community resource for bioinformatics trainers.

artículo científico publicado en 2011

Bioinformatics Workflows and Web Services in Systems Biology Made Easy for Experimentalists

artículo científico publicado en 2013

Bioschemas: From Potato Salad to Protein Annotation ⬇️

artículo científico publicado en 2017

DAS writeback: a collaborative annotation system ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Dasty2, an Ajax protein DAS client

artículo científico publicado en 2008

Dasty3, a WEB framework for DAS.

artículo científico

Data integration in biological research: an overview

artículo científico publicado en 2015

Discovering and linking public omics data sets using the Omics Discovery Index.

artículo científico publicado en 2017

FAIRsharing, a cohesive community approach to the growth in standards, repositories and policies

Four simple recommendations to encourage best practices in research software

artículo científico publicado en 2017

Future opportunities and trends for e-infrastructures and life sciences: going beyond the grid to enable life science data analysis

artículo científico publicado en 2015

General guidelines for biomedical software development.

artículo científico publicado en 2017

Identifiers for the 21st century: How to design, provision, and reuse persistent identifiers to maximize utility and impact of life science data

artículo científico publicado en 2017

Identifiers for the 21st century: How to design, provision, and reuse persistent identifiers to maximize utility and impact of life science data

artículo científico publicado en 2017

Integrating biological data--the Distributed Annotation System

artículo científico publicado en 2008

Integration of cardiac proteome biology and medicine by a specialized knowledgebase

artículo científico publicado en 2013

KEGGViewer, a BioJS component to visualize KEGG Pathways.

artículo científico publicado en 2014

Low budget analysis of Direct-To-Consumer genomic testing familial data

artículo científico publicado en 2012

Merging and scoring molecular interactions utilising existing community standards: tools, use-cases and a case study.

artículo científico publicado en 2015

MyDas, an extensible Java DAS server

artículo científico publicado en 2012

OntoDas - a tool for facilitating the construction of complex queries to the Gene Ontology

artículo científico publicado en 2008

PIsCO: A Performance indicators framework for collection of bioinformatics resource metrics

PSICQUIC and PSISCORE: accessing and scoring molecular interactions

artículo científico publicado en 2011

Proteomics data exchange and storage: the need for common standards and public repositories

artículo científico publicado en 2013

PsicquicGraph, a BioJS component to visualize molecular interactions from PSICQUIC servers

artículo científico publicado en 2014

Recommendations for the packaging and containerizing of bioinformatics software

Recommendations for the packaging and containerizing of bioinformatics software

artículo científico publicado en 2018

Sequence, a BioJS component for visualising sequences

artículo científico publicado en 2014

Teaching the fundamentals of biological data integration using classroom games

artículo científico publicado en 2012

Ten simple rules to run a successful BioHackathon

artículo científico publicado en 2020

The GOBLET training portal: a global repository of bioinformatics training materials, courses and trainers

artículo científico publicado en 2014

The IntAct molecular interaction database in 2012

artículo científico publicado en 2012

The MIntAct project--IntAct as a common curation platform for 11 molecular interaction databases

artículo científico publicado en 2014

The Protein Feature Ontology: a tool for the unification of protein feature annotations

artículo científico publicado en 2008

The bio.tools registry of software tools and data resources for the life sciences

article

The future of metabolomics in ELIXIR

artículo científico publicado en 2017

The future of metabolomics in ELIXIR.

artículo científico publicado en 2017

Tools and data services registry: a community effort to document bioinformatics resources

artículo científico publicado en 2016

Top 10 metrics for life science software good practices

artículo científico publicado en 2016

Uniform Resolution of Compact Identifiers for Biomedical Data

preprint

Uniform resolution of compact identifiers for biomedical data.

artículo científico publicado en 2018

easyDAS: automatic creation of DAS servers

artículo científico publicado en 2011

iAnn: an event sharing platform for the life sciences

artículo científico publicado en 2013

myKaryoView: a light-weight client for visualization of genomic data

artículo científico publicado en 2011

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