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Lista de obras de Ana-Nicoleta Bondar

A new group of eubacterial light-driven retinal-binding proton pumps with an unusual cytoplasmic proton donor

artículo científico publicado en 2015

A three-dimensional movie of structural changes in bacteriorhodopsin

artículo científico publicado en 2016

Anomalous behavior of water inside the SecY translocon

artículo científico publicado en 2015

Biophysical mechanism of rhomboid proteolysis: Setting a foundation for therapeutics.

artículo científico publicado en 2016

Bridge: A Graph-Based Algorithm to Analyze Dynamic H-Bond Networks in Membrane Proteins

scientific article published on 11 November 2019

Cationic screening of charged surface groups (carboxylates) affects electron transfer steps in photosystem-II water oxidation and quinone reduction.

artículo científico publicado en 2014

Channelrhodopsins: a bioinformatics perspective.

artículo científico publicado en 2013

Charged groups at binding interfaces of the PsbO subunit of photosystem II: A combined bioinformatics and simulation study

artículo científico publicado en 2017

Coupling of retinal, protein, and water dynamics in squid rhodopsin.

artículo científico publicado en 2010

Cover Image

artículo científico publicado en 2020

Crystallographic and Computational Analysis of the Barrel Part of the PsbO Protein of Photosystem II: Carboxylate-Water Clusters as Putative Proton Transfer Relays and Structural Switches

artículo científico publicado en 2016

Dynamic Carboxylate/Water Networks on the Surface of the PsbO Subunit of Photosystem II.

artículo científico publicado en 2015

Dynamic Water Hydrogen-Bond Networks at the Interface of a Lipid Membrane Containing Palmitoyl-Oleoyl Phosphatidylglycerol

artículo científico publicado en 2018

Dynamic water bridging and proton transfer at a surface carboxylate cluster of photosystem II

scientific article published on 12 November 2019

Dynamics of Long-Distance Hydrogen-Bond Networks in Photosystem II.

artículo científico publicado en 2018

Dynamics of SecY translocons with translocation-defective mutations

artículo científico publicado en 2010

Dynamics of bovine opsin bound to G-protein fragments

artículo científico publicado en 2014

Dynamics of the Plasma Membrane Proton Pump.

artículo científico publicado en 2014

Dynamics of the internal water molecules in squid rhodopsin.

scientific article published on April 2009

Electrostatic interactions and hydrogen bond dynamics in chloride pumping by halorhodopsin

artículo científico publicado en 2014

Excitation energies of a water-bridged twisted retinal structure in the bacteriorhodopsin proton pump: a theoretical investigation

artículo científico publicado en 2013

Exploring cavity dynamics in biomolecular systems.

artículo científico publicado en 2013

Extended protein/water H-bond networks in photosynthetic water oxidation

artículo científico publicado en 2012

Festschrift in the honor of Stephen H. White's 70th Birthday

artículo científico publicado en 2011

Hydrogen bond dynamics in membrane protein function ⬇️

artículo científico publicado el 8 de diciembre de 2011

Introduction: Biomembrane Structure, Dynamics, and Reactions

scientific article published on 01 May 2019

Journal of Membrane Biology: Biophysics

artículo científico publicado en 2016

Key role of active-site water molecules in bacteriorhodopsin proton-transfer reactions

artículo científico publicado en 2008

Key role of electrostatic interactions in bacteriorhodopsin proton transfer

artículo científico publicado en 2004

Kinetics of proton release and uptake by channelrhodopsin-2.

artículo científico publicado en 2012

Lipid Membranes and Reactions at Lipid Interfaces: Theory, Experiments, and Applications

scientific article published on 29 June 2018

Long-distance proton transfer with a break in the bacteriorhodopsin active site.

scientific article published on May 2009

Mechanism by which Untwisting of Retinal Leads to Productive Bacteriorhodopsin Photocycle States

artículo científico publicado en 2014

Mechanism of a molecular valve in the halorhodopsin chloride pump

artículo científico publicado en 2005

Mechanism of conformational coupling in SecA: Key role of hydrogen-bonding networks and water interactions

artículo científico publicado en 2015

Mechanism of primary proton transfer in bacteriorhodopsin

artículo científico publicado en 2004

Mechanisms by Which Lipids Influence Conformational Dynamics of the GlpG Intramembrane Protease

scientific article published on 06 May 2019

Membrane Protein Structure, Function, and Dynamics: a Perspective from Experiments and Theory.

artículo científico publicado en 2015

Molecular details of the unique mechanism of chloride transport by a cyanobacterial rhodopsin.

artículo científico publicado en 2017

Phosphatidylglyerol Lipid Binding at the Active Site of an Intramembrane Protease

artículo científico publicado en 2020

Potential energy function for a photo-switchable lipid molecule

artículo científico publicado en 2020

Proton-Coupled Dynamics in Lactose Permease ⬇️

artículo científico publicado el 20 de septiembre de 2012

Protonation-state-Coupled Conformational Dynamics in Reaction Mechanisms of Channel and Pump Rhodopsins

artículo científico publicado en 2017

Reactions at Biomembrane Interfaces

artículo científico publicado en 2019

Revised force-field parameters for chlorophyll-a, pheophytin-a and plastoquinone-9

artículo científico publicado en 2015

Role of Arg82 in the early steps of the bacteriorhodopsin proton-pumping cycle.

artículo científico publicado en 2011

Ser/Thr motifs in transmembrane proteins: conservation patterns and effects on local protein structure and dynamics

artículo científico publicado en 2012

Structural and energetic determinants of primary proton transfer in bacteriorhodopsin.

artículo científico publicado en 2006

Structural basis of adenylyl cyclase 9 activation

artículo científico publicado en 2022

Suppression of the back proton-transfer from Asp85 to the retinal Schiff base in bacteriorhodopsin: A theoretical analysis of structural elements

artículo científico publicado en 2006

The retinal conformation and its environment in rhodopsin in light of a new 2.2 A crystal structure

artículo científico publicado en 2004

Tuning of Retinal Twisting in Bacteriorhodopsin Controls the Directionality of the Early Photocycle Steps

artículo científico publicado en 2005

Using Graphs of Dynamic Hydrogen-Bond Networks To Dissect Conformational Coupling in a Protein Motor

artículo científico publicado en 2019

Water pathways in the bacteriorhodopsin proton pump

artículo científico publicado en 2010

pH-Dependent Protonation of Surface Carboxylate Groups in PsbO Enables Local Buffering and Triggers Structural Changes

scientific article published on 12 January 2020

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