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Lista de obras de Carsten Wiuf

A Coalescence Approach to Gene Conversion

artículo científico publicado en 2000

A Hidden Markov Model to estimate population mixture and allelic copy-numbers in cancers using Affymetrix SNP arrays

artículo científico publicado en 2007

A Markov Chain Approach to Randomly Grown Graphs

A beta-mixture model for dimensionality reduction, sample classification and analysis

artículo científico publicado en 2011

A bimodular mechanism of calcium control in eukaryotes

artículo científico publicado en 2012

A computational method to preclude multistationarity in networks of interacting species ⬇️

artículo científico publicado el 9 de julio de 2013

A likelihood approach to analysis of network data

artículo científico publicado en 2006

A periodic pattern of SNPs in the human genome

artículo científico publicado en 2007

Ab initio identification of human microRNAs based on structure motifs

artículo científico publicado en 2007

An Algebraic Approach to Signaling Cascades with n Layers ⬇️

artículo científico publicado el 27 de abril de 2011

An Algebro-topological description of protein domain structure

artículo científico publicado en 2011

Are microRNAs located in genomic regions associated with cancer?

artículo científico publicado en 2006

Assessing the fidelity of ancient DNA sequences amplified from nuclear genes

artículo científico publicado en 2006

Binomial subsampling

artículo científico publicado en 2006

Bioinformatic identification of FGF, p38-MAPK, and calcium signalling pathways associated with carcinoma in situ in the urinary bladder

artículo científico publicado en 2008

Cellular compartments cause multistability and allow cells to process more information

artículo científico publicado en 2013

Challenges in microbial ecology: building predictive understanding of community function and dynamics ⬇️

artículo científico

Chromosomal imbalance in the progression of high-risk non-muscle invasive bladder cancer

artículo científico publicado en 2009

Clonal evolution in t(14;18)-positive follicular lymphoma, evidence for multiple common pathways, and frequent parallel clonal evolution

artículo científico publicado en 2008

Co-clustering and visualization of gene expression data and gene ontology terms for Saccharomyces cerevisiae using self-organizing maps

artículo científico publicado en 2006

Common variants at VRK2 and TCF4 conferring risk of schizophrenia

artículo científico publicado en 2011

Comprehensive Genome Methylation Analysis in Bladder Cancer: Identification and Validation of Novel Methylated Genes and Application of These as Urinary Tumor Markers

article

Conditional Genealogies and the Age of a Neutral Mutant

artículo científico publicado en 1999

Conflicting results in SNP genotype assessment

artículo científico publicado en 2007

Conservation Laws in Biochemical Reaction Networks

Consistency of estimators of population scaled parameters using composite likelihood

artículo científico publicado en 2006

Convergence properties of the degree distribution of some growing network models

artículo científico publicado en 2006

Core signalling motif displaying multistability through multi-state enzymes

artículo científico publicado en 2016

Crosslinks rather than strand breaks determine access to ancient DNA sequences from frozen sediments

article

DNA copy number aberrations in breast cancer by array comparative genomic hybridization

artículo científico publicado en 2009

Development of a hypoxia gene expression classifier with predictive impact for hypoxic modification of radiotherapy in head and neck cancer

artículo científico publicado en 2011

Diagnostic and prognostic microRNAs in stage II colon cancer.

artículo científico publicado en 2008

Diverse plant and animal genetic records from Holocene and Pleistocene sediments

artículo científico publicado en 2003

Elimination of intermediate species in multiscale stochastic reaction networks

Enzyme-sharing as a cause of multi-stationarity in signalling systems ⬇️

artículo científico publicado el 2 de noviembre de 2011

Estimating the size of the human interactome

artículo científico publicado en 2008

Estimation of tumor heterogeneity using CGH array data

artículo científico publicado en 2009

Evaluating Neanderthal Genetics and Phylogeny

artículo científico publicado en 2006

Evolution at the system level: the natural history of protein interaction networks

artículo científico publicado en 2007

Exact analysis of intrinsic qualitative features of phosphorelays using mathematical models ⬇️

artículo científico publicado el 13 de enero de 2012

Finding the positive feedback loops underlying multi-stationarity

artículo científico publicado en 2015

Frequent occurrence of uniparental disomy in colorectal cancer

artículo científico publicado en 2006

From evidence to inference: probing the evolution of protein interaction networks

artículo científico publicado en 2009

Gene expression classifier predicts for hypoxic modification of radiotherapy with nimorazole in squamous cell carcinomas of the head and neck

artículo científico publicado en 2012

General theory for stochastic admixture graphs and F-statistics

artículo científico publicado en 2018

Genome-wide analysis of allelic imbalance in prostate cancer using the Affymetrix 50K SNP mapping array

artículo científico publicado en 2007

Genome-wide scans using archived neonatal dried blood spot samples.

artículo científico publicado en 2009

Genome-wide study of association and interaction with maternal cytomegalovirus infection suggests new schizophrenia loci

artículo científico publicado en 2013

Genotyping and annotation of Affymetrix SNP arrays

artículo científico publicado en 2006

Germline mutation in RNASEL predicts increased risk of head and neck, uterine cervix and breast cancer

artículo científico publicado en 2008

Graphical criteria for positive solutions to linear systems

Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species.

artículo científico publicado en 2016

High-Resolution Melting Analysis for Mutation Screening of RGSL1, RGS16, and RGS8 in Breast Cancer

article

Identification of endogenous retroviral reading frames in the human genome

artículo científico publicado en 2004

Identifying parameter regions for multistationarity

artículo científico publicado en 2017

Importance sampling for the infinite sites model

artículo científico publicado en 2008

Incomplete and noisy network data as a percolation process

artículo científico publicado en 2010

Increased cell motility and invasion upon knockdown of lipolysis stimulated lipoprotein receptor (LSR) in SW780 bladder cancer cells

artículo científico publicado en 2008

Inference on recombination and block structure using unphased data

artículo científico publicado en 2004

Inferring population history from genealogical trees ⬇️

artículo científico publicado el 1 de marzo de 2003

Intermediates and Generic Convergence to Equilibria

artículo científico publicado en 2017

Intermediates, catalysts, persistence, and boundary steady states

artículo científico publicado en 2016

LandScape: a simple method to aggregate p-values and other stochastic variables without a priori grouping

artículo científico publicado en 2016

Large scale identification and categorization of protein sequences using structured logistic regression

artículo científico publicado en 2014

Long-term persistence of bacterial DNA.

artículo científico publicado en 2004

Lyapunov Functions, Stationary Distributions, and Non-equilibrium Potential for Reaction Networks

artículo científico publicado en 2015

Model criticism based on likelihood-free inference, with an application to protein network evolution

scholarly article

Modelling the contribution of family history and variation in single nucleotide polymorphisms to risk of schizophrenia: a Danish national birth cohort-based study

artículo científico publicado en 2011

Monitoring endangered freshwater biodiversity using environmental DNA.

artículo científico publicado en 2011

Node balanced steady states: Unifying and generalizing complex and detailed balanced steady states

artículo científico publicado en 2018

Omics-based profiling of carcinoma of the breast and matched regional lymph node metastasis

article

On the Liouville integrability of Edelstein’s reaction system inR3

On the genealogy of a sample of neutral rare alleles

artículo científico publicado en 2000

On the minimum number of topologies explaining a sample of DNA sequences

artículo científico publicado en 2002

Phosphorelay of non-orthodox two component systems functions through a bi-molecular mechanism in vivo: the case of ArcB.

artículo científico publicado en 2015

Phosphorelays provide tunable signal processing capabilities for the cell

artículo científico publicado en 2013

Power-Law Kinetics and Determinant Criteria for the Preclusion of Multistationarity in Networks of Interacting Species

Powerful Inference with the D-Statistic on Low-Coverage Whole-Genome Data

artículo científico publicado en 2017

Product-Form Poisson-Like Distributions and Complex Balanced Reaction Systems

Quality assessment of DNA derived from up to 30 years old formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue for PCR-based methylation analysis using SMART-MSP and MS-HRM

artículo científico publicado en 2009

Rare Alleles and Selection

artículo científico publicado en 2001

Recharacterization of ancient DNA miscoding lesions: insights in the era of sequencing-by-synthesis

artículo científico publicado en 2007

Recombination as a point process along sequences

artículo científico publicado en 1999

Reply to Robert et al.: Model criticism informs model choice and model comparison

article published in the Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Role of activating fibroblast growth factor receptor 3 mutations in the development of bladder tumors

artículo científico publicado en 2005

Rseg--an R package to optimize segmentation of SNP array data

artículo científico publicado en 2010

SNPTools: a software tool for visualization and analysis of microarray data

artículo científico publicado en 2007

SOX4 expression in bladder carcinoma: clinical aspects and in vitro functional characterization

artículo científico

Sampling properties of random graphs: the degree distribution

artículo científico publicado en 2005

Short tandem repeats and genetic variation

artículo científico publicado en 2010

Short tandem repeats in human exons: a target for disease mutations

artículo científico publicado en 2008

Signaling cascades: consequences of varying substrate and phosphatase levels

artículo científico publicado en 2012

Simplifying biochemical models with intermediate species

artículo científico publicado en 2013

Simulating haplotype blocks in the human genome

artículo científico publicado en 2003

Some notes on the combinatorial properties of haplotype tagging.

artículo científico publicado en 2003

Statistical alignment: computational properties, homology testing and goodness-of-fit

artículo científico publicado en 2000

Subnets of scale-free networks are not scale-free: sampling properties of networks

artículo científico publicado en 2005

Temporal development and collapse of an Arctic plant-pollinator network

artículo científico publicado en 2009

The association between genetic variants in hMLH1 and hMSH2 and the development of sporadic colorectal cancer in the Danish population

artículo científico publicado en 2008

The effects of incomplete protein interaction data on structural and evolutionary inferences

artículo científico publicado en 2006

The genealogy, site frequency spectrum and ages of two nested mutant alleles

artículo científico publicado en 2009

The probability and chromosomal extent of trans-specific polymorphism

artículo científico publicado en 2004

Tumor heterogeneity in neoplasms of breast, colon, and skin

artículo científico publicado en 2010

Tumor-specific usage of alternative transcription start sites in colorectal cancer identified by genome-wide exon array analysis

artículo científico publicado en 2011

Two Variance Results in Population Genetics Theory

article

Uniform Approximation of Solutions by Elimination of Intermediate Species in Deterministic Reaction Networks

Using likelihood-free inference to compare evolutionary dynamics of the protein networks of H. pylori and P. falciparum

artículo científico publicado en 2007

Variable Elimination in Chemical Reaction Networks with Mass-Action Kinetics

Variable elimination in post-translational modification reaction networks with mass-action kinetics ⬇️

artículo científico publicado el 5 de febrero de 2012

epiG: statistical inference and profiling of DNA methylation from whole-genome bisulfite sequencing data

artículo científico publicado en 2017

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