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Lista de obras de Marian Walhout

A C. elegans genome-scale microRNA network contains composite feedback motifs with high flux capacity.

artículo científico publicado en 2008

A Caenorhabditis elegans Genome-Scale Metabolic Network Model

artículo científico publicado en 2016

A Delicate Balance between Bacterial Iron and Reactive Oxygen Species Supports Optimal C. elegans Development

artículo científico publicado en 2019

A Persistence Detector for Metabolic Network Rewiring in an Animal

A compendium of Caenorhabditis elegans RNA binding proteins predicts extensive regulation at multiple levels

artículo científico publicado en 2013

A compendium of Caenorhabditis elegans regulatory transcription factors: a resource for mapping transcription regulatory networks

artículo científico publicado en 2005

A first version of the Caenorhabditis elegans Promoterome

artículo científico publicado en 2004

A gateway-compatible yeast one-hybrid system.

artículo científico publicado en 2004

A gene-centered C. elegans protein-DNA interaction network

artículo científico publicado en 2006

A model of elegance

artículo científico publicado en 1998

A multiparameter network reveals extensive divergence between C. elegans bHLH transcription factors

artículo científico publicado en 2009

A regulatory cascade of three transcription factors in a single specific neuron, DVC, in Caenorhabditis elegans.

artículo científico publicado en 2011

A stele-enriched gene regulatory network in the Arabidopsis root

artículo científico publicado en 2011

Bacterial Metabolism Affects the C. elegans Response to Cancer Chemotherapeutics.

artículo científico publicado en 2017

C. elegans 14-3-3 proteins regulate life span and interact with SIR-2.1 and DAF-16/FOXO.

artículo científico publicado en 2006

C. elegans methionine/S-adenosylmethionine cycle activity is sensed and adjusted by a nuclear hormone receptor

artículo científico publicado en 2020

Caenorhabditis elegans metabolic gene regulatory networks govern the cellular economy

artículo científico publicado en 2014

Chromatin immunoprecipitation (ChIP) coupled to detection by quantitative real-time PCR to study transcription factor binding to DNA in Caenorhabditis elegans.

artículo científico publicado en 2008

Chromosome-biased binding and gene regulation by the Caenorhabditis elegans DRM complex

artículo científico publicado en 2011

Colony Lift Colorimetric Assay for β-Galactosidase Activity

artículo científico publicado en 2016

Complex expression dynamics and robustness in C. elegans insulin networks

artículo científico publicado en 2013

Determination and inference of eukaryotic transcription factor sequence specificity

artículo científico publicado en 2014

Diet-induced developmental acceleration independent of TOR and insulin in C. elegans

artículo científico publicado en 2013

EDGEdb: a transcription factor-DNA interaction database for the analysis of C. elegans differential gene expression.

artículo científico publicado en 2007

Enhanced Y1H assays for Arabidopsis.

scientific article published on 30 October 2011

Enhanced yeast one-hybrid assays for high-throughput gene-centered regulatory network mapping.

artículo científico publicado en 2011

Erratum: Evidence for dynamically organized modularity in the yeast protein–protein interaction network

artículo científico publicado en 2004

Evolved bacterial resistance against fluoropyrimidines can lower chemotherapy impact in the Caenorhabditis elegans host

artículo científico publicado en 2020

Functional conservation of a developmental switch in mammals since the Jurassic age

article

Functional modularity of nuclear hormone receptors in a Caenorhabditis elegans metabolic gene regulatory network

artículo científico publicado en 2010

Gateway Recombinational Cloning

artículo científico publicado en 2018

Gateway-Compatible Yeast One-Hybrid and Two-Hybrid Assays

artículo científico publicado en 2018

Gateway-compatible yeast one-hybrid screens

artículo científico publicado en 2006

Gene regulatory networks and the role of robustness and stochasticity in the control of gene expression

artículo científico publicado en 2011

Gene-Centered Yeast One-Hybrid Assays

artículo científico publicado en 2016

Gene-centered regulatory network mapping

artículo científico publicado en 2011

Gene-centered regulatory networks.

artículo científico publicado en 2009

Gene-centered yeast one-hybrid assays.

artículo científico publicado en 2012

Generating Bait Strains for Yeast One-Hybrid Assays

artículo científico publicado en 2016

Generating Yeast One-Hybrid DNA-Bait Strains

artículo científico publicado en 2018

Generating Yeast Two-Hybrid Bait Strains

artículo científico publicado en 2018

Generating an Open Reading Frame (ORF) Entry Clone and Destination Clone

artículo científico publicado en 2018

Genetic adaptation to diet preserves longevity

scientific article published on February 2014

Genome-scale spatiotemporal analysis of Caenorhabditis elegans microRNA promoter activity

artículo científico publicado en 2008

Genomics in 2011: challenges and opportunities

artículo científico publicado en 2011

Getting an edge on human disease

artículo científico publicado en 2009

High-Efficiency Yeast Transformation

artículo científico publicado en 2018

Human gene-centered transcription factor networks for enhancers and disease variants

artículo científico publicado en 2015

Identification of critical domains and putative partners for the Caenorhabditis elegans spindle component LIN-5.

artículo científico publicado en 2004

Identifying Interactors from an Activation Domain Prey Library

artículo científico publicado en 2018

If two deletions don't stop growth, try three

artículo científico publicado en 2018

Insight into transcription factor gene duplication from Caenorhabditis elegans Promoterome-driven expression patterns.

artículo científico publicado en 2007

Integrated version of reverse two-hybrid system for the postproteomic era

scientific article published on 01 January 2002

Integrating 'omic' information: a bridge between genomics and systems biology

artículo científico publicado en 2003

Integrating interactome, phenome, and transcriptome mapping data for the C. elegans germline

artículo científico publicado en 2002

Integration of metabolic and gene regulatory networks modulates the C. elegans dietary response

artículo científico publicado en 2013

Interspecies Systems Biology Uncovers Metabolites Affecting C. elegans Gene Expression and Life History Traits

artículo científico publicado en 2014

Interspecies systems biology uncovers metabolites affecting C. elegans gene expression and life history traits

artículo científico publicado en 2014

MEX-3 interacting proteins link cell polarity to asymmetric gene expression in Caenorhabditis elegans

artículo científico publicado en 2002

Many transcription factors contribute to C. elegans growth and fat storage

artículo científico

Mapping and analysis of Caenorhabditis elegans transcription factor sequence specificities.

artículo científico publicado en 2015

Marian Walhout: transcriptional mapmaker. Interviewed by Ben Short

artículo científico publicado en 2009

Matrix and Steiner-triple-system smart pooling assays for high-performance transcription regulatory network mapping

artículo científico publicado en 2007

Modeling tissue-relevant Caenorhabditis elegans metabolism at network, pathway, reaction, and metabolite levels

artículo científico publicado en 2020

Multiple transcription factors directly regulate Hox gene lin-39 expression in ventral hypodermal cells of the C. elegans embryo and larva, including the hypodermal fate regulators LIN-26 and ELT-6.

artículo científico publicado en 2014

Networking at the second Interactome Meeting

artículo científico publicado en 2006

PRIMA: a gene-centered, RNA-to-protein method for mapping RNA-protein interactions

artículo científico publicado en 2017

Performing Yeast One-Hybrid Library Screens

artículo científico publicado en 2016

Propagating Gateway Vectors

artículo científico publicado en 2018

Protein interaction maps for model organisms

artículo científico publicado en 2001

RNA Interference in Caenorhabditis elegans.

artículo científico publicado en 2015

The C. elegans Snail homolog CES-1 can activate gene expression in vivo and share targets with bHLH transcription factors

artículo científico publicado en 2009

The FLYWCH transcription factors FLH-1, FLH-2, and FLH-3 repress embryonic expression of microRNA genes in C. elegans

artículo científico publicado en 2008

The Oxidative Stress Response Requires the NHR-49 Transcription Factor

article

The Oxidative Stress Response in Caenorhabditis elegans Requires the GATA Transcription Factor ELT-3 and SKN-1/Nrf2.

artículo científico publicado en 2017

The interplay between transcription factors and microRNAs in genome-scale regulatory networks

artículo científico publicado en 2009

Transcription factor binding to Caenorhabditis elegans first introns reveals lack of redundancy with gene promoters.

artículo científico publicado en 2013

Transcription factor functionality and transcription regulatory networks

artículo científico publicado en 2008

Transcription factor modularity in a gene-centered C. elegans core neuronal protein-DNA interaction network

artículo científico publicado en 2007

Understanding Metabolic Regulation at a Systems Level: Metabolite Sensing, Mathematical Predictions, and Model Organisms.

artículo científico publicado en 2015

Unraveling transcription regulatory networks by protein-DNA and protein-protein interaction mapping.

artículo científico publicado en 2006

Using Multisite LR Cloning to Generate a Destination Clone

artículo científico publicado en 2018

Using a structural and logics systems approach to infer bHLH-DNA binding specificity determinants

artículo científico publicado en 2011

Using networks to measure similarity between genes: association index selection

artículo científico publicado en 2013

What does biologically meaningful mean? A perspective on gene regulatory network validation

artículo científico publicado en 2011

Widespread macromolecular interaction perturbations in human genetic disorders

scientific journal article

WormCat: An Online Tool for Annotation and Visualization of Caenorhabditis elegans Genome-Scale Data

artículo científico publicado en 2019

WormPaths: <i>Caenorhabditis elegans</i> metabolic pathway annotation and visualization

artículo científico publicado en 2020

Worms, bacteria, and micronutrients: an elegant model of our diet

artículo científico publicado en 2014

Yeast one-hybrid assays for gene-centered human gene regulatory network mapping.

artículo científico publicado en 2011

Zymolyase-Treatment and Polymerase Chain Reaction Amplification from Genomic and Plasmid Templates from Yeast

artículo científico publicado en 2016

lin-8, which antagonizes Caenorhabditis elegans Ras-mediated vulval induction, encodes a novel nuclear protein that interacts with the LIN-35 Rb protein

artículo científico publicado en 2005