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Lista de obras de René P Zahedi

"Watching the Detectives" report of the general assembly of the EU project DETECTIVE Brussels, 24-25 November 2015.

artículo científico publicado en 2016

A Unique Morphological Phenotype in Chemoresistant Triple-Negative Breast Cancer Reveals Metabolic Reprogramming and PLIN4 Expression as a Molecular Vulnerability

scientific article published on 19 September 2019

A complex standard for protein identification, designed by evolution.

artículo científico publicado en 2012

Alterations of the platelet proteome in type I Glanzmann thrombasthenia caused by different homozygous delG frameshift mutations in ITGA2B.

artículo científico publicado en 2017

Amyloid-β peptide induces mitochondrial dysfunction by inhibition of preprotein maturation.

artículo científico publicado en 2014

An alternative NFAT-activation pathway mediated by IL-7 is critical for early thymocyte development.

artículo científico publicado en 2012

An improved workflow for quantitative N-terminal charge-based fractional diagonal chromatography (ChaFRADIC) to study proteolytic events in Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 2015

Analysis of Post-translational Modifications

Analysis of the membrane proteome of canine pancreatic rough microsomes identifies a novel Hsp40, termed ERj7.

artículo científico publicado en 2009

Assembly of nuclear pore complexes mediated by major vault protein.

artículo científico publicado en 2009

Bottom-up proteomics suggests an association between differential expression of mitochondrial proteins and chronic fatigue syndrome

artículo científico publicado en 2016

Catch me if you can: mass spectrometry-based phosphoproteomics and quantification strategies.

artículo científico publicado en 2011

Cellular Signature of SIL1 Depletion: Disease Pathogenesis due to Alterations in Protein Composition Beyond the ER Machinery

artículo científico publicado en 2015

Combined Quantification of the Global Proteome, Phosphoproteome, and Proteolytic Cleavage to Characterize Altered Platelet Functions in the Human Scott Syndrome.

artículo científico publicado en 2016

Comparative proteomic analysis of biofilm and planktonic cells of Neisseria meningitidis.

artículo científico publicado en 2010

Comprehensive mutational analysis reveals p6Gag phosphorylation to be dispensable for HIV-1 morphogenesis and replication

artículo científico publicado en 2012

Current strategies and findings in clinically relevant post-translational modification-specific proteomics

artículo científico publicado en 2015

Cytomegalovirus downregulates IRE1 to repress the unfolded protein response

artículo científico publicado en 2013

D-score: a search engine independent MD-score.

artículo científico publicado en 2013

Detecting post-translational modification signatures as potential biomarkers in clinical mass spectrometry

artículo científico publicado en 2018

Drugging the catalytically inactive state of RET kinase in RET-rearranged tumors.

artículo científico publicado en 2017

Dual function of Sdh3 in the respiratory chain and TIM22 protein translocase of the mitochondrial inner membrane

artículo científico publicado en 2011

Effective assignment of α2,3/α2,6 sialic acid isomers in LC-MS/MS based glycoproteomics.

artículo científico publicado en 2018

EnhancedN-Glycosylation Site Analysis of Sialoglycopeptides by Strong Cation Exchange Prefractionation Applied to Platelet Plasma Membranes

article

Enrichment of Cross-Linked Peptides Using Charge-Based Fractional Diagonal Chromatography (ChaFRADIC).

artículo científico publicado en 2017

Fast, Efficient, and Quality-Controlled Phosphopeptide Enrichment from Minute Sample Amounts Using Titanium Dioxide

artículo científico publicado en 2014

Global analysis of the mitochondrial N-proteome identifies a processing peptidase critical for protein stability

artículo científico publicado en 2009

High spatial and temporal resolution cell manipulation techniques in microchannels

artículo científico publicado en 2016

Highly sensitive phosphoproteomics by tailoring solid-phase extraction to electrostatic repulsion-hydrophilic interaction chromatography

artículo científico publicado en 2015

Homologous desensitization of guanylyl cyclase A, the receptor for atrial natriuretic peptide, is associated with a complex phosphorylation pattern

artículo científico publicado en 2010

How iMALDI can improve clinical diagnostics

artículo científico publicado en 2018

Hypoxia-induced p38 MAPK activation reduces Mcl-1 expression and facilitates sensitivity towards BH3 mimetics in chronic lymphocytic leukemia

artículo científico publicado en 2014

INPP5K and SIL1 associated pathologies with overlapping clinical phenotypes converge through dysregulation of PHGDH

artículo científico publicado en 2021

Identification of cleavage sites and substrate proteins for two mitochondrial intermediate peptidases in Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 2015

Impact of digestion conditions on phosphoproteomics.

artículo científico publicado en 2014

Inhibition of osimertinib-resistant epidermal growth factor receptor EGFR-T790M/C797S

scientific article published on 04 October 2019

Insight into the Inhibition of Drug-Resistant Mutants of the Receptor Tyrosine Kinase EGFR

artículo científico publicado en 2016

Integral Quantification Accuracy Estimation for Reporter Ion-based Quantitative Proteomics (iQuARI)

artículo científico publicado en 2012

Integration of polycarbonate membranes in microfluidic free-flow electrophoresis

artículo científico publicado en 2017

Intermembrane space proteome of yeast mitochondria

artículo científico publicado en 2012

Joining forces: studying multiple post-translational modifications to understand dynamic disease mechanisms

artículo científico publicado en 2016

Landscape of submitochondrial protein distribution.

artículo científico publicado en 2017

Mass spectrometry-based protein analysis to unravel the tissue pathophysiology in Duchenne muscular dystrophy

artículo científico publicado en 2017

Multi-OMICS: a critical technical perspective on integrative lipidomics approaches.

artículo científico publicado en 2017

Multidimensional electrostatic repulsion-hydrophilic interaction chromatography (ERLIC) for quantitative analysis of the proteome and phosphoproteome in clinical and biomedical research

artículo científico publicado en 2015

Mutations in INPP5K, Encoding a Phosphoinositide 5-Phosphatase, Cause Congenital Muscular Dystrophy with Cataracts and Mild Cognitive Impairment

artículo científico publicado en 2017

Myopathy in Marinesco-Sjögren syndrome links endoplasmic reticulum chaperone dysfunction to nuclear envelope pathology

artículo científico publicado en 2013

Novel highly sensitive, specific, and straightforward strategy for comprehensive N-terminal proteomics reveals unknown substrates of the mitochondrial peptidase Icp55.

artículo científico publicado en 2013

Nuclear envelopes from amphibian oocytes--from morphology to protein inventory

artículo científico publicado en 2005

PARL mediates Smac proteolytic maturation in mitochondria to promote apoptosis

artículo científico publicado en 2017

PKA-RII subunit phosphorylation precedes activation by cAMP and regulates activity termination.

artículo científico publicado en 2018

Peptide identification quality control

scientific article published on 18 April 2011

PeptideShaker enables reanalysis of MS-derived proteomics data sets.

artículo científico publicado en 2015

Phosphoproteome analysis of the platelet plasma membrane

artículo científico publicado en 2011

Phosphoproteome of resting human platelets

artículo científico publicado en 2007

Phosphoproteomics Profiling of Tobacco Mature Pollen and Pollen Activated in vitro

artículo científico publicado en 2016

Phosphoproteomics of human platelets: A quest for novel activation pathways

artículo científico publicado en 2006

Phosphoproteomics--more than meets the eye.

artículo científico publicado en 2013

Phosphorylation of CalDAG-GEFI by protein kinase A prevents Rap1b activation.

artículo científico publicado en 2013

Platelet membrane proteomics: a novel repository for functional research

artículo científico

Positive regulation of A-RAF by phosphorylation of isoform-specific hinge segment and identification of novel phosphorylation sites

artículo científico publicado en 2008

Profiling phosphoproteins of yeast mitochondria reveals a role of phosphorylation in assembly of the ATP synthase

artículo científico publicado en 2007

Protease Specificity Profiling in a Pipet Tip Using "Charge-Synchronized" Proteome-Derived Peptide Libraries.

artículo científico publicado en 2018

Protein carbamylation: In vivo modification or in vitro artefact?

artículo científico publicado en 2013

Protein lipid modifications--More than just a greasy ballast

artículo científico

Proteome Profiling and Ultrastructural Characterization of the Human RCMH Cell Line: Myoblastic Properties and Suitability for Myopathological Studies

artículo científico publicado en 2016

Proteomic analysis of the yeast mitochondrial outer membrane reveals accumulation of a subclass of preproteins

artículo científico publicado en 2006

Proteomic and metabolomic analyses of mitochondrial complex I-deficient mouse model generated by spontaneous B2 short interspersed nuclear element (SINE) insertion into NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 4 (Ndufs4) gene

scientific journal article

Proteomics - moving from inventory to personalized medicine?

artículo científico publicado en 2014

Quantifying Missing (Phospho)Proteome Regions with the Broad-Specificity Protease Subtilisin.

artículo científico publicado en 2017

Quantitative Profiling for Substrates of the Mitochondrial Presequence Processing Protease Reveals a Set of Nonsubstrate Proteins Increased upon Proteotoxic Stress.

artículo científico publicado en 2015

Raf kinases mediate the phosphorylation of eukaryotic translation elongation factor 1A and regulate its stability in eukaryotic cells.

artículo científico publicado en 2012

Recent advances in yeast organelle and membrane proteomics

artículo científico publicado en 2009

Regulation of mitochondrial protein import by cytosolic kinases.

artículo científico publicado en 2011

Response: platelet transcriptome and proteome--relation rather than correlation.

artículo científico publicado en 2013

Revealing phosphoproteins playing role in tobacco pollen activated in vitro

Robust Workflow for iTRAQ-Based Peptide and Protein Quantification

Shedding light on black boxes in protein identification

artículo científico publicado en 2014

Simultaneous Metabolite, Protein, Lipid Extraction (SIMPLEX): A Combinatorial Multimolecular Omics Approach for Systems Biology

artículo científico publicado en 2016

Systematic and quantitative comparison of digest efficiency and specificity reveals the impact of trypsin quality on MS-based proteomics

artículo científico publicado en 2011

Taking the stock of granule cargo: Platelet releasate proteomics

artículo científico publicado en 2016

Targeting Drug Resistance in EGFR with Covalent Inhibitors: A Structure-Based Design Approach

artículo científico publicado en 2015

Temporal quantitative phosphoproteomics of ADP stimulation reveals novel central nodes in platelet activation and inhibition

artículo científico publicado en 2016

The Caveolin-3 G56S sequence variant of unknown significance: Muscle biopsy findings and functional cell biological analysis

artículo científico publicado en 2016

The FERM protein EPB41L5 regulates actomyosin contractility and focal adhesion formation to maintain the kidney filtration barrier

artículo científico publicado en 2017

The Human Platelet Membrane Proteome Reveals Several New Potential Membrane Proteins

artículo científico publicado en 2005

The first comprehensive and quantitative analysis of human platelet protein composition allows the comparative analysis of structural and functional pathways

artículo científico publicado en 2012

The good, the bad, the ugly: validating the mass spectrometric analysis of modified peptides

artículo científico publicado en 2011

The mTOR and PP2A Pathways Regulate PHD2 Phosphorylation to Fine-Tune HIF1α Levels and Colorectal Cancer Cell Survival under Hypoxia.

artículo científico publicado en 2017

The next level of complexity: crosstalk of posttranslational modifications.

artículo científico publicado en 2014

The protein import machinery of mitochondria-a regulatory hub in metabolism, stress, and disease

artículo científico publicado en 2014

The proteome of Saccharomyces cerevisiae mitochondria

artículo científico publicado en 2003

The proteome of baker's yeast mitochondria.

artículo científico publicado en 2016

Time-resolved characterization of cAMP/PKA-dependent signaling reveals that platelet inhibition is a concerted process involving multiple signaling pathways.

artículo científico publicado en 2013

Toward the complete yeast mitochondrial proteome: multidimensional separation techniques for mitochondrial proteomics

artículo científico publicado en 2006

Tracking Effects of SIL1 Increase: Taking a Closer Look Beyond the Consequences of Elevated Expression Level

artículo científico publicado en 2017

Two Birds with One Stone: Parallel Quantification of Proteome and Phosphoproteome Using iTRAQ.

artículo científico publicado en 2016

Two-dimensional benzyldimethyl-n-hexadecylammonium chloride/SDS-PAGE for membrane proteomics.

artículo científico publicado en 2005

Tyr728 in the kinase domain of the murine kinase suppressor of RAS 1 regulates binding and activation of the mitogen-activated protein kinase kinase

artículo científico publicado en 2013

Unraveling the Phosphocholination Mechanism of the Legionella pneumophila Enzyme AnkX.

artículo científico publicado en 2016

Variable Digestion Strategies for Phosphoproteomics Analysis.

artículo científico publicado en 2016

What can proteomics tell us about platelets?

artículo científico

Why phosphoproteomics is still a challenge

artículo científico publicado en 2015

iTRAQ data interpretation.

artículo científico publicado en 2012

iTRAQ protein quantification: A quality-controlled workflow

scientific article published on 16 February 2011

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