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Lista de obras de Vincent Gardeux

'N-of-1-pathways' unveils personal deregulated mechanisms from a single pair of RNA-Seq samples: towards precision medicine

artículo científico publicado en 2014

A genome-by-environment interaction classifier for precision medicine: personal transcriptome response to rhinovirus identifies children prone to asthma exacerbations

artículo científico publicado en 2017

A leukemia-protective germline variant mediates chromatin module formation via transcription factor nucleation

artículo científico publicado en 2022

A parallelized, automated platform enabling individual or sequential ChIP of histone marks and transcription factors

artículo científico publicado en 2020

ARTS: automated randomization of multiple traits for study design

artículo científico publicado en 2014

ASAP: a Web-based platform for the analysis and interactive visualization of single-cell RNA-seq data

artículo científico publicado en 2017

Are we able to predict survival in ER-positive HER2-negative breast cancer? A comparison of web-based models

artículo científico publicado en 2015

BRB-seq: ultra-affordable high-throughput transcriptomics enabled by bulk RNA barcoding and sequencing

artículo científico publicado en 2019

COPD Hospitalization Risk Increased with Distinct Patterns of Multiple Systems Comorbidities Unveiled by Network Modeling

artículo científico publicado en 2014

Computing molecular signatures as optima of a bi-objective function: method and application to prediction in oncogenomics.

artículo científico publicado en 2015

Concordance of deregulated mechanisms unveiled in underpowered experiments: PTBP1 knockdown case study

artículo científico publicado en 2014

Disparate temperature-dependent virus – host dynamics for SARS-CoV-2 and SARS-CoV in the human respiratory epithelium

artículo científico publicado en 2020

Disparate temperature-dependent virus-host dynamics for SARS-CoV-2 and SARS-CoV in the human respiratory epithelium

artículo científico publicado en 2021

Dissecting the brown adipogenic regulatory network using integrative genomics

artículo científico publicado en 2017

Dynamic changes of RNA-sequencing expression for precision medicine: N-of-1-pathways Mahalanobis distance within pathways of single subjects predicts breast cancer survival

artículo científico publicado en 2015

Dynamic regulation of chromatin accessibility by pluripotency transcription factors across the cell cycle

artículo científico publicado en 2019

Fly Cell Atlas: A single-nucleus transcriptomic atlas of the adult fruit fly

artículo científico publicado en 2022

In Silico cancer cell versus stroma cellularity index computed from species-specific human and mouse transcriptome of xenograft models: towards accurate stroma targeting therapy assessment.

artículo científico publicado en 2014

Integrative genomics analyses unveil downstream biological effectors of disease-specific polymorphisms buried in intergenic regions

artículo científico publicado en 2016

N-of-1-pathways MixEnrich: advancing precision medicine via single-subject analysis in discovering dynamic changes of transcriptomes

artículo científico publicado en 2017

Profiling of Single-Cell Transcriptomes

artículo científico publicado en 2017

Sex-dependent and sex-independent regulatory systems of size variation in natural populations

scientific article published on 01 November 2019

The Genetics of Transcription Factor DNA Binding Variation

artículo científico publicado en 2016

The discriminatory cost of ICD-10-CM transition between clinical specialties: metrics, case study, and mitigating tools

artículo científico publicado en 2013

Towards a PBMC "virogram assay" for precision medicine: Concordance between ex vivo and in vivo viral infection transcriptomes

artículo científico publicado en 2015

eQTL networks unveil enriched mRNA master integrators downstream of complex disease-associated SNPs.

artículo científico publicado en 2015

kMEn: Analyzing noisy and bidirectional transcriptional pathway responses in single subjects

artículo científico publicado en 2016

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