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Lista de obras de Mario A. Fares

A Sliding Window-Based Method to Detect Selective Constraints in Protein-Coding Genes and Its Application to RNA Viruses

article

A Study of the Coevolutionary Patterns Operating within the env Gene of the HIV-1 Group M Subtypes

article

A novel method for detecting intramolecular coevolution: adding a further dimension to selective constraints analyses.

artículo científico publicado en 2006

A revised evolutionary history of hepatitis B virus (HBV).

artículo científico publicado en 2002

Adaptive covariation between the coat and movement proteins of prunus necrotic ringspot virus

artículo científico publicado en 2006

Adaptive evolution in GroEL from distantly related endosymbiotic bacteria of insects.

artículo científico publicado en 2005

Artifactual phylogenies caused by correlated distribution of substitution rates among sites and lineages: the good, the bad, and the ugly.

artículo científico publicado en 2007

CAPS: coevolution analysis using protein sequences.

artículo científico publicado en 2006

Chance and necessity in the genome evolution of endosymbiotic bacteria of insects

artículo científico publicado en 2017

Chaperonin 60: a paradoxical, evolutionarily conserved protein family with multiple moonlighting functions.

artículo científico publicado en 2013

ChloroMitoSSRDB: open source repository of perfect and imperfect repeats in organelle genomes for evolutionary genomics

artículo científico publicado en 2013

Coevolution analyses illuminate the dependencies between amino acid sites in the chaperonin system GroES-L.

artículo científico publicado en 2013

Comparative genomic analysis of a mammalian β-defensin gene cluster

article

Computational biology methods and their application to the comparative genomics of endocellular symbiotic bacteria of insects.

artículo científico publicado en 2009

Describing the structural robustness landscape of bacterial small RNAs.

artículo científico publicado en 2012

Endosymbiotic bacteria: groEL buffers against deleterious mutations

artículo científico publicado en 2002

Evidence of positively selected sites in mammalian alpha-defensins

artículo científico publicado en 2004

Evolution of flower shape in Plantago lanceolata.

artículo científico publicado en 2009

Evolutionary rate and duplicability in the Arabidopsis thaliana protein-protein interaction network.

artículo científico publicado en 2012

Fitness Trade-Offs Determine the Role of the Molecular Chaperonin GroEL in Buffering Mutations

artículo científico publicado en 2015

Functional coevolutionary networks of the Hsp70-Hop-Hsp90 system revealed through computational analyses

artículo científico publicado en 2007

Functional conservation of an ancestral Pellino protein in helminth species

artículo científico publicado en 2015

Functional diversification of the twin-arginine translocation pathway mediates the emergence of novel ecological adaptations

artículo científico publicado en 2011

GRAST: a new way of genome reduction analysis using comparative genomics

artículo científico publicado en 2006

Genome-wide functional divergence after the symbiosis of proteobacteria with insects unraveled through a novel computational approach

artículo científico publicado en 2009

GroEL and the maintenance of bacterial endosymbiosis

artículo científico publicado en 2004

Group 1 LEA proteins, an ancestral plant protein group, are also present in other eukaryotes, and in the archeae and bacteria domains.

artículo científico publicado en 2013

In silico identification of functional divergence between the multiple groEL gene paralogs in Chlamydiae

artículo científico publicado en 2007

Molecular evolution of rbcL in three gymnosperm families: identifying adaptive and coevolutionary patterns

artículo científico publicado en 2011

Molecular evolution of viral multifunctional proteins: the case of potyvirus HC-Pro.

artículo científico publicado en 2013

Molecular evolutionary mechanisms driving functional diversification of the HSP90A family of heat shock proteins in eukaryotes

artículo científico publicado en 2013

Mutational dynamics of murine angiogenin duplicates.

artículo científico publicado en 2010

No rosetta stone for a sense-antisense origin of aminoacyl tRNA synthetase classes

artículo científico publicado en 2008

Pivotal Advance: Avian colony-stimulating factor 1 (CSF-1), interleukin-34 (IL-34), and CSF-1 receptor genes and gene products

artículo científico publicado en 2010

Positive selection and subfunctionalization of duplicated CCT chaperonin subunits

artículo científico publicado en 2003

Protein coadaptation and the design of novel approaches to identify protein-protein interactions.

artículo científico publicado en 2011

Proteome-wide analysis of functional divergence in bacteria: exploring a host of ecological adaptations

artículo científico publicado en 2012

Rate asymmetry after genome duplication causes substantial long-branch attraction artifacts in the phylogeny of Saccharomyces species

artículo científico publicado en 2005

Relationships of gag-pol diversity between Ty3/Gypsy and Retroviridae LTR retroelements and the three kings hypothesis

artículo científico publicado en 2008

SWAPSC: sliding window analysis procedure to detect selective constraints

artículo científico publicado en 2004

Selection for translational robustness in Buchnera aphidicola, endosymbiotic bacteria of aphids

artículo científico publicado en 2009

Selection on coding regions determined Hox7 genes evolution

artículo científico publicado en 2003

Structural calibration of the rates of amino acid evolution in a search for Darwin in drifting biological systems.

artículo científico publicado en 2010

Survival and innovation: The role of mutational robustness in evolution.

artículo científico publicado en 2014

Testing the Neutral Fixation of Hetero-Oligomerism in the Archaeal Chaperonin CCT

scientific article published on 03 April 2007

The Phenotypic Plasticity of Duplicated Genes in Saccharomyces cerevisiae and the Origin of Adaptations

artículo científico publicado en 2016

The effect of chaperonin buffering on protein evolution ⬇️

artículo científico publicado en 2010

The evolution of protein moonlighting: adaptive traps and promiscuity in the chaperonins.

artículo científico publicado en 2014

The evolution of the flagellar assembly pathway in endosymbiotic bacterial genomes.

artículo científico publicado en 2008

The origins of mutational robustness

artículo científico

The roles of whole-genome and small-scale duplications in the functional specialization of Saccharomyces cerevisiae genes.

artículo científico publicado en 2013

Transcriptional Rewiring, Adaptation, and the Role of Gene Duplication in the Metabolism of Ethanol of Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2020

Two chaperonin systems in bacterial genomes with distinct ecological roles

artículo científico publicado en 2009

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