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Lista de obras de Shannon K. McWeeney

31st Annual Meeting and Associated Programs of the Society for Immunotherapy of Cancer (SITC 2016): part two: National Harbor, MD, USA. 9-13 November 2016

artículo científico publicado en 2016

A DNA methylation microarray-based study identifies ERG as a gene commonly methylated in prostate cancer

artículo científico publicado en 2011

A Mouse Model of Chronic West Nile Virus Disease

artículo científico publicado en 2016

A Simulation Framework to Investigate in vitro Viral Infection Dynamics

article

A comprehensive collection of systems biology data characterizing the host response to viral infection.

artículo científico publicado en 2014

A systems framework for vaccine design

artículo científico publicado en 2013

A viral microRNA down-regulates multiple cell cycle genes through mRNA 5'UTRs

artículo científico publicado en 2010

Alignment of the transcriptome with individual variation in animals selectively bred for High Drinking-In-the-Dark (HDID).

artículo científico publicado en 2017

An antisense transcript induced by Wnt/beta-catenin signaling decreases E2F4.

artículo científico publicado en 2006

Androgen receptor promotes ligand-independent prostate cancer progression through c-Myc upregulation

artículo científico publicado en 2013

Baseline T cell immune phenotypes predict virologic and disease control upon SARS-CoV infection

artículo científico publicado en 2020

Brain size genes and risk of dementia

article

CSF1R inhibitors exhibit antitumor activity in acute myeloid leukemia by blocking paracrine signals from support cells

artículo científico publicado en 2018

Clinical resistance to crenolanib in acute myeloid leukemia due to diverse molecular mechanisms

scientific article published in Nature Communications

Comparison of methods to identify aberrant expression patterns in individual patients: augmenting our toolkit for precision medicine

artículo científico publicado en 2013

Complex Genetic Architecture Underlies Regulation of Influenza-A-Virus-Specific Antibody Responses in the Collaborative Cross

artículo científico publicado en 2020

Complex genetics of interactions of alcohol and CNS function and behavior

artículo científico publicado en 2005

Computational detection of alternative exon usage

artículo científico publicado en 2011

Consensus framework for exploring microarray data using multiple clustering methods

artículo científico publicado en 2007

Conserved host response to highly pathogenic avian influenza virus infection in human cell culture, mouse and macaque model systems

artículo científico publicado en 2011

Convergence of Divergent Tumors: A Systems Biology Approach of Tumor-specific Signaling

Copy number variation analysis in 98 individuals with PHACE syndrome

artículo científico publicado en 2012

Corrigendum: The BioPAX community standard for pathway data sharing

correction; published 7 December 2010

Cosplicing network analysis of mammalian brain RNA-Seq data utilizing WGCNA and Mantel correlations

artículo científico publicado en 2015

Cross-species molecular dissection across alcohol behavioral domains

scientific article published on 06 December 2017

Cytomegalovirus miRNAs target secretory pathway genes to facilitate formation of the virion assembly compartment and reduce cytokine secretion.

artículo científico publicado en 2014

DNA microarray and proteomic strategies for understanding alcohol action

artículo científico publicado en 2006

Data integration and reproducibility for high-throughput transcriptomics

artículo científico publicado en 2014

Defining the CREB regulon: a genome-wide analysis of transcription factor regulatory regions.

artículo científico publicado en 2004

Deoxyribonucleic acid microarray analysis of gene expression pattern in the arcuate nucleus/ventromedial nucleus of hypothalamus during lactation

artículo científico publicado en 2005

Detection of expression quantitative trait Loci in complex mouse crosses: impact and alleviation of data quality and complex population substructure

artículo científico publicado en 2012

Differential network analysis reveals genetic effects on catalepsy modules

artículo científico publicado en 2013

Distribution of menin-occupied regions in chromatin specifies a broad role of menin in transcriptional regulation

artículo científico publicado en 2007

Diversity Outbred Mice at 21: Maintaining Allelic Variation in the Face of Selection.

artículo científico publicado en 2016

Dual-trait selection for ethanol consumption and withdrawal: genetic and transcriptional network effects

artículo científico publicado en 2014

ERBB2/HER2 mutations are transforming and therapeutically targetable in leukemia

artículo científico publicado en 2020

Erratum: Corrigendum: The BioPAX community standard for pathway data sharing

scholarly article published in Nature Biotechnology

Evaluating gene expression in C57BL/6J and DBA/2J mouse striatum using RNA-Seq and microarrays

artículo científico publicado en 2011

Expression quantitative trait Loci for extreme host response to influenza a in pre-collaborative cross mice

artículo científico publicado en 2012

Functional and genomic context in pathway analysis of GWAS data

artículo científico publicado en 2014

Functional genomic analysis identifies drug targetable pathways in invasive and metastatic cutaneous squamous cell carcinoma

artículo científico publicado en 2020

Gender-Specific Effects of Selection for Drinking in the Dark on the Network Roles of Coding and Noncoding RNAs

artículo científico publicado en 2018

Gene networks and haloperidol-induced catalepsy.

artículo científico publicado en 2011

Genes, behavior and next-generation RNA sequencing.

artículo científico

Genetic diversity and striatal gene networks: focus on the heterogeneous stock-collaborative cross (HS-CC) mouse

artículo científico publicado en 2010

Genetic factors involved in risk for methamphetamine intake and sensitization.

artículo científico publicado en 2013

Genetics, Behavior, and Brain Dopamine Systems

article

Genomic landscape of neutrophilic leukemias of ambiguous diagnosis

artículo científico publicado en 2019

High throughput sequencing in mice: a platform comparison identifies a preponderance of cryptic SNPs.

artículo científico publicado en 2009

HitWalker: variant prioritization for personalized functional cancer genomics

artículo científico publicado en 2013

Host regulatory network response to infection with highly pathogenic H5N1 avian influenza virus

artículo científico publicado en 2011

Human Mycobacterium tuberculosis CD8 T Cell Antigens/Epitopes Identified by a Proteomic Peptide Library

artículo científico publicado en 2013

Identification of {beta}-catenin binding regions in colon cancer cells using ChIP-Seq

artículo científico publicado en 2010

Immune Predictors of Mortality After Ribonucleic Acid Virus Infection

artículo científico publicado en 2020

Influenza vaccination of pregnant women: attitudes and behaviors of Oregon physician prenatal care providers

artículo científico publicado en 2015

LSD1 activates a lethal prostate cancer gene network independently of its demethylase function.

artículo científico publicado en 2018

Limited clinical utility of a genetic risk score for the prediction of fracture risk in elderly subjects

artículo científico publicado en 2015

Localization of TFIIB binding regions using serial analysis of chromatin occupancy

artículo científico publicado en 2007

Locus and population specific evolution in HLA class II genes.

artículo científico publicado en 1999

MIFlowCyt: the minimum information about a Flow Cytometry Experiment

artículo científico publicado en 2008

Mapping cellular transcriptosomes in autopsied Alzheimer's disease subjects and relevant animal models

artículo científico publicado en 2005

Mechanisms of severe acute respiratory syndrome coronavirus-induced acute lung injury

scientific article published on 06 August 2013

Microcephaly genes and risk of late-onset Alzheimer disease

artículo científico publicado en 2011

Modeling host genetic regulation of influenza pathogenesis in the collaborative cross

artículo científico publicado en 2013

Multi-omic network signatures of disease.

artículo científico publicado en 2014

Myeloid lineage enhancers drive oncogene synergy in CEBPA/CSF3R mutant acute myeloid leukemia

scientific article published on 29 November 2019

Occupancy classification of position weight matrix-inferred transcription factor binding sites.

artículo científico publicado en 2011

On the integration of alcohol-related quantitative trait loci and gene expression analyses

artículo científico publicado en 2004

Oncogenic CSF3R mutations in chronic neutrophilic leukemia and atypical CML

artículo científico publicado en 2013

Protein co-expression network analysis (ProCoNA).

artículo científico publicado en 2013

Protein database and quantitative analysis considerations when integrating genetics and proteomics to compare mouse strains.

artículo científico publicado en 2011

REST corepressors RCOR1 and RCOR2 and the repressor INSM1 regulate the proliferation-differentiation balance in the developing brain

artículo científico publicado en 2017

Recurrent cyclin D2 mutations in myeloid neoplasms.

artículo científico publicado en 2017

Release of severe acute respiratory syndrome coronavirus nuclear import block enhances host transcription in human lung cells

artículo científico publicado en 2013

Renal gene and protein expression signatures for prediction of kidney disease progression

artículo científico publicado en 2009

Reversible suppression of T cell function in the bone marrow microenvironment of acute myeloid leukemia

artículo científico publicado en 2020

SNPs matter: impact on detection of differential expression.

artículo científico publicado en 2007

Selection for drinking in the dark alters brain gene coexpression networks.

artículo científico publicado en 2013

Similar gene expression profiles do not imply similar tissue functions

artículo científico publicado en 2006

Splicing landscape of the eight collaborative cross founder strains.

artículo científico publicado en 2015

Synthetic lethality of TNK2 inhibition in PTPN11-mutant leukemia

artículo científico publicado en 2018

Systems immunogenetics of vaccines

artículo científico publicado en 2013

TandTRAQ: an open-source tool for integrated protein identification and quantitation

artículo científico publicado en 2007

Teaching data science fundamentals through realistic synthetic clinical cardiovascular data

scholarly article published 12 December 2017

The BioPAX community standard for pathway data sharing

artículo científico publicado en 2010

The Plasmodium genome database

artículo científico publicado en 2002

The TP53 Apoptotic Network Is a Primary Mediator of Resistance to BCL2 Inhibition in AML Cells

scientific article published on 02 May 2019

The effect of inhibition of PP1 and TNFα signaling on pathogenesis of SARS coronavirus

artículo científico publicado en 2016

The genetics of gene expression in complex mouse crosses as a tool to study the molecular underpinnings of behavior traits

artículo científico

Translational gene mapping of cognitive decline

scientific article published on 14 December 2006

Utilizing RNA-Seq data for de novo coexpression network inference

artículo científico publicado en 2012

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