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Lista de obras de Anil Wipat

A Computational Workflow for the Automated Generation of Models of Genetic Designs

artículo científico publicado en 2018

A Genetic Circuit Compiler: Generating Combinatorial Genetic Circuits with Web Semantics and Inference

scientific article published on 20 November 2018

A Transcriptional Signature of Fatigue Derived from Patients with Primary Sjögren's Syndrome

artículo científico publicado en 2015

A Visual Language for Protein Design.

artículo científico publicado en 2017

A distributed computational search strategy for the identification of diagnostics targets: application to finding aptamer targets for methicillin-resistant staphylococci

artículo científico publicado en 2014

A genome wide analysis of the response to uncapped telomeres in budding yeast reveals a novel role for the NAD+ biosynthetic gene BNA2 in chromosome end protection ⬇️

artículo científico publicado en 2008

A genomewide suppressor and enhancer analysis of cdc13-1 reveals varied cellular processes influencing telomere capping in Saccharomyces cerevisiae.

artículo científico publicado en 2008

A novel extracellular metallopeptidase domain shared by animal host-associated mutualistic and pathogenic microbes

artículo científico publicado en 2012

A standard-enabled workflow for synthetic biology

artículo científico publicado en 2017

An Integrated Data Driven Approach to Drug Repositioning Using Gene-Disease Associations

artículo científico publicado en 2016

An integrated dataset for in silico drug discovery

artículo científico publicado en 2010

An internal FK506-binding domain is the catalytic core of the prolyl isomerase activity associated with the Bacillus subtilis trigger factor

artículo científico publicado en 1997

Annotation of SBML models through rule-based semantic integration

artículo científico publicado en 2010

Annotation of rule-based models with formal semantics to enable creation, analysis, reuse and visualization

artículo científico publicado en 2015

Automatic extraction of microorganisms and their habitats from free text using text mining workflows

artículo científico publicado en 2011

BacillOndex: an integrated data resource for systems and synthetic biology

artículo científico publicado en 2013

BacilloFlex: A modular DNA assembly toolkit for Bacillus subtilis synthetic biology

article

BacillusRegNet: a transcriptional regulation database and analysis platform for Bacillus species

artículo científico publicado en 2014

Bayesian integration of networks without gold standards

artículo científico publicado en 2012

Bioinformatics in aging research: a workshop report.

artículo científico publicado en 2010

CSBB: synthetic biology research at Newcastle University

artículo científico publicado en 2017

Cellular senescence: unravelling complexity

artículo científico publicado en 2009

Communicating Structure and Function in Synthetic Biology Diagrams

scientific article published on 05 August 2019

Comparison of sulfide-oxidizing Sulfurimonas strains reveals a new mode of thiosulfate formation in subsurface environments

scientific article published on 15 December 2019

Customizable views on semantically integrated networks for systems biology.

artículo científico

Data Integration and Mining for Synthetic Biology Design

artículo científico publicado en 2016

Data Resource Profile: Accessible Resource for Integrated Epigenomic Studies (ARIES).

artículo científico publicado en 2015

Data mining the human gut microbiota for therapeutic targets

artículo científico publicado en 2012

Design and modelling of an engineered bacteria-based, pressure-sensitive soil.

artículo científico publicado en 2018

Essential Bacillus subtilis genes

artículo científico publicado en 2003

Evolutionary computation for the design of a stochastic switch for synthetic genetic circuits

artículo científico publicado en 2010

Exploring Microbial Genome Sequences to Identify Protein Families on the Grid

artículo científico publicado en 2007

Feedback between p21 and reactive oxygen production is necessary for cell senescence

artículo científico publicado en 2010

From genome to function: systematic analysis of the soil bacterium bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2001

Genome-wide analysis to identify pathways affecting telomere-initiated senescence in budding yeast.

artículo científico publicado en 2011

Genome-wide transcriptional analysis of the phosphate starvation stimulon of Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2005

Guidelines for reporting the use of gel electrophoresis in proteomics.

artículo científico publicado en 2008

Harmonizing semantic annotations for computational models in biology

Harmonizing semantic annotations for computational models in biology

artículo científico publicado en 2019

Heterogeneity in Pure Microbial Systems: Experimental Measurements and Modeling

artículo científico publicado en 2017

Human Tra2 proteins jointly control a CHEK1 splicing switch among alternative and constitutive target exons

artículo científico publicado en 2014

Impact of age-related mitochondrial dysfunction and exercise on intestinal microbiota composition

artículo científico publicado en 2018

Keratinocyte apoptosis in epidermal remodeling and clearance of psoriasis induced by UV radiation.

artículo científico publicado en 2011

Microbase2.0: a generic framework for computationally intensive bioinformatics workflows in the cloud

artículo científico publicado en 2012

Mild hydrostatic pressure triggers oxidative responses in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2018

Mining integrated semantic networks for drug repositioning opportunities

artículo científico publicado en 2016

Mining integrated semantic networks for drug repositioning opportunities

Model annotation for synthetic biology: automating model to nucleotide sequence conversion

artículo científico publicado en 2011

Modeling and managing experimental data using FuGE.

artículo científico publicado en 2009

Modelling the fitness landscapes of a SCRaMbLEd yeast genome

artículo científico publicado en 2022

Monoclonal antibodies for Streptomyces lividans and their use for immunomagnetic capture of spores from soil.

artículo científico publicado en 1994

NOX5-induced uncoupling of endothelial NO synthase is a causal mechanism and theragnostic target of an age-related hypertension endotype

artículo científico publicado en 2020

Network approaches to the functional analysis of microbial proteins

artículo científico

Ontology for genome comparison and genomic rearrangements

artículo científico

Phosphate starvation induces the sporulation killing factor of Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2006

Post-transcriptional regulation of the Bacillus subtilis pst operon encoding a phosphate-specific ABC transporter

artículo científico publicado en 2004

Probabilistic latent semantic analysis applied to whole bacterial genomes identifies common genomic features

artículo científico

Proposed data model for the next version of the synthetic biology open language

artículo científico publicado en 2014

Proteomic analysis of Bacillus subtilis strains engineered for improved production of heterologous proteins

artículo científico publicado en 2013

Qualitatively modelling and analysing genetic regulatory networks: a Petri net approach

artículo científico publicado en 2006

Quantitative fitness analysis shows that NMD proteins and many other protein complexes suppress or enhance distinct telomere cap defects.

artículo científico publicado en 2011

Regulating, Measuring, and Modeling the Viscoelasticity of Bacterial Biofilms

scientific article published on 22 August 2019

SARGE: a tool for creation of putative genetic networks.

artículo científico publicado en 2004

SBOL Visual 2 Ontology

artículo científico publicado en 2020

SBOL Visual: A Graphical Language for Genetic Designs

artículo científico publicado en 2015

SBOL on the Web: Bringing the Synthetic Biology Open Language to the Web browser

scientific article published on 08 January 2019

SBOL-OWL: An Ontological Approach for Formal and Semantic Representation of Synthetic Biology Information

scientific article published on 14 May 2019

SBOLDesigner 2: An Intuitive Tool for Structural Genetic Design.

artículo científico publicado en 2017

Saint: a lightweight integration environment for model annotation

artículo científico publicado en 2009

Sequence and transcriptional analysis of clpX, a class-III heat-shock gene of Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 1996

Sequencing and functional analysis of the genome of Bacillus subtilis strain 168.

artículo científico publicado en 1996

Sharing Structure and Function in Biological Design with SBOL 2.0.

artículo científico publicado en 2016

ShortBOL: A Language for Scripting Designs for Engineered Biological Systems Using Synthetic Biology Open Language (SBOL)

artículo científico publicado en 2020

Species-Specific Detection of C. difficile Using Targeted Antibody Design

scientific article published on 31 October 2018

Standard virtual biological parts: a repository of modular modeling components for synthetic biology

artículo científico publicado en 2010

Streptomyces marker plasmids for monitoring survival and spread of streptomycetes in soil ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 1991

Structure-function studies of an engineered scaffold protein derived from Stefin A. II: Development and applications of the SQT variant

artículo científico publicado en 2011

SynBioHub: A Standards-Enabled Design Repository for Synthetic Biology

artículo científico publicado en 2018

Synthetic Biology Open Language (SBOL) Version 2.0.0.

artículo científico

Synthetic Biology Open Language (SBOL) Version 2.1.0.

artículo científico publicado en 2016

Synthetic Biology Open Language (SBOL) Version 2.2.0.

artículo científico publicado en 2018

Synthetic Biology Open Language (SBOL) Version 2.3.

scientific article published on 13 June 2019

Synthetic Biology Open Language Visual (SBOL Visual) Version 2.0.

artículo científico publicado en 2018

Synthetic Biology Open Language Visual (SBOL Visual) Version 2.1.

scientific article published on 13 June 2019

Synthetic biology open language (SBOL) version 3.0.0.

artículo científico publicado en 2020

Synthetic biology open language visual (SBOL visual) version 2.2.

artículo científico publicado en 2020

Taverna: a tool for the composition and enactment of bioinformatics workflows

artículo científico publicado en 2004

The SBOL Stack: A Platform for Storing, Publishing, and Sharing Synthetic Biology Designs

artículo científico publicado en 2016

The Synthetic Biology Open Language (SBOL) provides a community standard for communicating designs in synthetic biology.

artículo científico publicado en 2014

The complete genome sequence of the gram-positive bacterium Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 1997

The dnaB-pheA (256 degrees-240 degrees) region of the Bacillus subtilis chromosome containing genes responsible for stress responses, the utilization of plant cell walls and primary metabolism.

artículo científico publicado en 1996

The extracellular and cytoplasmic proteomes of the non-virulent Bacillus anthracis strain UM23C1-2.

artículo científico publicado en 2005

The gel electrophoresis markup language (GelML) from the Proteomics Standards Initiative

artículo científico publicado en 2010

The minimum information about a genome sequence (MIGS) specification

artículo científico publicado en 2008

The quantification of antibody elements and receptors subunit expression using qPCR: The design of VH, VL, CH, CL, FcR subunits primers for a more holistic view of the immune system

scientific article published on 01 November 2019

VisBOL: Web-Based Tools for Synthetic Biology Design Visualization

artículo científico publicado en 2016

e-Science: relieving bottlenecks in large-scale genome analyses

artículo científico publicado en 2008

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