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Lista de obras de Robert Preissner

2D and 3D similarity landscape analysis identifies PARP as a novel off-target for the drug Vatalanib.

artículo científico publicado en 2015

A comprehensive view on proteasomal sequences: implications for the evolution of the proteasome

artículo científico publicado en 2003

A new algorithm for integrated analysis of miRNA-mRNA interactions based on individual classification reveals insights into bladder cancer.

artículo científico publicado en 2013

A rationally designed tyrosine hydroxylase DNA vaccine induces specific antineuroblastoma immunity

artículo científico publicado en 2008

A structural genomics approach to the regulation of apoptosis: chimp vs. human

artículo científico publicado en 2007

Accelerating screening of 3D protein data with a graph theoretical approach

artículo científico publicado en 2003

Acyclovir Has Low but Detectable Influence on HLA-B*57:01 Specificity without Inducing Hypersensitivity

artículo científico publicado en 2015

Adjuvant antifungal therapy using tissue tolerable plasma on oral mucosa and removable dentures in oral candidiasis patients: a randomised double-blinded split-mouth pilot study

artículo científico publicado en 2016

Allosteric Modulation of the CB1 Cannabinoid Receptor by Cannabidiol—A Molecular Modeling Study of the N-Terminal Domain and the Allosteric-Orthosteric Coupling

artículo científico publicado en 2021

Analysis and prediction of helix-helix interactions in membrane channels and transporters

artículo científico publicado en 2006

Analysis of sex and gender-specific research reveals a common increase in publications and marked differences between disciplines

artículo científico publicado en 2010

Anti-diabetic effect of the ethyl acetate fraction of Clerodendrum volubile: protocatechuic acid suppresses phagocytic oxidative burst and modulates inflammatory cytokines.

artículo científico publicado en 2016

Bax/Bak-independent mitochondrial depolarization and reactive oxygen species induction by sorafenib overcome resistance to apoptosis in renal cell carcinoma

artículo científico publicado en 2017

Binding sites in membrane proteins--diversity, druggability and prospects

artículo científico publicado en 2011

BitterSweetForest: A Random Forest Based Binary Classifier to Predict Bitterness and Sweetness of Chemical Compounds

artículo científico publicado en 2018

CancerResource--updated database of cancer-relevant proteins, mutations and interacting drugs

artículo científico publicado en 2015

CancerResource: a comprehensive database of cancer-relevant proteins and compound interactions supported by experimental knowledge ⬇️

artículo científico publicado el 15 de octubre de 2010

CardioScape mapping the cardiovascular funding landscape in Europe.

artículo científico publicado en 2017

CardioScape-II: the need to map cardiovascular funding patterns in Europe

artículo científico publicado en 2020

Cellular fingerprints: a novel approach using large-scale cancer cell line data for the identification of potential anticancer agents

artículo científico publicado en 2009

Characterization of GD2 peptide mimotope DNA vaccines effective against spontaneous neuroblastoma metastases.

artículo científico publicado en 2006

Chemical Proteomics Reveals Ferrochelatase as a Common Off-target of Kinase Inhibitors

artículo científico publicado en 2016

Cobweb: a Java applet for network exploration and visualisation

artículo científico publicado en 2011

Columba: an integrated database of proteins, structures, and annotations

artículo científico publicado en 2005

Comparative VEGF receptor tyrosine kinase modeling for the development of highly specific inhibitors of tumor angiogenesis.

artículo científico publicado en 2008

Comparison of 2D similarity and 3D superposition. Application to searching a conformational drug database

artículo científico publicado en 2004

Computational Prediction of Potential Inhibitors of the Main Protease of SARS-CoV-2

artículo científico publicado en 2020

Computational and experimental validation of antioxidant properties of synthesized bioactive ferulic acid derivatives

Computational methods for prediction of in vitro effects of new chemical structures

artículo científico publicado en 2016

Computational prediction of immune cell cytotoxicity

artículo científico publicado en 2017

Computer-assisted identification of small-molecule Bcl-2 modulators

artículo científico publicado en 2009

Conservation of cis prolyl bonds in proteins during evolution.

artículo científico publicado en 2005

Cytotoxic Effect of Vanicosides A and B from Reynoutria sachalinensis Against Melanotic and Amelanotic Melanoma Cell Lines and in silico Evaluation for Inhibition of BRAFV600E and MEK1 ⬇️

artículo científico publicado en 2020

DBEndo: a web-based endodontic case management tool

artículo científico publicado en 2015

DNA vaccination: using the patient's immune system to overcome cancer

artículo científico publicado en 2010

Design and biological evaluation of photo-switchable inhibitors.

artículo científico publicado en 2006

Development of immune-specific interaction potentials and their application in the multi-agent-system VaccImm

artículo científico publicado en 2011

Dictionary of interfaces in proteins (DIP). Data bank of complementary molecular surface patches.

artículo científico publicado en 1998

Docking without docking: ISEARCH--prediction of interactions using known interfaces

artículo científico publicado en 2007

Drug cocktail optimization in chemotherapy of cancer

artículo científico publicado en 2012

Drugs as habitable planets in the space of dark chemical matter

artículo científico publicado en 2017

Endogenous Bak inhibitors Mcl-1 and Bcl-xL: differential impact on TRAIL resistance in Bax-deficient carcinoma.

artículo científico publicado en 2010

Enzymatic, expression and structural divergences among carboxyl O-methyltransferases after gene duplication and speciation in Nicotiana

artículo científico publicado en 2009

Estrogen-mediated upregulation of the Mas receptor contributes to sex differences in acute lung injury and lung vascular barrier regulation

scientific article published on 06 August 2020

Evidence for treatment with estradiol for women with SARS-CoV-2 infection

artículo científico publicado en 2020

Evidence-Based Considerations Exploring Relations between SARS-CoV-2 Pandemic and Air Pollution: Involvement of PM2.5-Mediated Up-Regulation of the Viral Receptor ACE-2

artículo científico publicado en 2020

Exploring Activity Profiles of PAINS and Their Structural Context in Target–Ligand Complexes

artículo científico publicado en 2018

FragmentStore--a comprehensive database of fragments linking metabolites, toxic molecules and drugs

artículo científico publicado en 2010

GenderMedDB: an interactive database of sex and gender-specific medical literature

artículo científico publicado en 2014

Homonyms and synonyms in the Dictionary of Interfaces in Proteins (DIP).

artículo científico publicado en 1999

Hydrogen-bonding and packing features of membrane proteins: functional implications

artículo científico publicado en 2007

IL-13 is a driver of COVID-19 severity

artículo científico publicado en 2021

Identification of signature volatiles to discriminate Candida albicans, glabrata, krusei and tropicalis using gas chromatography and mass spectrometry

artículo científico publicado en 2015

In silico screening of drug databases for TSE inhibitors

artículo científico publicado en 2005

Inhibiting the inhibitors: retro-inverso Smac peptides

artículo científico publicado en 2009

Inhibition of DNA-Topoisomerase I by Acylated Triterpene Saponins from Pittosporum angustifolium Lodd

artículo científico publicado en 2016

Inhomogeneous molecular density: reference packing densities and distribution of cavities within proteins

artículo científico publicado en 2003

Inverse sequence similarity in proteins and its relation to the three-dimensional fold.

artículo científico publicado en 1997

Inverse sequence similarity of proteins does not imply structural similarity

artículo científico publicado en 2003

JAIL: a structure-based interface library for macromolecules

artículo científico publicado en 2008

Legionella pneumophila induces IFNbeta in lung epithelial cells via IPS-1 and IRF3, which also control bacterial replication

artículo científico publicado en 2006

Loops In Proteins (LIP)--a comprehensive loop database for homology modelling.

artículo científico publicado en 2003

Mapping discontinuous protein-binding sites via structure-based peptide libraries: combining in silico and in vitro approaches

artículo científico publicado en 2013

Matching organic libraries with protein-substructures.

artículo científico publicado en 2001

Molecular basis for the sensitivity of TRP channels to polyunsaturated fatty acids

artículo científico publicado en 2018

Molecular packing and packing defects in helical membrane proteins

artículo científico publicado en 2004

Molecular similarity-based predictions of the Tox21 screening outcome

article

Natural Products: Sources and Databases

article

Natural products: sources and databases

artículo científico publicado en 2006

Norditerpenoids with Selective Anti-Cholinesterase Activity from the Roots of Perovskia atriplicifolia Benth

artículo científico publicado en 2020

Notch inhibition blocks multiple myeloma cell-induced osteoclast activation

artículo científico publicado en 2008

Novel curcumin- and emodin-related compounds identified by in silico 2D/3D conformer screening induce apoptosis in tumor cells

artículo científico publicado en 2005

Occurrence of bifurcated three-center hydrogen bonds in proteins.

artículo científico publicado en 1991

On α-helices terminated by glycine

article

Outcome of revascularization therapy in traumatized immature incisors

artículo científico publicado en 2020

PROMISCUOUS 2.0: a resource for drug-repositioning

scientific article published on 16 November 2020

PROMISCUOUS: a database for network-based drug-repositioning

artículo científico publicado en 2010

Pain-prescription differences – an analysis of 500,000 discharge summaries

Personalized Cancer Therapy Considering Cytochrome P450 Variability

artículo científico

Photoactivation of an inhibitor of the 12/15-lipoxygenase pathway

artículo científico publicado en 2006

Polymorphic cytochrome P450 enzymes (CYPs) and their role in personalized therapy

artículo científico publicado en 2013

Prediction Is a Balancing Act: Importance of Sampling Methods to Balance Sensitivity and Specificity of Predictive Models Based on Imbalanced Chemical Data Sets

Prediction of prolyl residues incis-conformation in protein structures on the basis of the amino acid sequence

article

ProTox-II: a webserver for the prediction of toxicity of chemicals

artículo científico publicado en 2018

ProTox: a web server for the in silico prediction of rodent oral toxicity

artículo científico publicado en 2014

Real-world evidence for improved outcomes with histamine antagonists and aspirin in 22,560 COVID-19 patients

artículo científico publicado en 2021

Representation of target-bound drugs by computed conformers: implications for conformational libraries

artículo científico publicado en 2006

Residues of a proposed gate region in type I ATP-binding cassette import systems are crucial for function as revealed by mutational analysis

artículo científico publicado en 2013

SDM--a server for predicting effects of mutations on protein stability and malfunction ⬇️

artículo científico publicado en 2011

SL2: an interactive webtool for modeling of missing segments in proteins

artículo científico publicado en 2016

SUPERFICIAL--surface mapping of proteins via structure-based peptide library design.

artículo científico publicado en 2005

Sixty-One Volatiles Have Phylogenetic Signals Across Bacterial Domain and Fungal Kingdom

artículo científico publicado en 2020

Spare parts for helix–helix interaction

article

Statin and rottlerin small-molecule inhibitors restrict colon cancer progression and metastasis via MACC1.

artículo científico publicado en 2017

Structural features and evolution of protein-protein interactions.

artículo científico publicado en 2010

Structural features of transmembrane helices

artículo científico publicado en 2004

Suffix techniques as a rapid method for RNA substructure search.

artículo científico

Super Natural II--a database of natural products

artículo científico publicado en 2014

SuperCYP: a comprehensive database on Cytochrome P450 enzymes including a tool for analysis of CYP-drug interactions

artículo científico publicado en 2010

SuperCYPsPred-a web server for the prediction of cytochrome activity

scientific article published on 17 March 2020

SuperDRUG2: a one stop resource for approved/marketed drugs

artículo científico publicado en 2017

SuperDrug: a conformational drug database

artículo científico publicado en 2005

SuperHapten: a comprehensive database for small immunogenic compounds

artículo científico publicado en 2007

SuperLigands - a database of ligand structures derived from the Protein Data Bank

artículo científico publicado en 2005

SuperLooper--a prediction server for the modeling of loops in globular and membrane proteins

artículo científico publicado en 2009

SuperMimic--fitting peptide mimetics into protein structures

artículo científico publicado en 2006

SuperNatural: a searchable database of available natural compounds

artículo científico publicado en 2006

SuperPain--a resource on pain-relieving compounds targeting ion channels

artículo científico publicado en 2013

SuperPred: drug classification and target prediction

artículo científico publicado en 2008

SuperPred: update on drug classification and target prediction

artículo científico publicado en 2014

SuperScent--a database of flavors and scents

artículo científico publicado en 2008

SuperSite: dictionary of metabolite and drug binding sites in proteins

artículo científico publicado en 2008

SuperSweet--a resource on natural and artificial sweetening agents

artículo científico publicado en 2011

SuperTarget and Matador: resources for exploring drug-target relationships

artículo científico publicado en 2007

SuperTarget goes quantitative: update on drug-target interactions

artículo científico publicado en 2011

SuperToxic: a comprehensive database of toxic compounds

artículo científico publicado en 2008

Superimpose: a 3D structural superposition server

artículo científico publicado en 2008

Suppressive Effects of Clerodendrum volubile P Beauv. [Labiatae] Methanolic Extract and Its Fractions on Type 2 Diabetes and Its Complications.

artículo científico publicado en 2018

Survivin minigene DNA vaccination is effective against neuroblastoma

artículo científico publicado en 2009

SynSysNet: integration of experimental data on synaptic protein-protein interactions with drug-target relations

artículo científico publicado en 2012

TRPC6 G757D Loss-of-Function Mutation Associates with FSGS.

artículo científico publicado en 2016

The Catch-22 of Predicting hERG Blockade Using Publicly Accessible Bioactivity Data

artículo científico publicado en 2018

The Exponential Phase of the Covid-19 Pandemic in Central Italy: An Integrated Care Pathway

artículo científico publicado en 2020

The RTP site shared by the HIV-1 Tat protein and the 11S regulator subunit alpha is crucial for their effects on proteasome function including antigen processing

artículo científico publicado en 2002

The Transformer database: biotransformation of xenobiotics

artículo científico publicado en 2013

The target landscape of clinical kinase drugs

artículo científico publicado en 2017

Theoretical modeling techniques and their impact on tumor immunology

artículo científico publicado en 2010

Toxicity versus potency: elucidation of toxicity properties discriminating between toxins, drugs, and natural compounds

artículo científico publicado en 2008

VaccImm: simulating peptide vaccination in cancer therapy

artículo científico publicado en 2013

VirtualTaste: a web server for the prediction of organoleptic properties of chemical compounds

artículo científico publicado en 2021

Volatile Organic Compounds in the Breath of Oral Squamous Cell Carcinoma Patients: A Pilot Study

artículo científico publicado en 2017

Volatile organic compounds in the breath of oral candidiasis patients: a pilot study

artículo científico publicado en 2017

Voronoia: analyzing packing in protein structures

artículo científico publicado en 2008

WITHDRAWN--a resource for withdrawn and discontinued drugs

artículo científico publicado en 2015

mVOC 2.0: a database of microbial volatiles

artículo científico publicado en 2017

mVOC: a database of microbial volatiles

artículo científico

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