Filtros de búsqueda

Lista de obras de Michael P. Washburn

A chemoproteomic portrait of the oncometabolite fumarate

scientific article published on 04 February 2019

A label free quantitative proteomic analysis of the Saccharomyces cerevisiae nucleus

artículo científico publicado en 2008

A mammalian chromatin remodeling complex with similarities to the yeast INO80 complex

artículo científico publicado en 2005

A mammalian mediator subunit that shares properties with Saccharomyces cerevisiae mediator subunit Cse2

artículo científico publicado en 2004

A metazoan ATAC acetyltransferase subunit that regulates mitogen-activated protein kinase signaling is related to an ancient molybdopterin synthase component

artículo científico publicado en 2012

A novel histone fold domain-containing protein that replaces TAF6 in Drosophila SAGA is required for SAGA-dependent gene expression

artículo científico publicado en 2009

A role for Yin Yang-1 (YY1) in the assembly of snRNA transcription complexes

artículo científico publicado en 2006

A set of consensus mammalian mediator subunits identified by multidimensional protein identification technology

artículo científico publicado en 2004

A structured workflow for mapping human Sin3 histone deacetylase complex interactions using Halo-MudPIT AP-MS.

artículo científico publicado en 2018

AFF4, a component of the ELL/P-TEFb elongation complex and a shared subunit of MLL chimeras, can link transcription elongation to leukemia

artículo científico publicado en 2010

ATAC is a double histone acetyltransferase complex that stimulates nucleosome sliding

artículo científico publicado en 2008

ATXN7L3 and ENY2 Coordinate Activity of Multiple H2B Deubiquitinases Important for Cellular Proliferation and Tumor Growth.

artículo científico publicado en 2016

Acetylation by Tip60 is required for selective histone variant exchange at DNA lesions

artículo científico publicado en 2004

Advances in shotgun proteomics and the analysis of membrane proteomes.

artículo científico publicado en 2010

Affinity purification of protein complexes for analysis by multidimensional protein identification technology.

artículo científico

An automated multidimensional protein identification technology for shotgun proteomics

artículo científico publicado en 2001

Analysis of protein composition using multidimensional chromatography and mass spectrometry.

artículo científico publicado en 2014

Analysis of quantitative proteomic data generated via multidimensional protein identification technology

artículo científico publicado en 2002

Analysis of the heterochromatin protein 1 (HP1) interactome in Drosophila.

artículo científico publicado en 2014

Analyzing chromatin remodeling complexes using shotgun proteomics and normalized spectral abundance factors

artículo científico publicado en 2006

Assembly of the Elongin A Ubiquitin Ligase Is Regulated by Genotoxic and Other Stresses

artículo científico publicado en 2015

Ataxin-7 and Non-stop coordinate SCAR protein levels, subcellular localization, and actin cytoskeleton organization

scientific article published on 26 July 2019

Author Correction: Merkel cell polyomavirus activates LSD1-mediated blockade of non-canonical BAF to regulate transformation and tumorigenesis

artículo científico publicado en 2020

BRK phosphorylates SMAD4 for proteasomal degradation and inhibits tumor suppressor FRK to control SNAIL, SLUG, and metastatic potential

scientific article published on 23 October 2019

Binding of Drosophila Polo kinase to its regulator Matrimony is noncanonical and involves two separate functional domains.

artículo científico publicado en 2013

Biochemical Reduction of the Topology of the Diverse WDR76 Protein Interactome

artículo científico publicado en 2019

Building protein-protein interaction networks with proteomics and informatics tools.

artículo científico publicado en 2011

CHD8 associates with human Staf and contributes to efficient U6 RNA polymerase III transcription

artículo científico publicado en 2007

Characterization of Cullin-box sequences that direct recruitment of Cul2-Rbx1 and Cul5-Rbx2 modules to Elongin BC-based ubiquitin ligases

artículo científico publicado en 2008

Characterization of a highly conserved histone related protein, Ydl156w, and its functional associations using quantitative proteomic analyses

artículo científico publicado en 2011

Characterization of human cyclin-dependent kinase 12 (CDK12) and CDK13 complexes in C-terminal domain phosphorylation, gene transcription, and RNA processing

artículo científico publicado en 2015

Characterization of the yeast trimeric-SAS acetyltransferase complex

artículo científico publicado en 2005

Chromatin remodelers Isw1 and Chd1 maintain chromatin structure during transcription by preventing histone exchange

artículo científico publicado en 2012

Chromatin remodeller Fun30Fft3 induces nucleosome disassembly to facilitate RNA polymerase II elongation

scientific article published on 20 February 2017

Combinatorial depletion analysis to assemble the network architecture of the SAGA and ADA chromatin remodeling complexes

artículo científico publicado en 2011

Conserved abundance and topological features in chromatin-remodeling protein interaction networks

artículo científico publicado en 2014

Construction of protein interaction networks based on the label-free quantitative proteomics

artículo científico publicado en 2011

Controlling for gene expression changes in transcription factor protein networks

artículo científico publicado en 2014

Correlation of Relative Abundance Ratios Derived from Peptide Ion Chromatograms and Spectrum Counting for Quantitative Proteomic Analysis Using Stable Isotope Labeling

article

Ctk complex-mediated regulation of histone methylation by COMPASS.

artículo científico publicado en 2006

Cyclin F-mediated degradation of ribonucleotide reductase M2 controls genome integrity and DNA repair

artículo científico publicado en 2012

Cyclin-dependent kinase-mediated Sox2 phosphorylation enhances the ability of Sox2 to establish the pluripotent state

artículo científico publicado en 2015

CyclinA2-Cyclin-dependent Kinase Regulates SAMHD1 Protein Phosphohydrolase Domain

artículo científico publicado en 2015

DNA-PKcs-PIDDosome: a nuclear caspase-2-activating complex with role in G2/M checkpoint maintenance

scientific journal article

DYRK1A protein kinase promotes quiescence and senescence through DREAM complex assembly

artículo científico publicado en 2011

Deacetylase inhibitors dissociate the histone-targeting ING2 subunit from the Sin3 complex

artículo científico publicado en 2010

Deciphering the combinatorial histone code

scientific article published on 01 June 2007

Degradation of Cep68 and PCNT cleavage mediate Cep215 removal from the PCM to allow centriole separation, disengagement and licensing.

artículo científico publicado en 2014

Delayed correlation of mRNA and protein expression in rapamycin-treated cells and a role for Ggc1 in cellular sensitivity to rapamycin

artículo científico publicado en 2009

Determination of protein interactome of transcription factor Sox2 in embryonic stem cells engineered for inducible expression of four reprogramming factors.

artículo científico publicado en 2012

Determining protein complex connectivity using a probabilistic deletion network derived from quantitative proteomics

artículo científico publicado en 2009

Differential HDAC1/2 network analysis reveals a role for prefoldin/CCT in HDAC1/2 complex assembly

artículo científico publicado en 2018

Differential complex formation via paralogs in the human Sin3 protein interaction network

artículo científico publicado en 2020

Distinct modes of regulation of the Uch37 deubiquitinating enzyme in the proteasome and in the Ino80 chromatin-remodeling complex

artículo científico publicado en 2008

Driving biochemical discovery with quantitative proteomics.

artículo científico publicado en 2010

Driving integrative structural modeling with serial capture affinity purification

artículo científico publicado en 2020

Drosophila ELMO/CED-12 interacts with Myoblast city to direct myoblast fusion and ommatidial organization

artículo científico publicado en 2007

Dynamic RNA acetylation revealed by quantitative cross-evolutionary mapping

scientific article published on 17 June 2020

Dynamic and Combinatorial Landscape of Histone Modifications during the Intraerythrocytic Developmental Cycle of the Malaria Parasite.

artículo científico publicado en 2016

Ebselen has dehydroascorbate reductase and thioltransferase-like activities

artículo científico publicado en 2002

Effect of dynamic exclusion duration on spectral count based quantitative proteomics

artículo científico publicado en 2009

Endoplasmic reticulum stress-responsive transcription factor ATF6α directs recruitment of the Mediator of RNA polymerase II transcription and multiple histone acetyltransferase complexes

artículo científico publicado en 2012

Enriching quantitative proteomics with SI(N).

artículo científico publicado en 2010

Evaluation of clustering algorithms for protein complex and protein interaction network assembly.

artículo científico publicado en 2009

Evolutionarily conserved multisubunit RBL2/p130 and E2F4 protein complex represses human cell cycle-dependent genes in quiescence

artículo científico publicado en 2007

Examining the complexity of human RNA polymerase complexes using HaloTag technology coupled to label free quantitative proteomics.

artículo científico publicado en 2012

FBH1 promotes DNA double-strand breakage and apoptosis in response to DNA replication stress

artículo científico publicado en 2013

FBH1 promotes DNA double-strand breakage and apoptosis in response to DNA replication stress.

artículo científico publicado en 2013

FBXL2- and PTPL1-mediated degradation of p110-free p85β regulatory subunit controls the PI(3)K signalling cascade

artículo científico publicado en 2013

Gcn5 regulates the dissociation of SWI/SNF from chromatin by acetylation of Swi2/Snf2.

artículo científico publicado en 2010

Gene duplication and neofunctionalization: POLR3G and POLR3GL

artículo científico publicado en 2014

Generation and analysis of multidimensional protein identification technology datasets

artículo científico publicado en 2009

Genome comparison and proteomic characterization of Thermus thermophilus bacteriophages P23-45 and P74-26: siphoviruses with triplex-forming sequences and the longest known tails

artículo científico publicado en 2008

Genomic and proteomic analysis of phiEco32, a novel Escherichia coli bacteriophage

artículo científico publicado en 2008

Glutathione dependent reduction of alloxan to dialuric acid catalyzed by thioltransferase (glutaredoxin): a possible role for thioltransferase in alloxan toxicity

scientific article published on 01 January 1997

Glutathione: dehydroascorbate oxidoreductases

artículo científico publicado en 1995

HIV-1 and HIV-2 exhibit divergent interactions with HLTF and UNG2 DNA repair proteins

artículo científico publicado en 2016

Harnessing Ionic Selectivity in Acetyltransferase Chemoproteomic Probes

artículo científico publicado en 2020

Heterochromatin protein 1 (HP1) connects the FACT histone chaperone complex to the phosphorylated CTD of RNA polymerase II.

artículo científico publicado en 2010

Heterochromatin protein 1a stimulates histone H3 lysine 36 demethylation by the Drosophila KDM4A demethylase

artículo científico publicado en 2008

Highly reproducible label free quantitative proteomic analysis of RNA polymerase complexes

artículo científico publicado en 2010

Histone H3 lysine-to-methionine mutants as a paradigm to study chromatin signaling

artículo científico publicado en 2014

Histone H3 methylation by Set2 directs deacetylation of coding regions by Rpd3S to suppress spurious intragenic transcription

artículo científico publicado en 2005

Histone crosstalk between H2B monoubiquitination and H3 methylation mediated by COMPASS.

artículo científico publicado en 2007

Host cell factor and an uncharacterized SANT domain protein are stable components of ATAC, a novel dAda2A/dGcn5-containing histone acetyltransferase complex in Drosophila

artículo científico publicado en 2006

Human CCAAT/enhancer-binding protein β interacts with chromatin remodeling complexes of the imitation switch subfamily

artículo científico publicado en 2012

Human family with sequence similarity 60 member A (FAM60A) protein: a new subunit of the Sin3 deacetylase complex

artículo científico publicado en 2012

Human mediator subunit MED26 functions as a docking site for transcription elongation factors

artículo científico publicado en 2011

INTS3 controls the hSSB1-mediated DNA damage response

artículo científico publicado en 2009

Identification and Characterization of a Schizosaccharomyces pombe RNA Polymerase II Elongation Factor with Similarity to the Metazoan Transcription Factor ELL.

artículo científico publicado en 2006

Identification of FAM111A as an SV40 host range restriction and adenovirus helper factor

artículo científico publicado en 2012

Identification of stem cells from large cell populations with topological scoring

scientific article published on 14 September 2020

Identification of the dehydroascorbic acid reductase and thioltransferase (Glutaredoxin) activities of bovine erythrocyte glutathione peroxidase

scientific article published on 01 April 1999

Improving Proteomics Mass Accuracy by Dynamic Offline Lock Mass

artículo científico publicado en 2011

Improving label-free quantitative proteomics strategies by distributing shared peptides and stabilizing variance

artículo científico publicado en 2015

Lentiviral Vpr usurps Cul4-DDB1[VprBP] E3 ubiquitin ligase to modulate cell cycle

artículo científico publicado en 2007

Lentiviral Vpx accessory factor targets VprBP/DCAF1 substrate adaptor for cullin 4 E3 ubiquitin ligase to enable macrophage infection

artículo científico publicado en 2008

Linking H3K79 trimethylation to Wnt signaling through a novel Dot1-containing complex (DotCom)

artículo científico publicado en 2010

Loss of Drosophila Ataxin-7, a SAGA subunit, reduces H2B ubiquitination and leads to neural and retinal degeneration

artículo científico publicado en 2014

Loss of KLHL6 promotes diffuse large B-cell lymphoma growth and survival by stabilizing the mRNA decay factor roquin2

artículo científico publicado en 2018

Merkel cell polyomavirus activates LSD1-mediated blockade of non-canonical BAF to regulate transformation and tumorigenesis

artículo científico publicado en 2020

Mnd1/Hop2 facilitates Dmc1-dependent interhomolog crossover formation in meiosis of budding yeast

artículo científico publicado en 2006

Moco biosynthesis and the ATAC acetyltransferase engage translation initiation by inhibiting latent PKR activity

artículo científico publicado en 2015

Molecular regulation of H3K4 trimethylation by Wdr82, a component of human Set1/COMPASS

artículo científico publicado en 2008

Molecular regulation of histone H3 trimethylation by COMPASS and the regulation of gene expression

artículo científico publicado en 2005

Neuralized-like 1 (Neurl1) targeted to the plasma membrane by N-myristoylation regulates the Notch ligand Jagged1.

artículo científico

Nuclear cGMP-dependent kinase regulates gene expression via activity-dependent recruitment of a conserved histone deacetylase complex

artículo científico publicado en 2011

PARC and CUL7 form atypical cullin RING ligase complexes

artículo científico publicado en 2007

Parallel identification of new genes in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2002

Perturbation of BRMS1 interactome reveals pathways that impact metastasis

artículo científico publicado en 2021

Poly(ADP-ribosyl)ation directs recruitment and activation of an ATP-dependent chromatin remodeler

artículo científico publicado en 2009

Polycomb repressive complex 2-dependent and -independent functions of Jarid2 in transcriptional regulation in Drosophila

artículo científico publicado en 2012

Polyhydroxybenzoates inhibit ascorbic acid activation of mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase: implications for glucose metabolism and insulin secretion

artículo científico publicado en 2000

Post-transcription initiation function of the ubiquitous SAGA complex in tissue-specific gene activation

artículo científico publicado en 2011

Principles and applications of multidimensional protein identification technology

artículo científico publicado en 2004

Probabilistic assembly of human protein interaction networks from label-free quantitative proteomics

artículo científico publicado en 2008

Proteasome recruitment and activation of the Uch37 deubiquitinating enzyme by Adrm1.

artículo científico publicado en 2006

Protein pathway and complex clustering of correlated mRNA and protein expression analyses in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2003

Proteins interacting with cloning scars: a source of false positive protein-protein interactions

artículo científico publicado en 2015

Proteomic analysis of Sox2-associated proteins during early stages of mouse embryonic stem cell differentiation identifies Sox21 as a novel regulator of stem cell fate.

artículo científico publicado en 2010

Proteomic and Genomic Analyses of the Rvb1 and Rvb2 Interaction Network upon Deletion of R2TP Complex Components

artículo científico publicado en 2016

Proteomic survey of metabolic pathways in rice

artículo científico publicado en 2002

Proteomics reveals a physical and functional link between hepatocyte nuclear factor 4alpha and transcription factor IID.

artículo científico publicado en 2009

Purification and characterization of a glutathione dependent dehydroascorbate reductase from human erythrocytes

artículo científico publicado en 1996

Purification of a human SRCAP complex that remodels chromatin by incorporating the histone variant H2A.Z into nucleosomes

artículo científico publicado en 2006

Quantitative proteomic analysis of distinct mammalian Mediator complexes using normalized spectral abundance factors

artículo científico publicado en 2006

Quantitative proteomics

artículo científico publicado en 2013

Quantitative proteomics demonstrates that the RNA polymerase II subunits Rpb4 and Rpb7 dissociate during transcriptional elongation

artículo científico publicado en 2013

Quantitative shotgun proteomics using a protease with broad specificity and normalized spectral abundance factors

artículo científico publicado en 2007

RUNX proteins desensitize multiple myeloma to lenalidomide via protecting IKZFs from degradation

scientific article published on 13 February 2019

Refinements to label free proteome quantitation: how to deal with peptides shared by multiple proteins

artículo científico publicado en 2010

Regulation of H3K4 trimethylation via Cps40 (Spp1) of COMPASS is monoubiquitination independent: implication for a Phe/Tyr switch by the catalytic domain of Set1.

artículo científico publicado en 2009

Regulation of the CRL4(Cdt2) ubiquitin ligase and cell-cycle exit by the SCF(Fbxo11) ubiquitin ligase

artículo científico publicado en 2013

Reproducibility of quantitative proteomic analyses of complex biological mixtures by multidimensional protein identification technology

artículo científico publicado en 2003

Reshaping the Chromatin and Epigenetic Landscapes with Quantitative Mass Spectrometry

artículo científico publicado en 2016

Role for human mediator subunit MED25 in recruitment of mediator to promoters by endoplasmic reticulum stress-responsive transcription factor ATF6α.

artículo científico publicado en 2013

Rtr1 is a CTD phosphatase that regulates RNA polymerase II during the transition from serine 5 to serine 2 phosphorylation

artículo científico publicado en 2009

SCF(Cyclin F) controls centrosome homeostasis and mitotic fidelity through CP110 degradation

artículo científico publicado en 2010

STRIPAK directs PP2A activity toward MAP4K4 to promote oncogenic transformation of human cells

scientific article published on 08 January 2020

Sample preparation and in-solution protease digestion of proteins for chromatography-based proteomic analysis

artículo científico publicado en 2008

Scm3 is essential to recruit the histone h3 variant cse4 to centromeres and to maintain a functional kinetochore

artículo científico publicado en 2007

Serine and SAM Responsive Complex SESAME Regulates Histone Modification Crosstalk by Sensing Cellular Metabolism.

artículo científico publicado en 2015

Shaggy/glycogen synthase kinase 3β and phosphorylation of Sarah/regulator of calcineurin are essential for completion of Drosophila female meiosis

artículo científico publicado en 2012

Shotgun identification of protein modifications from protein complexes and lens tissue

artículo científico publicado en 2002

Soft landing for protein chips ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 2003

Ssu72 phosphatase-dependent erasure of phospho-Ser7 marks on the RNA polymerase II C-terminal domain is essential for viability and transcription termination.

artículo científico publicado en 2012

Stable incorporation of sequence specific repressors Ash1 and Ume6 into the Rpd3L complex

artículo científico publicado en 2005

Statistical Analysis of Membrane Proteome Expression Changes inSaccharomycescerevisiae

article

Statistical similarities between transcriptomics and quantitative shotgun proteomics data

artículo científico publicado en 2007

Structural analyses of the chromatin remodelling enzymes INO80-C and SWR-C

artículo científico publicado en 2015

Structural basis of the interaction between SETD2 methyltransferase and hnRNP L paralogs for governing co-transcriptional splicing

artículo científico publicado en 2021

Structural changes in TAF4b-TFIID correlate with promoter selectivity

artículo científico publicado en 2008

Suberoylanilide hydroxamic acid (SAHA)-induced dynamics of a human histone deacetylase protein interaction network

artículo científico publicado en 2014

Subunit composition and substrate specificity of a MOF-containing histone acetyltransferase distinct from the male-specific lethal (MSL) complex

artículo científico publicado en 2010

Subunit organization of the human INO80 chromatin remodeling complex: an evolutionarily conserved core complex catalyzes ATP-dependent nucleosome remodeling

artículo científico publicado en 2011

Swi/Snf dynamics on stress-responsive genes is governed by competitive bromodomain interactions

artículo científico publicado en 2014

TNIP2 is a Hub Protein in the NF-κB Network with Both Protein and RNA Mediated Interactions.

artículo científico

TRIM29 regulates the assembly of DNA repair proteins into damaged chromatin.

artículo científico publicado en 2015

Temporal regulation of gene expression of the Thermus thermophilus bacteriophage P23-45.

artículo científico publicado en 2010

The ATAC acetyltransferase complex coordinates MAP kinases to regulate JNK target genes

artículo científico publicado en 2010

The COMPASS family of H3K4 methylases in Drosophila

artículo científico publicado en 2011

The Enok acetyltransferase complex interacts with Elg1 and negatively regulates PCNA unloading to promote the G1/S transition

artículo científico publicado en 2016

The H-index of 'an approach to correlate tandem mass spectral data of peptides with amino acid sequences in a protein database'.

artículo científico publicado en 2015

The HIR corepressor complex binds to nucleosomes generating a distinct protein/DNA complex resistant to remodeling by SWI/SNF.

artículo científico publicado en 2005

The Integrator complex controls the termination of transcription at diverse classes of gene targets

artículo científico publicado en 2015

The SOX2-interactome in brain cancer cells identifies the requirement of MSI2 and USP9X for the growth of brain tumor cells

artículo científico publicado en 2013

The Spliceosomal Protein SF3B5 is a Novel Component of Drosophila SAGA that Functions in Gene Expression Independent of Splicing

artículo científico publicado en 2016

The TDH-GCN5L1-Fbxo15-KBP axis limits mitochondrial biogenesis in mouse embryonic stem cells

artículo científico publicado en 2017

The ULK1-FBXW5-SEC23B nexus controls autophagy

artículo científico publicado en 2018

The WHHERE coactivator complex is required for retinoic acid-dependent regulation of embryonic symmetry.

artículo científico publicado en 2017

The catalytic mechanism of the glutathione-dependent dehydroascorbate reductase activity of thioltransferase (glutaredoxin)

artículo científico publicado en 1999

The chromatin bound proteome of the human malaria parasite.

artículo científico publicado en 2020

The continuing evolution of shotgun proteomics.

artículo científico publicado en 2005

The deubiquitylation activity of Ubp8 is dependent upon Sgf11 and its association with the SAGA complex

artículo científico publicado en 2005

The essential gene wda encodes a WD40 repeat subunit of Drosophila SAGA required for histone H3 acetylation

artículo científico

The human cytoplasmic dynein interactome reveals novel activators of motility.

artículo científico

The inhibition of polo kinase by matrimony maintains G2 arrest in the meiotic cell cycle

artículo científico publicado en 2007

The little elongation complex functions at initiation and elongation phases of snRNA gene transcription

artículo científico publicado en 2013

The little elongation complex regulates small nuclear RNA transcription

artículo científico publicado en 2011

The mammalian Mediator complex

artículo científico publicado en 2005

The mammalian YL1 protein is a shared subunit of the TRRAP/TIP60 histone acetyltransferase and SRCAP complexes

artículo científico publicado en 2005

The role of Mediator and Little Elongation Complex in transcription termination

artículo científico publicado en 2020

The super elongation complex family of RNA polymerase II elongation factors: gene target specificity and transcriptional output

artículo científico publicado en 2012

The tumour antigen PRAME is a subunit of a Cul2 ubiquitin ligase and associates with active NFY promoters

artículo científico publicado en 2011

There is no human interactome.

artículo científico publicado en 2016

Thermus thermophilus bacteriophage phiYS40 genome and proteomic characterization of virions

artículo científico publicado en 2006

Topological scoring of protein interaction networks

artículo científico publicado en 2019

Unraveling the dynamics of protein interactions with quantitative mass spectrometry.

scientific article published on 26 March 2011

Unraveling the ubiquitome of the human malaria parasite

artículo científico publicado en 2011

Vpx relieves inhibition of HIV-1 infection of macrophages mediated by the SAMHD1 protein

artículo científico publicado en 2011

WDR76 Co-Localizes with Heterochromatin Related Proteins and Rapidly Responds to DNA Damage

artículo científico publicado en 2016

YY1 functions with INO80 to activate transcription

artículo científico publicado en 2007

Yeast Nuak1 phosphorylates histone H3 threonine 11 in low glucose stress by the cooperation of AMPK and CK2 signaling

artículo científico publicado en 2020

Zic2 is an enhancer-binding factor required for embryonic stem cell specification

artículo científico publicado en 2015

Dominio Público Uruguay está sostenido por:

Acerca de Dominio Público Uruguay

Ayuda