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Lista de obras de Jeffrey D. Jensen

A Balance between Inhibitor Binding and Substrate Processing Confers Influenza Drug Resistance

artículo científico publicado en 2015

A bayesian MCMC approach to assess the complete distribution of fitness effects of new mutations: uncovering the potential for adaptive walks in challenging environments

artículo científico publicado en 2014

A chromosomal inversion contributes to divergence in multiple traits between deer mouse ecotypes

artículo científico publicado en 2022

A critical assessment of storytelling: gene ontology categories and the importance of validating genomic scans.

artículo científico

A statistical guide to the design of deep mutational scanning experiments

artículo científico publicado en 2016

A systematic survey of an intragenic epistatic landscape.

artículo científico publicado en 2014

Accelerated adaptive evolution on a newly formed X chromosome

artículo científico publicado en 2009

Adaptive evolution of multiple traits through multiple mutations at a single gene

scientific article published on March 2013

An Approximate Markov Model for the Wright-Fisher Diffusion and Its Application to Time Series Data.

artículo científico publicado en 2016

An approximate bayesian estimator suggests strong, recurrent selective sweeps in Drosophila

artículo científico publicado en 2008

An experimental evaluation of drug-induced mutational meltdown as an antiviral treatment strategy

artículo científico publicado en 2016

Antiviral drug resistance as an adaptive process

artículo científico publicado en 2016

Approaches for identifying targets of positive selection.

artículo científico publicado en 2007

CRISPR-Cas9-mediated saturated mutagenesis screen predicts clinical drug resistance with improved accuracy

artículo científico publicado en 2017

Characterizing human cytomegalovirus reinfection in congenitally infected infants: an evolutionary perspective

artículo científico publicado en 2016

Characterizing recurrent positive selection at fast-evolving genes in Drosophila miranda and Drosophila pseudoobscura

artículo científico publicado en 2010

Characterizing the Influence of Effective Population Size on the Rate of Adaptation: Gillespie’s Darwin Domain ⬇️

artículo científico publicado el 24 de junio de 2011

Coalescent Processes with Skewed Offspring Distributions and Nonequilibrium Demography

artículo científico publicado en 2017

Complete resequencing of 40 genomes reveals domestication events and genes in silkworm (Bombyx).

artículo científico publicado en 2009

Controlling the false-positive rate in multilocus genome scans for selection

artículo científico publicado en 2007

Detecting and Quantifying Changing Selection Intensities from Time-Sampled Polymorphism Data

artículo científico publicado en 2016

Distinguishing between selective sweeps and demography using DNA polymorphism data

artículo científico publicado en 2005

Distinguishing neutral from deleterious mutations in growing populations.

scientific article published on 31 January 2014

Evaluating the ability of the pairwise joint site frequency spectrum to co-estimate selection and demography

artículo científico publicado en 2015

Evaluating the contributions of purifying selection and progeny-skew in dictating within-host Mycobacterium tuberculosis evolution

scientific article published on 31 March 2020

Evidence of adaptation from ancestral variation in young populations of beach mice

artículo científico publicado en 2012

Evolution of the influenza A virus genome during development of oseltamivir resistance in vitro

artículo científico publicado en 2013

Experimental adaptation of human echovirus 11 to ultraviolet radiation leads to resistance to disinfection and ribavirin

artículo científico publicado en 2017

Experimental illumination of a fitness landscape

artículo científico publicado en 2011

Extensive genome-wide variability of human cytomegalovirus in congenitally infected infants.

artículo científico publicado en 2011

Genomic variation and its impact on gene expression in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2012

Human cytomegalovirus intrahost evolution-a new avenue for understanding and controlling herpesvirus infections

artículo científico publicado en 2014

Human-specific histone methylation signatures at transcription start sites in prefrontal neurons

artículo científico publicado en 2012

Inferences of demography and selection in an African population of Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2012

Inferring selection in partially sequenced regions.

artículo científico publicado en 2007

Inferring the age of a fixed beneficial allele

artículo científico publicado en 2015

Inferring the evolutionary history of primate microRNA binding sites: overcoming motif counting biases

artículo científico publicado en 2014

Influenza virus drug resistance: a time-sampled population genetics perspective

artículo científico publicado en 2014

Limits and patterns of cytomegalovirus genomic diversity in humans

artículo científico publicado en 2015

Linking a mutation to survival in wild mice

artículo científico publicado en 2019

Loci associated with skin pigmentation identified in African populations.

artículo científico publicado en 2017

Meeting review. Uncovering the genetic basis of adaptive change: on the intersection of landscape genomics and theoretical population genetics

artículo científico publicado en 2013

Molecular Basis for Differential Patterns of Drug Resistance in Influenza N1 and N2 Neuraminidase.

artículo científico publicado en 2016

On characterizing adaptive events unique to modern humans.

artículo científico publicado en 2011

On detecting selective sweeps using single genomes

artículo científico publicado en 2011

On reconciling single and recurrent hitchhiking models.

artículo científico publicado en 2009

On the (un)predictability of a large intragenic fitness landscape

artículo científico publicado en 2016

On the Analysis of Intrahost and Interhost Viral Populations: Human Cytomegalovirus as a Case Study of Pitfalls and Expectations.

artículo científico publicado en 2016

On the importance of skewed offspring distributions and background selection in virus population genetics

artículo científico publicado en 2016

On the origin and spread of an adaptive allele in deer mice

artículo científico publicado en 2009

On the prospect of identifying adaptive loci in recently bottlenecked populations

artículo científico publicado en 2014

On the relative roles of background selection and genetic hitchhiking in shaping human cytomegalovirus genetic diversity

artículo científico publicado en 2015

On the unfounded enthusiasm for soft selective sweeps

artículo científico publicado en 2014

On the unfounded enthusiasm for soft selective sweeps II: Examining recent evidence from humans, flies, and viruses

Patterns of sequence variability and divergence at the diminutive gene region of Drosophila melanogaster: complex patterns suggest an ancestral selective sweep

artículo científico publicado en 2007

Phylogenetic incongruence in the Drosophila melanogaster species group

artículo científico publicado en 2006

PopPlanner: visually constructing demographic models for simulation

artículo científico publicado en 2015

Population genetic inference from genomic sequence variation

artículo científico publicado en 2010

Positive Selection Drives Preferred Segment Combinations during Influenza Virus Reassortment.

artículo científico publicado en 2015

Progress and prospects in mapping recent selection in the genome.

artículo científico publicado en 2007

Quantifying polymorphism and divergence from epigenetic data: a framework for inferring the action of selection.

artículo científico publicado en 2015

Rapid intrahost evolution of human cytomegalovirus is shaped by demography and positive selection.

artículo científico publicado en 2013

Recent Progress in Polymorphism-Based Population Genetic Inference ⬇️

artículo científico publicado el 12 de enero de 2012

Recurrent and recent selective sweeps in the piRNA pathway.

artículo científico publicado en 2013

Resequencing 50 accessions of cultivated and wild rice yields markers for identifying agronomically important genes

article

Resistance of Echovirus 11 to ClO2 Is Associated with Enhanced Host Receptor Use, Altered Entry Routes, and High Fitness

artículo científico publicado en 2017

Searching for footprints of positive selection in whole-genome SNP data from nonequilibrium populations

artículo científico publicado en 2010

Shifting fitness landscapes in response to altered environments.

artículo científico publicado en 2013

Similar levels of X-linked and autosomal nucleotide variation in African and non-African populations of Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2007

Structural Determination of the Broadly Reactive Anti-IGHV1-69 Anti-idiotypic Antibody G6 and Its Idiotope

artículo científico publicado en 2017

The Combined Effect of Oseltamivir and Favipiravir on Influenza A Virus Evolution.

artículo científico publicado en 2017

The Evolutionary History of Nebraska Deer Mice: Local Adaptation in the Face of Strong Gene Flow.

artículo científico publicado en 2018

The Genomic Signature of Population Reconnection Following Isolation: From Theory to HIV.

artículo científico publicado en 2015

The Impact of Linked Selection in Chimpanzees: A Comparative Study

artículo científico publicado en 2016

The SIB Swiss Institute of Bioinformatics' resources: focus on curated databases

artículo científico publicado en 2016

The consequences of not accounting for background selection in demographic inference

artículo científico publicado en 2015

The evolution of gene expression and binding specificity of the largest transcription factor family in primates

artículo científico publicado en 2015

The fitness landscape of the codon space across environments

The impact of equilibrium assumptions on tests of selection

artículo científico publicado en 2013

The impact of frequently neglected model violations on bacterial recombination rate estimation: a case study in Mycobacterium canettii and Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado en 2022

The past, present and future of genomic scans for selection

artículo científico publicado en 2016

The population genomics of rapid adaptation: disentangling signatures of selection and demography in white sands lizards

artículo científico publicado en 2015

The population genomics of within-host Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado en 2020

Thinking too positive? Revisiting current methods of population genetic selection inference

artículo científico publicado en 2014

To pool, or not to pool?

artículo científico publicado en 2010

Two ancient human genomes reveal Polynesian ancestry among the indigenous Botocudos of Brazil

artículo científico publicado en 2014

WFABC: a Wright-Fisher ABC-based approach for inferring effective population sizes and selection coefficients from time-sampled data

artículo científico publicado en 2014

Worldwide Population Structure, Long-Term Demography, and Local Adaptation of Helicobacter pylori.

artículo científico publicado en 2015

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