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Lista de obras de Peter B Becker

A CAF-1-PCNA-mediated chromatin assembly pathway triggered by sensing DNA damage

artículo científico publicado en 2000

A Defined In Vitro System to Study ATP-Dependent Remodeling of Short Chromatin Fibers

scientific article published on 01 January 2012

A Drosophila cell-free system that senses DNA breaks and triggers phosphorylation signalling

artículo científico publicado en 2019

A critical epitope for substrate recognition by the nucleosome remodeling ATPase ISWI.

artículo científico publicado en 2002

A nucleosome sliding assay for chromatin remodeling factors

artículo científico publicado en 2004

A role for tuned levels of nucleosome remodeler subunit ACF1 during Drosophila oogenesis

artículo científico publicado en 2016

A solid-phase approach for the analysis of reconstituted chromatin

artículo científico publicado en 1999

ACF catalyses chromatosome movements in chromatin fibres

artículo científico publicado en 2007

ACF1 improves the effectiveness of nucleosome mobilization by ISWI through PHD-histone contacts.

artículo científico publicado en 2004

ATP-dependent chromatosome remodeling.

artículo científico publicado en 2008

ATP-dependent nucleosome disruption at a heat-shock promoter mediated by binding of GAGA transcription factor.

artículo científico publicado en 1994

ATP-dependent nucleosome remodeling

artículo científico publicado en 2002

ATP-dependent nucleosome remodelling: factors and functions

artículo científico publicado en 2004

ATP-dependent roX RNA remodeling by the helicase maleless enables specific association of MSL proteins

artículo científico publicado en 2013

Acetylation increases access of remodelling complexes to their nucleosome targets to enhance initiation of V(D)J recombination.

artículo científico publicado en 2007

Acf1, the largest subunit of CHRAC, regulates ISWI-induced nucleosome remodelling

artículo científico publicado en 2001

Activation of transcription through histone H4 acetylation by MOF, an acetyltransferase essential for dosage compensation in Drosophila

artículo científico publicado en 2000

Active promoters and insulators are marked by the centrosomal protein 190.

artículo científico publicado en 2009

Active promoters give rise to false positive 'Phantom Peaks' in ChIP-seq experiments.

artículo científico publicado en 2015

An improved protocol for genomic sequencing and footprinting by ligation-mediated PCR.

artículo científico publicado en 1993

Analysis of CpG methylation and genomic footprinting at the tyrosine aminotransferase gene: DNA methylation alone is not sufficient to prevent protein binding in vivo

artículo científico publicado en 1991

Analysis of activator-dependent transcription reinitiation in vitro

artículo científico publicado en 2003

Analysis of modulators of chromatin structure in Drosophila

artículo científico publicado en 1999

Analysis of reconstituted chromatin using a solid-phase approach

artículo científico publicado en 2009

Assembly of MMTV promoter minichromosomes with positioned nucleosomes precludes NF1 access but not restriction enzyme cleavage.

artículo científico publicado en 1998

Association and spreading of the Drosophila dosage compensation complex from a discrete roX1 chromatin entry site.

artículo científico publicado en 2001

Beads on a string-nucleosome array arrangements and folding of the chromatin fiber

artículo científico publicado en 2020

Beads-on-a-string on a bead: reconstitution and analysis of chromatin on a solid support

artículo científico publicado en 2015

Biochemical analysis of chromatin structure and function using Drosophila embryo extracts

artículo científico publicado en 1997

CHRAC/ACF contribute to the repressive ground state of chromatin

artículo científico publicado en 2018

CMV promoter mutants with a reduced propensity to productivity loss in CHO cells

artículo científico publicado en 2015

Cell-free genomics reveal intrinsic, cooperative and competitive determinants of chromatin interactions

artículo científico publicado en 2021

Cell-free system for assembly of transcriptionally repressed chromatin from Drosophila embryos.

artículo científico publicado en 1992

Chromatin assembly extracts from Drosophila embryos

artículo científico publicado en 1994

Chromatin remodeling by GAGA factor and heat shock factor at the hypersensitive Drosophila hsp26 promoter in vitro.

artículo científico publicado en 1995

Chromatin-remodeling factors: machines that regulate?

artículo científico publicado en 1998

Chromatin-remodelling factor CHRAC contains the ATPases ISWI and topoisomerase II.

artículo científico publicado en 1997

Chromodomains are protein-RNA interaction modules

artículo científico publicado en 2000

Chromosome topology guides the Drosophila Dosage Compensation Complex for target gene activation.

artículo científico publicado en 2017

Chromosome-wide gene-specific targeting of the Drosophila dosage compensation complex

artículo científico publicado en 2006

Combinatorial Histone Acetylation Patterns Are Generated by Motif-Specific Reactions

artículo científico publicado en 2016

Combined use of RNAi and quantitative proteomics to study gene function in Drosophila

artículo científico publicado en 2008

Comment on “ Drosophila Dosage Compensation Involves Enhanced Pol II Recruitment to Male X-Linked Promoters” ⬇️

artículo científico publicado el 19 de abril de 2013

Computational study of remodeling in a nucleosomal array

artículo científico publicado en 2015

Critical role for the histone H4 N terminus in nucleosome remodeling by ISWI.

artículo científico publicado en 2001

Crystal structure and functional analysis of a nucleosome recognition module of the remodeling factor ISWI

artículo científico publicado en 2003

Cumulative contributions of weak DNA determinants to targeting the Drosophila dosage compensation complex.

artículo científico publicado en 2007

DNA sequence and the organization of chromosomal domains.

artículo científico publicado en 2008

Determination of unknown genomic sequences without cloning

artículo científico publicado en 2003

Determination of unknown genomic sequences without cloning

artículo científico publicado en 1996

Developmental role for ACF1-containing nucleosome remodellers in chromatin organisation

artículo científico publicado en 2010

Different chromatin interfaces of the Drosophila dosage compensation complex revealed by high-shear ChIP-seq

artículo científico publicado en 2012

Direct dideoxy sequencing of genomic DNA by ligation-mediated PCR.

artículo científico publicado en 1994

Dosage compensation and the global re-balancing of aneuploid genomes.

artículo científico publicado en 2010

Dosage compensation in flies: mechanism, models, mystery.

artículo científico publicado en 2005

Dosage compensation: the beginning and end of generalization.

artículo científico publicado en 2007

Drosophila ISWI regulates the association of histone H1 with interphase chromosomes in vivo.

scientific article published on 20 April 2009

Drosophila SWR1 and NuA4 complexes are defined by DOMINO isoforms

artículo científico publicado en 2020

Drosophila chromatin and transcription

artículo científico publicado en 1995

Dual regulation of the Drosophila hsp26 promoter in vitro.

artículo científico publicado en 1995

Electrostatic mechanism of nucleosome spacing

artículo científico publicado en 1995

Energy-dependent chromatin accessibility and nucleosome mobility in a cell-free system

artículo científico publicado en 1995

Factor cooperation for chromosome discrimination in Drosophila

Fluorescence anisotropy assays for analysis of ISWI-DNA and ISWI-nucleosome interactions.

artículo científico publicado en 2004

Footprinting of DNA-binding proteins in intact cells.

artículo científico publicado en 1993

Form and function of dosage-compensated chromosomes--a chicken-and-egg relationship.

scientific article published on August 2010

Functional Delineation of Three Groups of the ATP-dependent Family of Chromatin Remodeling Enzymes

scientific article published in Journal of Biological Chemistry

Functional integration of the histone acetyltransferase MOF into the dosage compensation complex

artículo científico publicado en 2004

Gene regulation by histone H1: new links to DNA methylation.

artículo científico publicado en 2005

Gene regulation: a finger on the mark

artículo científico publicado en 2006

Genome-wide measurement of local nucleosome array regularity and spacing by nanopore sequencing

scholarly article by Sandro Baldi published in August 2018

Genomic footprinting of Drosophila embryo nuclei by linker tag selection LM-PCR.

artículo científico

Genomic footprinting reveals cell type-specific DNA binding of ubiquitous factors

scientific article published on 01 November 1987

Global analysis of the relationship between JIL-1 kinase and transcription.

artículo científico publicado en 2011

Global and specific responses of the histone acetylome to systematic perturbation

artículo científico publicado en 2015

HMG-D and Histone H1 Interplay during Chromatin Assembly and Early Embryogenesis

artículo científico publicado en 2001

Heat shock factor increases the reinitiation rate from potentiated chromatin templates.

artículo científico publicado en 1998

Heat shock-regulated transcription in vitro from a reconstituted chromatin template

artículo científico publicado en 1991

High levels of histone H3 acetylation at the CMV promoter are predictive of stable expression in Chinese hamster ovary cells

artículo científico publicado en 2016

Histone acetylation facilitates RNA polymerase II transcription of the Drosophila hsp26 gene in chromatin.

artículo científico publicado en 1998

Histone acetylation: a switch between repressive and permissive chromatin. Second in review series on chromatin dynamics.

artículo científico publicado en 2002

HuCHRAC, a human ISWI chromatin remodelling complex contains hACF1 and two novel histone-fold proteins

artículo científico publicado en 2000

ISWI Induces Nucleosome Sliding on Nicked DNA ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2001

ISWI Is an ATP-Dependent Nucleosome Remodeling Factor

article

ISWI remodelling of physiological chromatin fibres acetylated at lysine 16 of histone H4.

artículo científico publicado en 2014

In vitro chromatin remodelling by chromatin accessibility complex (CHRAC) at the SV40 origin of DNA replication

artículo científico publicado en 1998

In vivo protein-DNA interactions in a glucocorticoid response element require the presence of the hormone

artículo científico publicado en 1986

Initiation and bidirectional propagation of chromatin assembly from a target site for nucleotide excision repair

artículo científico publicado en 1997

JASPer controls interphase histone H3S10 phosphorylation by chromosomal kinase JIL-1 in Drosophila

scientific article published on 25 November 2019

Life span extension by targeting a link between metabolism and histone acetylation in Drosophila

artículo científico publicado en 2016

Lifting a chromosome: dosage compensation in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2004

Loss of nucleosome remodelers CHRAC/ACF does not sensitize early Drosophila embryos to X-rays

artículo científico publicado en 2020

MSL2 combines sensor and effector functions in homeostatic control of the Drosophila dosage compensation machinery

artículo científico publicado en 2012

Modifications of the histone N-terminal domains. Evidence for an "epigenetic code"?

artículo científico publicado en 2001

Modulation of ISWI function by site-specific histone acetylation

artículo científico publicado en 2002

Molecular cloning and expression of a hexameric Drosophila heat shock factor subject to negative regulation

artículo científico publicado en 1990

Nonradioactive, solid-phase DNase I footprints analyzed on an A.L.F. DNA Sequencer

artículo científico publicado en 1994

Nucleosome binding by the bromodomain and PHD finger of the transcriptional cofactor p300.

artículo científico publicado en 2004

Nucleosome dynamics and epigenetic stability.

artículo científico publicado en 2010

Nucleosome mobilization and positioning by ISWI-containing chromatin-remodeling factors

artículo científico publicado en 2001

Nucleosome movement by CHRAC and ISWI without disruption or trans-displacement of the histone octamer.

artículo científico publicado en 1999

Nucleosome remodeler SNF2L suppresses cell proliferation and migration and attenuates Wnt signaling

artículo científico publicado en 2012

Nucleosome remodelers on track

artículo científico publicado en 2005

Nucleosome remodeling and epigenetics.

artículo científico publicado en 2013

Nucleosome remodeling: one mechanism, many phenomena?

artículo científico publicado en 2004

Nucleosome sliding mechanisms: new twists in a looped history.

artículo científico

Nucleosome sliding: facts and fiction

artículo científico publicado en 2002

Phosphorylation of SU(VAR)3-9 by the chromosomal kinase JIL-1.

artículo científico publicado en 2010

Physical and functional association of SU(VAR)3-9 and HDAC1 in Drosophila

artículo científico publicado en 2001

PionX sites mark the X chromosome for dosage compensation.

artículo científico publicado en 2016

Preparation of Chromatin Assembly Extracts from Preblastoderm Drosophila Embryos

artículo científico publicado en 2009

Preparation of chromatin assembly extracts from preblastoderm Drosophila embryos.

artículo científico publicado en 1999

Probing the conformation of the ISWI ATPase domain with genetically encoded photoreactive crosslinkers and mass spectrometry

artículo científico publicado en 2011

Progressive dosage compensation during Drosophila embryogenesis is reflected by gene arrangement

artículo científico publicado en 2019

Prothymosin alpha modulates the interaction of histone H1 with chromatin

artículo científico publicado en 1998

RNA polymerase I transcription on nucleosomal templates: the transcription termination factor TTF-I induces chromatin remodeling and relieves transcriptional repression

artículo científico publicado en 1997

Ran binds to chromatin by two distinct mechanisms.

artículo científico publicado en 2002

Rapid purification of recombinant histones

artículo científico publicado en 2014

Reconstitution and analysis of hyperacetylated chromatin.

artículo científico publicado en 1999

Reconstitution of human beta-globin locus control region hypersensitive sites in the absence of chromatin assembly.

artículo científico publicado en 2001

Reconstitution of hyperacetylated, DNase I-sensitive chromatin characterized by high conformational flexibility of nucleosomal DNA.

artículo científico publicado en 1998

Recruitment of the nucleolar remodeling complex NoRC establishes ribosomal DNA silencing in chromatin

artículo científico publicado en 2004

Regulation of higher-order chromatin structures by nucleosome-remodelling factors.

artículo científico publicado en 2006

Role for hACF1 in the G2/M damage checkpoint

artículo científico publicado en 2011

Roles of long, non-coding RNA in chromosome-wide transcription regulation: lessons from two dosage compensation systems.

artículo científico

Sequence-specific targeting of Drosophila roX genes by the MSL dosage compensation complex

artículo científico publicado en 2003

Site-specific acetylation of ISWI by GCN5.

artículo científico publicado en 2007

Soft skills turned into hard facts: nucleosome remodelling at developmental switches.

artículo científico publicado en 2010

Solid phase DNase I footprinting: quick and versatile

artículo científico publicado en 1994

Solid phase technology improves coupled gel shift/footprinting analysis

artículo científico publicado en 1997

Splice variants of the SWR1-type nucleosome remodeling factor Domino have distinct functions during Drosophila melanogaster oogenesis

artículo científico publicado en 2016

Stable chromosomal association of MSL2 defines a dosage-compensated nuclear compartment

artículo científico publicado en 2005

Structural and functional analysis of chromatin assembled from defined histones

artículo científico publicado en 1998

Structural basis of X chromosome DNA recognition by the MSL2 CXC domain during Drosophila dosage compensation.

artículo científico publicado en 2014

Structure of the RNA Helicase MLE Reveals the Molecular Mechanisms for Uridine Specificity and RNA-ATP Coupling

artículo científico publicado en 2015

Structure, dynamics and roX2-lncRNA binding of tandem double-stranded RNA binding domains dsRBD1,2 of Drosophila helicase Maleless

scientific article published on 01 May 2019

Structure-function analysis of the RNA helicase maleless.

artículo científico publicado en 2007

TTF-I determines the chromatin architecture of the active rDNA promoter

artículo científico publicado en 1998

Targeting determinants of dosage compensation in Drosophila

artículo científico publicado en 2006

The ATPase domain of ISWI is an autonomous nucleosome remodeling machine

artículo científico publicado en 2012

The DNA binding CXC domain of MSL2 is required for faithful targeting the Dosage Compensation Complex to the X chromosome

artículo científico publicado en 2010

The DNA chaperone HMGB1 facilitates ACF/CHRAC-dependent nucleosome sliding

artículo científico publicado en 2002

The Drosophila MSL complex activates the transcription of target genes.

artículo científico publicado en 2005

The Drosophila polycomb protein interacts with nucleosomal core particles In vitro via its repression domain

artículo científico publicado en 1999

The MOF-containing NSL complex associates globally with housekeeping genes, but activates only a defined subset

artículo científico publicado en 2011

The MRG domain mediates the functional integration of MSL3 into the dosage compensation complex.

artículo científico publicado en 2005

The activation potential of MOF is constrained for dosage compensation

artículo científico publicado en 2010

The architecture of the heat-inducible Drosophila hsp27 promoter in nuclei

artículo científico publicado en 1996

The bifunctional protein DCoH modulates interactions of the homeodomain transcription factor HNF1 with nucleic acids 1 1Edited by M. Yaniv

The chromatin accessibility complex: chromatin dynamics through nucleosome sliding.

artículo científico publicado en 2004

The chromosomal high-affinity binding sites for the Drosophila dosage compensation complex.

artículo científico publicado en 2008

The dMi-2 chromodomains are DNA binding modules important for ATP-dependent nucleosome mobilization

artículo científico publicado en 2002

The dosage compensation complex shapes the conformation of the X chromosome in Drosophila

artículo científico publicado en 2009

The effect of nucleosome phasing sequences and DNA topology on nucleosome spacing.

artículo científico publicado en 1996

The establishment of active promoters in chromatin

artículo científico publicado en 1994

The glutamine-rich domain of the Drosophila GAGA factor is necessary for amyloid fibre formation in vitro, but not for chromatin remodelling

artículo científico publicado en 1999

The histone H4 acetyltransferase MOF uses a C2HC zinc finger for substrate recognition

artículo científico publicado en 2001

The histone fold subunits of Drosophila CHRAC facilitate nucleosome sliding through dynamic DNA interactions.

artículo científico publicado en 2005

The histone-fold protein CHRAC14 influences chromatin composition in response to DNA damage

artículo científico publicado en 2014

The many colours of chromodomains.

artículo científico publicado en 2004

The novel transcription factor e(y)2 interacts with TAF(II)40 and potentiates transcription activation on chromatin templates

artículo científico publicado en 2001

The variant histone H2A.V of Drosophila--three roles, two guises.

artículo científico publicado en 2013

Tissue-specific DNaseI hypersensitive sites in the 5'-flanking sequences of the tryptophan oxygenase and the tyrosine aminotransferase genes.

artículo científico publicado en 1984

Tramtrack69 interacts with the dMi-2 subunit of the Drosophila NuRD chromatin remodelling complex

artículo científico publicado en 2001

Transcription factor-mediated chromatin remodelling: mechanisms and models.

artículo científico publicado en 1995

Transcription modulation chromosome-wide: universal features and principles of dosage compensation in worms and flies.

artículo científico publicado en 2011

Transcriptional repression by nucleosomes but not H1 in reconstituted preblastoderm Drosophila chromatin

artículo científico publicado en 1994

Translational control of dosage compensation in Drosophila by Sex-lethal: cooperative silencing via the 5' and 3' UTRs of msl-2 mRNA is independent of the poly(A) tail

artículo científico publicado en 1999

Two histone fold proteins, CHRAC-14 and CHRAC-16, are developmentally regulated subunits of chromatin accessibility complex (CHRAC)

artículo científico publicado en 2000

Two-step synergism between the progesterone receptor and the DNA-binding domain of nuclear factor 1 on MMTV minichromosomes

artículo científico publicado en 1999

UNR facilitates the interaction of MLE with the lncRNA roX2 during Drosophila dosage compensation

artículo científico publicado en 2014

Ubiquitylation of the acetyltransferase MOF in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2017

Wolfram Hörz 1944-2005.

artículo científico publicado en 2006

dMi-2 and ISWI chromatin remodelling factors have distinct nucleosome binding and mobilization properties

artículo científico publicado en 2000

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