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Lista de obras de Tomáš Helikar

A cell simulator platform: the cell collective

artículo científico publicado en 2013

A comprehensive, multi-scale dynamical model of ErbB receptor signal transduction in human mammary epithelial cells

artículo científico publicado en 2013

A multi-approach and multi-scale platform to model CD4+ T cells responding to infections

artículo científico publicado en 2021

Addressing <i>barriers in comprehensiveness, accessibility, reusability, interoperability and reproducibility of computational models in systems biology</i>

Bio-Logic Builder: A Non-Technical Tool for Building Dynamical, Qualitative Models ⬇️

artículo científico publicado el 17 de octubre de 2012

COMO: a pipeline for multi-omics data integration in metabolic modeling and drug discovery

artículo científico publicado en 2023

Design, Assessment, and in vivo Evaluation of a Computational Model Illustrating the Role of CAV1 in CD4(+) T-lymphocytes.

artículo científico publicado en 2014

Dynamics of influenza virus and human host interactions during infection and replication cycle

artículo científico publicado en 2012

Emergent decision-making in biological signal transduction networks

artículo científico publicado en 2008

Ergodic sets as cell phenotype of budding yeast cell cycle

artículo científico publicado en 2012

Integrating interactive computational modeling in biology curricula

artículo científico publicado en 2015

Integrative computational approach identifies drug targets in CD4<sup>+</sup> T-cell-mediated immune disorders

artículo científico publicado en 2021

Interactive learning modules with 3D printed models improve student understanding of protein structure-function relationships

artículo científico publicado en 2020

Logical Modeling and Dynamical Analysis of Cellular Networks

artículo científico publicado en 2016

Molecular phylogeny and evolutionary dynamics of influenza A nonstructural (NS) gene

artículo científico publicado en 2013

Programmatic access to logical models in the Cell Collective modeling environment via a REST API.

artículo científico publicado en 2015

SBML Level 3: an extensible format for the exchange and reuse of biological models

artículo científico publicado en 2020

SBML qualitative models: a model representation format and infrastructure to foster interactions between qualitative modelling formalisms and tools

artículo científico publicado en 2013

Sensitivity analysis of biological Boolean networks using information fusion based on nonadditive set functions

artículo científico publicado en 2014

Setting the basis of best practices and standards for curation and annotation of logical models in biology-highlights of the [BC]2 2019 CoLoMoTo/SysMod Workshop

scientific article published on 21 April 2020

The Cell Collective: toward an open and collaborative approach to systems biology.

artículo científico publicado en 2012

The Systems Biology Markup Language (SBML) Level 3 Package: Qualitative Models, Version 1, Release 1.

artículo científico

The simulation experiment description markup language (SED-ML): language specification for level 1 version 5

artículo científico publicado en 2024

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